2026-08-29 每日论文

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UrbanGround：从局部感知到真实尺度城市中的空间能动性	Tianjie Ju	2026-08-27	PDF	多模态大语言模型（MLLMs）能够解读街景，但城市行动能力取决于这些局部证据在智能体开始移动后是否仍然有用。本文探讨了当前MLLM智能体在复杂真实规模城市中，能将局部城市感知转化为可靠行动的程度。我们提出了UrbanGround，这是首个沙盒环境，使得这一问题能在基于全港三维地理空间数据构建的物理约束香港复制品中进行可测试验证。UrbanGround支持第一人称视角的闭环交互，并提供交互式地图用于导航。智能体可直接进入三维城市，从第一人称视角探索。我们的分析通过三个研究问题追踪空间问题的增长。首先，我们测试智能体在主动观察后是否能充分定位局部场景以回答空间问题。然后，我们考察当目的地变得更远且更不明确时，这种定位能力是否支持导航。最后，我们检验所得行为在路线可用性和行人运动变化时是否依然稳健。当代MLLM智能体通常在视觉识别和短距离空间推理方面展现出有用的原子能力，而方向感和行人感知移动仍不可靠。其核心失败出现在扩展探索中，局部能力无法组合成持续的目标导向行为，且错误累积而无有效纠正。我们希望UrbanGround能支持更广泛的研究，探讨当前MLLM智能体在复杂、开放式城市环境中可靠探索的极限。
CritICL：从小型语言模型失败模式中进行推理时的弱到强泛化	Yufan Wu	2026-08-27	PDF	推理时扩展的最新进展显著提升了大语言模型（LLMs）的推理性能。然而，这些方法通常依赖于重复生成或外部验证。为解决这一局限，我们引入了CritICL，一种新颖的推理时框架，它在保持高效率的同时提升推理能力。我们的关键洞察是，在同一模型家族内，LLM的失败模式在不同模型规模间展现出结构化模式。我们并未将失败视为不理想的输出，而是利用它们作为指导来源。具体而言，我们利用来自较弱模型的失败模式，并通过基于批评的上下文示例将其融入推理过程。我们提出了两种变体：CritICL-dynamic，它自适应地预测输入特定的失败模式并检索批评；以及CritICL-static，它使用全局失败模式概况提供稳定指导。实验结果表明，CritICL始终优于标准上下文学习，并在性能上与测试时扩展方法相当或更优，同时所需生成次数和令牌成本显著降低。代码可在 https://github.com/umwyf/CRITICL 获取。
WikiSkill：将智能体经验编译为持久知识以促进技能演化	Liyan Tang	2026-08-27	PDF	Agent技能包将专业知识和流程封装为可复用资源，以扩展AI代理能力。近期工作从代理经验中自动发现此类技能，使代理能够通过交互逐步适应。然而，指导技能发展的洞察通常分散在优化历史中，限制了其在迭代中的系统性复用。我们引入WikiSkill，一个将代理技能与持久知识库（wiki）共同演化的框架。在高层面上，WikiSkill分离原始执行经验、积累知识和可执行技能，同时持续将经验整合到wiki中，后续技能更新可在此基础上构建。在多种基准和模型中，WikiSkill持续优于最先进的技能演化方法，并在大多数模型-基准设置中优于无技能基线。我们发现技能演化补充了模型扩展：较大模型通常从演化技能中获益更多，而带技能的小模型可超越不带技能的显著更大模型。我们还发现演化技能在模型和模型家族间有效转移，且由其他模型演化的技能可优于自演化技能。最后，我们的消融研究确认，wiki中的持久知识积累对有效技能演化至关重要。这些结果证明了系统积累和精炼代理经验对开发可复用和可转移技能的好处。
SWE-Prime：更少的轨迹，更佳的性能	Dewu Zheng	2026-08-27	PDF	为提升大型语言模型解决真实世界软件问题的能力，先前工作聚焦于构建大规模智能体轨迹数据集，并对成功轨迹进行监督微调（SFT）。然而，任务成功并不保证监督质量高：成功轨迹可能仍包含无效、冗余或风险步骤。直接使用此类轨迹进行SFT会引入噪声监督，并促使模型模仿不良的问题解决行为。因此，我们提出SWE-Prime，一种多粒度、两阶段的SFT数据选择方法，逐步在轨迹和片段层面过滤训练数据。具体而言，第一阶段基于过程质量、结果质量和数据代表性进行轨迹级筛选，选择高质量且具代表性的成功轨迹子集。第二阶段通过将连续步骤分组为语义片段，并根据每个片段对最终解决方案的贡献、可学习性和潜在风险进行评估，进行片段级选择。在SFT期间，所有片段保留在序列中以维持上下文，而仅选中的片段参与损失计算。在SWE-Bench Pro和SWE-Bench Verified上的实验表明，使用SWE-Prime选择的10%轨迹子集进行训练，优于在完整已解决数据集上的训练，分别带来高达12.2%和24.2%的相对性能提升。
TTPO：测试时策略优化	Aozhe Wang	2026-08-27	PDF	近期一些显著的训练后方法，如强化学习（RL）和同策略自蒸馏（OPSD），已推动大型语言模型在数学推理方面取得快速进展，然而它们对真实标签的依赖阻碍了测试时训练（TTT）。用多数投票伪标签替代真实标签是一种自然的替代方案，但它较为脆弱：一次错误的投票会污染教师模型，并误导每一个令牌。我们观察到这种失败模式是不对称的：与伪标签不一致的展开结果，无论投票本身是否正确，通常都是错误的。基于这一观察，我们提出了测试时策略优化（TTPO），这是一种不对称目标，通过OPSD蒸馏一致的展开结果，并通过分组RL惩罚不一致的展开结果。令牌级选择进一步优化了这两个分支：蒸馏降低已收敛位置的权重，而RL仅惩罚高置信度的错误。即使在伪标签频繁出错的情况下，这两种更新仍能保持良好基础，并且随着模型改进，多数投票路由能提供更紧密的自我监督。在无任何标签的情况下，TTPO在五个竞赛级基准上匹配了标签监督的OPSD，将Qwen3-1.7B在TTT中的准确率从38.0%提升至45.2%，在无思考模式下提升+25.2%至+36.4%，并展现出强大的跨任务泛化能力。
从静态到动态：使用MCR-Bench对真实世界代码审查进行基准测试	Dewu Zheng	2026-08-27	PDF	在真实世界的软件开发中，代码审查通常涉及开发者和审查者之间的迭代交互以提升软件质量，这使得该过程成本高昂且耗时。尽管近期研究探索了利用大型语言模型（LLMs）进行自动化代码审查，但大多数方法将代码审查过度简化为单轮、静态的决策任务，未能捕捉真实审查场景中固有的多轮交互性质和复杂问题解决过程。为弥补这一差距，我们引入了MCR-Bench，这是首个面向真实多轮代码审查的缺陷状态感知基准。MCR-Bench涵盖五种常用编程语言，包含2,269个真实世界的多轮代码审查任务，每个任务均标注了细粒度的缺陷信息和跨轮状态标签。MCR-Bench中的每个任务配备了细粒度缺陷元数据（如描述、类型、严重程度）以及动态状态注释，捕捉缺陷在多轮过程中的完整演化轨迹。通过在MCR-Bench上对主流LLMs进行广泛实验，我们获得了若干发现。（1）整体能力有限：实验表明，主流LLMs在缺陷检测和缺陷生命周期状态跟踪方面表现出有限的整体性能，且随着交互轮数增加，性能显著下降；（2）缺陷敏感性能：LLMs的性能在不同缺陷类型和严重程度间差异显著，语义复杂或低显著性缺陷更易被遗漏；（3）潜在失败机制：我们的深入错误分析剖析了误报和漏报的不同驱动因素，揭示了跨轮时间错位和长距离记忆不足等关键弱点。
RedEvoAgent：具备经验驱动技能进化的自动红队智能体	Junjie Zhang	2026-08-27	PDF	基于LLM的智能体越来越多地被部署在产品级执行框架中，在此类环境下，越狱攻击可能触发有害的工具使用和持久状态变更，从而比单纯生成不安全文本带来更大风险。现有的自动红队方法通常依赖固定攻击，而近期的智能体攻击者则协调多种越狱工具，并通过基于轨迹的检索展现出更强的潜力。然而，这种检索可能因检索偏差和工具归因不清而重用误导性经验，且完整轨迹会增加上下文开销并降低可解释性。我们提出RedEvoAgent，一种黑盒红队智能体，它将跨案例攻击轨迹提炼为简洁、可读的攻击技能。该攻击技能通过工具效能分析和决策工具归因进行自适应演化以更新技能，并采用验证棘轮机制，仅保留能提升验证性能的更新。在多个基准、目标模型和目标执行框架上的实验表明，RedEvoAgent优于固定和智能体基线，提升了工具效率，并能跨攻击者模型和目标执行框架迁移。
基于图结构电子占据的离散流匹配实现机理反应预测	Nguyen Xuan-Vu	2026-08-27	PDF	化学反应本质上是电子空间中的变换，然而大多数机器学习方法要么通过从头生成产物分子，要么通过直接作用于分子拓扑的启发式图编辑来建模反应。我们引入了MAELLE（基于电子重排的机理编辑流匹配），该方法将反应建模为电子占据向量上的离散流匹配。具体而言，我们将反应物到产物的映射形式化为一个连续时间马尔可夫链（CTMC），该链定义在所有成键、非键和氢位点上的图结构整数电子占据空间上。为了构建中间编辑轨迹，我们利用最优传输将离散流匹配混合路径推广到离散电子重排，从而生成一系列机理上可解释的编辑步骤，而无需基元步骤注释。在USPTO-480K基准上，MAELLE与领先的反应预测模型相比取得了具有竞争力的性能。除了分布内准确性外，我们还在两种分布外设置——结构复杂性和反应类型——中评估了鲁棒性，并发现MAELLE在现有方法性能下降的情况下仍保持强劲表现。最后，由于学习到的流作用于完整的电子重分布，MAELLE自然能够恢复与已知化学一致的机理轨迹，并能预测反应的副产物。
转导语言模型的随机估计	Vésteinn Snæbjarnarson	2026-08-27	PDF	转导语言模型（TLMs）将预训练的源语言模型与功能性有限状态转换器组合，以在目标字符串上诱导出语言模型。在TLM下计算目标前缀的概率，需要对转换器映射到以该前缀开头的目标字符串的所有源字符串的源模型概率求和。这个集合可能是指数级大或无限的。先前的工作使用基于源前缀概率的计算捷径，然后通过阈值剪枝的束求和来近似所得总和。这产生了一个误差未知的下界。相反，我们无放回地重采样源前缀，并根据每个选中前缀的包含概率的倒数重新加权。我们表明，递归应用此校正可得到目标前缀概率的无偏估计器，并使我们能够估计阈值剪枝丢失的质量。我们的束求和算法扩展了保留的源前缀，并采样要保留的前缀，随着运行估计中加入更多概率质量而减少其数量。这可以节省计算量，并保证运行以概率一停止。我们在百科全书文本和DNA上评估了该方法，与有放回重采样的顺序蒙特卡洛基线进行比较。它在文本上实现了更好的计算-方差权衡，在DNA上以相同的最大粒子数实现了更低的误差。在DNA到氨基酸的转导中，相对于阈值剪枝的束求和，它将运行时间减少了几个数量级，并使长目标字符串的前缀概率估计变得可行。在已发表的阅读时间分析中，用无偏采样替换阈值剪枝，显著降低了估计的语料库意外度，但发表的结论保持不变。
Persona-执行分离：一种在执行审计下演化LLM智能体的架构模式	Yisen Xi	2026-08-27	PDF	大型语言模型（LLM）代理在受治理组织中必须让人设（指令、语气、自我呈现）自由演化，同时保持执行（有状态、经审计的工作）可追踪。单一信任域无法廉价地同时满足这两点。我们提出人设-执行分离（PES）：人设和执行位于不同信任域，通过受治理的契约桥连接。人设是单归属的，可以漂移；执行是无面孔的，且经审计。状态摘要可返回；数据主体保留在限制域内，除分级数据丢失防护（DLP）例外；身份保持连续。审批矩阵、DLP和审计强制执行跨越。PES源于三个目标——自由漂移、执行可追踪性和解耦。在LLM表征不可区分性下，任何满足所有三点的单域机制必须重新引入类型化变更对象、外部门控和稳定审计锚点：PES以更高耦合成本重建。在受监管数字员工平台中的开发/试点案例记录了一个月内的五个决策，每个都有被拒绝的替代方案。对已发布实现的机制检查发现，在人设扰动（五种模型配置）下没有执行侧重新验证，硬断言字段上没有发现人设指纹。对恢复的预分离构建的探测发现，受治理执行路径通过遗漏而非构造与人设解耦；后续接线更改可能逆转这种隔离，而PES将其变为经审计的架构规则。该模式适用于多用户部署、执行审计和预期人设变动同时成立的情况。

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危地马拉和洪都拉斯马铃薯上采集的致病疫霉种群结构	Izarra, M. L.	2026-08-29	PDF	致病疫霉（Phytophthora infestans）作为晚疫病的病原体，仍是全球马铃薯生产的主要限制因素。在中美洲，尤其是危地马拉和洪都拉斯，尽管该病原体具有经济重要性且依赖进口种薯，但其种群结构信息却十分有限。本研究利用微卫星标记、线粒体单倍型和交配型分析，对危地马拉和洪都拉斯马铃薯田中的致病疫霉种群结构进行了表征。鉴定出四个SSR定义的群体，其中三个对应于先前描述的克隆谱系EU13A2、NI_1和US8A2，另一个推定群体被命名为CeA（中美洲）。EU13A2谱系首次在欧洲报道，随后在亚洲出现，其检出表明该谱系已在中美洲建立。所有成功表征的分离株均表现出Ia线粒体单倍型，表明尽管核SSR变异显著，线粒体多样性却有限。AMOVA分析显示洪都拉斯与危地马拉之间存在显著遗传分化，占总SSR变异的24.43%（p = 0.022）。在分析的种群中检测到显著的连锁不平衡。研究区域内遗传上不同的致病疫霉群体的存在，凸显了监测中美洲跨境病原体移动的重要性。
棕色脂肪细胞脂肪酸合酶（FASN）缺陷可保护小鼠免受酒精诱导的血浆甘油三酯升高和肝脏脂肪变性	Parupalli, P.	2026-08-29	PDF	过量饮酒常与高甘油三酯血症相关，这种状况会增加严重并发症的风险，包括急性胰腺炎和心血管疾病。极低密度脂蛋白（VLDL）受体（VLDLR）促进外周组织摄取含apoE的VLDL颗粒，并在维持血浆甘油三酯（TG）稳态中发挥重要作用。棕色脂肪组织（BAT）是主要的代谢器官，在产热激活期间有助于循环脂质清除。据报道，冷诱导的产热作用会上调BAT中的VLDLR表达，并通过VLDL摄取降低血浆TG。然而，BAT VLDLR介导的VLDL摄取是否调节酒精诱导的高甘油三酯血症仍未知。在此，我们生成了BAT特异性脂肪酸合酶（FASN）敲除小鼠（FASNBKO），并将其置于狂饮和慢性急性酒精喂养模式中。我们发现，BAT FASN缺乏增强了产热功能并促进了VLDL摄取，从而减轻了酒精诱导的血浆TG升高。与这些发现一致，在分化的棕色脂肪细胞（bADs）中，通过TVB3664处理进行FASN的药理学抑制，在对照和酒精暴露条件下均增加了产热基因表达和VLDL摄取。此外，FASNBKO小鼠免受酒精诱导的肝脂肪变性，这伴随着肝脏AMP活化蛋白激酶（AMPK）激活增加和β-氧化增强。进一步地，FASNBKO小鼠在BAT中表现出上调的FGF21 mRNA表达和升高的循环FGF21水平。类似地，TVB3664处理的分化bADs显示出更高的FGF21表达和培养基中FGF21含量增加。综合这些发现，确定了棕色脂肪细胞FASN在酒精暴露期间调节产热功能和TG稳态中的重要作用，并提示增强BAT中的产热脂质利用可能代表一种潜在的治疗策略，以减轻酒精相关的血浆TG升高和肝脏脂肪积累。
通过物候、生长和产量性状评估旱稻品种的干旱恢复力及高产品种筛选	Hussain, T.	2026-08-29	PDF	干旱胁迫是陆稻生产中限制产量的主要因素，因为水分可用性变化很大。理解并评估陆稻对干旱胁迫的响应对于提高抗逆性和产量稳定性至关重要。本研究在非胁迫、中度胁迫和高度胁迫条件下评估了16个陆稻品种的表现。通过以70%和50%田间持水量（FC）灌溉陆稻引入干旱胁迫，而非胁迫处理则以100% FC灌溉。在中度和高度胁迫条件下，还在侧生阶段停止灌溉六天，通过诱导胁迫间隔观察暂时萎蔫。在三个实验重复中收集了陆稻农艺性状的数据。结果表明，陆稻品种的表现受胁迫条件显著影响，非胁迫条件下表现最佳。短生育期和长生育期品种在中度胁迫下的产量损失范围分别为35-60%和24-62%，而在高度胁迫下分别为43-78%和52-73%。总体而言，品种Dawk Kha、Khao/Sai和Dawk Pa-yawm在胁迫条件下表现出较高的稳定性，因此这些长生育期品种可用于在不同农业气候条件和不可预测的天气模式下获得更好的产量。短生育期品种Ma-led-nai-fai和长生育期品种Goo Meung Lung及Bow Leb Nahag可用于获取更高分蘖和穗承载能力的性状。矮秆品种如Jao Daeng、Sahm Deuan和Ma-led-nai-fai可用于育种矮秆新品种以克服倒伏问题。GMP、STI、MPRO、MHAR在非胁迫、中度胁迫和高度胁迫条件下与籽粒产量呈强显著正相关，表明这些指数适合作为抗旱性选择标准。
转录起始位点异质性干扰了uORFs的景观与功能解读	Wu, H.-Y. L.	2026-08-29	PDF	上游开放阅读框（uORFs）在多种真核生物中超过一半的基因中被预测存在，且常降低翻译效率和mRNA稳定性。这引发了一个悖论：尽管uORFs对基因表达有抑制作用，为何它们在真核基因组中仍如此普遍？以拟南芥为模型，我们展示了转录起始位点（TSS）的选择控制着稳态RNA库中uORFs的包含及其抑制效应。我们发现，TSS选择影响超过90%含uORF基因的uORF包含情况，并选择性地从许多转录本中排除uORFs。尽管生物信息学分析预测55%的拟南芥基因含有uORFs，但仅有不到10%的表达转录本包含它们。这种TSS过滤并非随机：uORFs被排除的基因富集于管家功能，而保留uORFs的基因则与调控角色相关。我们表明，忽视TSS异质性可能掩盖长度依赖的uORF抑制效应，并导致对uORF活性的误解。重要的是，主要从天然mRNA中排除的uORFs，当人工置于报告基因上游时仍能抑制翻译，这表明表观上的uORF抑制性可能并不反映其在天然转录本中的活性。我们的发现确立了TSS选择作为uORF介导翻译控制的主要决定因素。由于TSS异质性在植物和动物基因中广泛存在，我们警告忽视TSS异质性可能混淆对mRNA 5'前导区调控元件的分析。因此，我们建议在研究uORFs及其他mRNA调控元件时考虑TSS使用情况；否则，结论可能反映的是调控潜力而非天然转录本中的调控活性。
可靠的运动序列中，神经元参与的灵活性	Peng, J.	2026-08-29	PDF	学习性运动序列的可靠执行构成了一项挑战：它们需要可重复的神经元活动模式以保持行为一致性，同时又必须保留灵活性，以便根据内部状态进行调节并适应外部突发事件。斑胸草雀作为一种鸣禽，为研究这一问题提供了理想系统，因为它们的发声高度刻板，并与HVC（一个参与鸣唱产生的关键核团）中精确时间锁定的爆发相关联。然而，它们的鸣唱并非不可改变或完全固定，因为它们在社交互动中可以被调节，并且在脑损伤后能够恢复。在此，我们使用自由鸣唱期间的HVC投射神经元钙成像，追踪从数秒到数周内同一鸣唱重复演绎中的活动。我们首先确认，鸣唱锁定的钙事件时间在数天内保持稳定。令人惊讶的是，并非每个神经元在每次鸣唱演绎中都表现出钙事件。我们将这种事件的存在称为参与。这种参与是一种稳定的、神经元特异性的属性，它随话语内鸣唱的过去和未来演绎而变化，并依赖于社交环境。脑损伤后的鸣唱恢复和学习期间的精细化进一步揭示，神经参与可以改变，而序列时间保持稳定。这些结果表明，稳定的运动序列不必依赖于相同细胞集合的刚性重复激活，而是可以在保持时间顺序的同时，灵活选择哪些神经元贡献于行为的每次表达。这为学习性运动控制中的可靠性-灵活性权衡提供了一种细胞层面的解决方案。
下行体感和运动皮层输入塑造中脑的听觉处理	Kim, G.	2026-08-29	PDF	整合多感觉和行为信息对于感觉知觉至关重要。在听觉系统中，多感觉和行为影响在皮层下结构的早期阶段即已出现。来自非听觉皮层区域的下行投射具备传递此类信号的有利位置，然而它们如何塑造皮层下听觉处理仍知之甚少。在此，我们研究了从初级躯体感觉皮层（S1）和初级运动皮层（M1）到下丘（IC）的皮层-下丘投射，下丘是听觉中脑中的一个主要整合中枢。我们发现，S1和M1中与躯干和肢体相关的区域形成了突出的单突触投射至下丘，并且这些投射的光遗传学激活能强烈驱动下丘活动。值得注意的是，相当数量的皮层响应神经元对声音无反应。在声音响应神经元中，并行的皮层刺激增强了声音诱发反应，而先于声音起始的皮层激活则抑制了这些反应。此外，皮层响应的下丘神经元以及深层S1和M1神经元均表现出与运动相关的调节和运动起始前的预期活动，表明这些下行通路向下丘传递运动相关信号。综合来看，我们的发现识别出一个下行感觉运动回路，该回路将身体和运动相关信息与听觉中脑中的听觉处理整合在一起。
染色质重塑蛋白CHD4调控发育中耳蜗螺旋神经节神经元的轴突导向	Kim, J.	2026-08-29	PDF	螺旋神经节神经元（SGNs）是将听觉信息从耳蜗传递至中枢神经系统的初级传入神经元。人类染色质域解旋酶DNA结合蛋白4（CHD4）的致病性变异导致Sifrim-Hitz-Weiss（SIHIWES）综合征，这是一种与听力损失相关的神经发育障碍。在此，我们鉴定了CHD4（一种ATP依赖性染色质重塑因子）在发育中的SGNs中的表达，并进一步在小鼠中删除Chd4。听觉脑干记录显示，SGNs中缺乏Chd4的动物表现出听力损失。SGNs分为I型和II型神经元，它们表现出不同的外周神经支配模式。值得注意的是，CHD4的缺失导致I型神经元异常成束和II型纤维的路径寻找不当。为揭示潜在分子机制，我们绘制了永生化多能听泡祖细胞（iMOP）衍生神经元中CHD4的全基因组染色质占据图谱。CHD4靶基因的基因本体分析揭示了调控轴突导向、轴突成束和肝配蛋白受体信号传导的通路。在体内，我们观察到Chd4条件敲除耳蜗的SGNs中特定Eph/ephrin基因上调。综合这些结果，表明CHD4在发育过程中调节顺式调控元件处的染色质，以抑制一组轴突导向分子。多种导向信号的协调调控对于建立耳蜗中精确的神经回路至关重要。我们的发现揭示了CHD4依赖性表观遗传调控在神经回路布线中的关键作用，并为SGNs再生策略提供了转化框架。
超对齐揭示猕猴个体化精细电影fMRI模式中的共享信息	Zhang, Y.	2026-08-29	PDF	对12只恒河猴在观看电影期间采集的fMRI模式进行响应超对齐（RHA），揭示了尽管存在特异性的功能拓扑结构，仍共享表征空间。RHA显著提高了枕叶、颞叶和前额叶皮层中电影响应时间序列的受试者间相关性，并实现了高精度的受试者间电影时间点解码及个体特异性功能拓扑的估计。这些结果表明，非人灵长类共享高维、高容量的表征空间，这些空间编码于个体特异性的细粒度功能拓扑中。
早期生命阶段暴露于野火烟雾与长期系统性免疫重塑及表观遗传重编程相关	Layman, C. E.	2026-08-29	PDF	野火烟雾是一个日益严重的全球公共卫生威胁，每年使包括儿童在内的数百万人暴露于危险空气污染中。尽管野火烟雾毒物已与一系列不良健康结果（包括免疫失调）相关联，但现实世界中儿童期野火烟雾暴露对健康和发育的长期后果仍大多未知。为研究生命早期暴露对免疫健康的持续影响，我们利用了一组恒河猴队列，这些猴子在2020年俄勒冈州劳动节野火期间，于婴儿期经历了连续九天的危险野火烟雾暴露。通过整合离体免疫刺激、多重细胞因子谱分析、单细胞转录组学和全基因组DNA甲基化谱分析，我们在分子和功能水平上识别了持续的免疫学后果。我们发现，出生后前三个月内的一次严重暴露与先天免疫反应的持续变化相关，包括对细菌内毒素的促炎细胞因子反应降低，以及髓系细胞中细微但一致的转录变化，尤其在雄性中更为明显。野火烟雾暴露还与B细胞和T/NK细胞比例的变化相关，且在T/NK细胞区室内，暴露动物表现出细胞毒性细胞的扩增。与此一致，CD8+ T细胞显示出广泛的转录重塑，并向更分化的效应状态转变，其中在最小年龄暴露的动物中观察到最大程度的分化。全基因组DNA甲基化谱分析识别了与烟雾相关的甲基化变化，这些变化与表观遗传衰老加速一致，以及影响氧化应激反应、先天免疫、T细胞分化和造血作用的持续表观遗传改变。这些发现表明，在关键发育窗口期内的一次严重野火烟雾暴露与暴露后持续数年的广泛免疫和表观遗传重塑相关，为生命早期野火烟雾暴露的长期生物学后果提供了新见解。
对分枝杆菌噬菌体D29宿主裂解的遗传解析揭示两个裂解调控因子和一个新型脂蛋白，它们调控裂解事件并定位于基因组的不同区域	Pollenz, R. S.	2026-08-29	PDF	噬菌体D29感染耻垢分枝杆菌mc2 155，并具有一个非典型裂解盒，该裂解盒编码两种内溶素蛋白（Lysin A和Lysin B）以及一个双跨膜结构域（TMD）蛋白LysA2a，其与F1簇噬菌体LysF1a相似。一个1TMD LysF1b同源物LysA2b由位于卷尺蛋白下游的一个基因编码。LysA2两种蛋白的串联外源表达对耻垢分枝杆菌具有细胞毒性。删除lysA2a产生的噬菌体具有裂解能力，但触发延迟10分钟且噬菌斑大小减少30%。删除lysA2b导致严重裂解缺陷，表现为噬菌斑大小减少70%、裂解时间延迟和爆发量降低。同时删除两个lysA2基因产生的噬菌体仍可存活，并表现出类似lysF1b缺失的裂解表型。用lysF1b基因对缺失lysA2b的噬菌体进行遗传互补，可完全恢复裂解表型，但将触发时间改变为F1簇噬菌体的特征。能量毒剂可促使所有缺失lysA2基因的噬菌体提前裂解。从缺乏lysA2b基因的噬菌体中分离的裂解恢复突变体（LRM）恢复野生型噬菌斑大小，其点突变定位于lysA2a基因的TMD1或C末端区域。从缺乏两个lysA2基因的噬菌体中分离的LRM表现出提前裂解，其突变均定位于一种新型脂蛋白（基因64）的C31残基。删除基因64不改变野生型D29的裂解表型，也不能挽救任何lysA2突变体的裂解缺陷。适应性/竞争实验表明，失去lysA2基因会带来显著的竞争性适应度代价。这些发现支持一种裂解调控网络模型，其中2TMD蛋白保持非活性状态，直到被其同源1TMD裂解调节因子激活，而脂蛋白具有可能增强裂解效率的辅助功能。

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温度与饮食结构：来自中国的证据	Chen, X.	2026-08-29	PDF	气候变化如何影响人类福祉，不仅取决于食物系统生产了什么，还取决于食物上桌后个体实际摄入了什么。利用中国健康与营养调查中三天饮食回顾数据，并将其与同一三天窗口内的县级天气相匹配，我们发现，短期偏离舒适温度会提高脂肪占能量摄入的比例，以及脂肪占比超过世界卫生组织阈值的饮食概率。高温和寒冷通过相反的边际途径提高脂肪占比，尽管寒冷条件下的反应较小且估计精度较低。在高温下，总能量、碳水化合物和蛋白质摄入量下降，而绝对脂肪摄入量无明显变化，因此脂肪占比上升是一种构成效应，即便总热量在减少。在寒冷条件下，绝对脂肪摄入量似乎比其他宏量营养素增加更多，这是一种摄入效应。因此，宏量营养素分解至关重要：总热量的相同变动掩盖了饮食质量的非常不同的变动，这是基于热量或指数的指标无法区分的。这些反应与生理性食欲调节一致，尽管我们的设计无法将生理机制与其他需求侧渠道分开。对农村和低收入家庭的影响更大，但对拥有制冷和取暖设备的家庭影响较小。我们将个体饮食视为健康资本的 behavioral 输入，通过这一输入，温度和适应能力塑造了营养不平等。
新生儿胎粪揭示南亚城市出生队列中微塑料与金属的同步暴露	Zaman, I.	2026-08-29	PDF	新生儿胎便为评估产前或出生时环境污染物暴露提供了一种非侵入性生物样本。尽管微塑料和金属已分别在人类生物样本中被报道，但对胎便中颗粒物与金属联合暴露的综合评估仍较为稀缺，尤其是在南亚地区。在本横断面生物监测研究中，对孟加拉国达卡30名剖宫产新生儿胎便进行了分析，使用体视显微镜、扫描电子显微镜和拉曼光谱法检测微塑料的丰度、形态和聚合物组成，并使用电感耦合等离子体质谱法检测十五种金属。对部分哺乳期母亲的母乳进行了分析，作为母体暴露背景的补充。在所有可分析的胎便样本（n=28）中均检测到微塑料，中位负荷为149颗粒/克湿重，以聚对苯二甲酸乙二醇酯碎片和尼龙纤维为主。所有十五种金属也在所有可分析的胎便样本中被检测到，其中铅和铬的中位浓度分别为1.18和3.92微克/克干重。经多重检验校正后，微塑料与金属之间无显著关联，提示其暴露或累积途径部分不同。本研究显示，新生儿胎便能够捕获南亚城市出生队列中微塑料和金属的联合暴露。该研究提供了该地区基于胎便的微塑料与金属联合暴露综合评估之一，并强调胎便作为早期生命生物监测的实用基质。
多生物样本库皮肤松弛症全基因组关联研究揭示参与皮肤生物学与形态发生的基因	Rajueni, K.	2026-08-29	PDF	目的本研究旨在通过全基因组关联研究（GWAS），在三个大型队列中检测与眼睑皮肤松弛症相关的遗传因素。设计GWAS荟萃分析参与者共纳入13,200例眼睑皮肤松弛症病例和962,513例对照组。方法对FinnGen、爱沙尼亚生物样本库和英国生物样本库的数据进行了眼睑皮肤松弛症的GWAS荟萃分析。我们还进行了共定位分析、全表型组关联研究和发病年龄分析，并评估了与多种疾病和性状的遗传相关性。主要结局指标识别与眼睑皮肤松弛症相关的遗传变异。结果我们在全基因组显著性水平上识别出18个与眼睑皮肤松弛症相关的位点，其中16个为新发现。这些位点中的大多数包含参与皮肤生物学和皮肤疾病的基因，如编码弹性蛋白（ELN）和潜在转化生长因子-β结合蛋白1（LTBP1）的基因。全表型组关联研究揭示了与形态相关性状的既往关联，而遗传相关性分析强调了多种遗传相关性，尤其是与吸烟和疼痛的相关性。结论我们检测到18个与眼睑皮肤松弛症相关的遗传位点，对这些位点进行了详细表征，并证明了它们在皮肤生物学及相关过程中的相关性。这些发现为眼睑皮肤松弛症的遗传背景提供了新信息，并为进一步研究奠定了坚实基础。