2026-05-17 每日论文
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| EntityBench：面向实体一致的长距离多镜头视频生成 | Ruozhen He | 2026-05-14 | 多镜头视频生成将单镜头生成扩展为连贯的视觉叙事，但在长序列中保持角色、物体和场景的一致性仍是挑战。现有评估通常使用独立生成的提示集，实体覆盖有限且一致性指标简单，导致标准化比较困难。我们提出EntityBench基准，包含源自真实叙事媒体的140个片段（2,491个镜头），并配有显式的逐镜头实体调度表，可同时追踪角色、物体和场景，覆盖简单/中等/困难三个难度层级，最多包含50个镜头、13个跨镜头角色、8个跨镜头场景、22个跨镜头物体，以及跨度达48个镜头的重现间隔。该基准配备三支柱评估套件，分别解构镜头内质量、提示遵循对齐度和跨镜头一致性，并设置保真度门控机制，仅将准确的实体外观纳入跨镜头评分。作为基线方法，我们提出EntityMem记忆增强生成系统，在生成开始前将已验证的逐实体视觉参考存储于持久记忆库中。实验表明，现有方法中跨镜头实体一致性随重现距离增加而急剧下降，而显式逐实体记忆在评估方法中实现了最高的角色保真度（Cohen's d = +2.33）和存在率。代码与数据见https://github.com/Catherine-R-He/EntityBench/。 | |
| ATLAS：主动还是潜在视觉推理？一个词足以兼顾两者 | Ziyu Guo | 2026-05-14 | 视觉推理常与中间视觉状态交织，已成为该领域一个有前景的方向。一种直接的方法是在推理过程中通过统一模型直接生成图像，但这在计算上成本高昂且架构上难以实现。近期的替代方案包括通过代码或工具调用的智能体推理，以及使用可学习隐藏嵌入的潜在推理。然而，智能体方法因外部执行而产生上下文切换延迟，而潜在方法缺乏任务泛化能力且难以通过自回归并行化进行训练。为结合两者优势并缓解其局限性，我们提出ATLAS框架，其中单个离散的"词"（称为功能标记）同时充当智能体操作和潜在视觉推理单元。每个功能标记与内化的视觉操作相关联，但无需视觉监督，且作为分词器词汇表中的标准标记，可通过下一标记预测生成。这种设计避免了冗长的中间视觉内容生成，同时保持与标准可扩展SFT和RL训练的兼容性，无需架构或方法修改。为进一步解决RL中功能标记的稀疏性问题，我们引入潜在锚定GRPO（LA-GRPO），通过静态加权辅助目标锚定功能标记来稳定训练，提供更强的梯度更新。大量实验和分析表明，ATLAS在具有挑战性的基准测试中实现了卓越性能，同时保持清晰的可解释性。我们希望ATLAS能为未来视觉推理研究提供新范式。 | |
| RefDecoder：通过条件视频解码增强视觉生成 | Xiang Fan | 2026-05-14 | 视频生成支撑着大量下游应用。然而，当前事实上的标准——即潜在扩散模型——通常采用强条件去噪网络，但其解码器往往保持无条件状态。我们观察到这种架构不对称性会导致细节显著丢失以及与输入图像不一致。为解决这一问题，我们认为解码器需要同等条件化以保持结构完整性。我们提出RefDecoder，一种参考条件化视频VAE解码器，通过参考注意力机制将高保真参考图像信号直接注入解码过程。具体而言，轻量级图像编码器将参考帧映射为富含细节的高维令牌，这些令牌在每个解码器上采样阶段与去噪后的视频潜在令牌协同处理。我们在多个不同解码器骨干网络（如Wan 2.1和VideoVAE+）上展示了持续改进，在Inter4K、WebVid和Large Motion重建基准测试中，相较于无条件基线实现了最高+2.1dB的PSNR提升。值得注意的是，RefDecoder可直接替换现有视频生成系统而无需额外微调，我们在VBench I2V基准测试中报告了主体一致性、背景一致性和整体质量分数的全面改进。除I2V外，RefDecoder还能良好泛化至风格迁移和视频编辑优化等广泛的视觉生成任务。 | |
| VGGT-$Ω$ | Jianyuan Wang | 2026-05-14 | 近期前馈重建模型（如VGGT）已被证明与传统基于优化的重建方法具有竞争力，同时还能提供对其他任务有用的几何感知特征。本文表明，这些模型的质量随模型和数据规模呈可预测的扩展趋势。为此我们提出VGGT-Ω，该模型在静态和动态场景的重建精度、效率及能力方面均有显著提升。为支持该模型在空前规模下训练，我们引入了提升训练效率的架构改进、支持动态场景的高质量数据标注流程，以及自监督学习协议。通过采用带多任务监督的单一密集预测头并移除高分辨率卷积层，我们简化了VGGT架构。同时使用寄存器将场景信息聚合为紧凑表征，并引入寄存器注意力机制——将帧间信息交换限制在这些寄存器中，部分替代全局注意力。通过这种方式，VGGT-Ω在训练时仅需前代模型约30%的GPU内存，使我们能使用比先前工作多15倍的监督数据进行训练，并利用海量无标注视频数据。VGGT-Ω在多个基准测试中实现了静态和动态场景重建的优异结果，例如在Sintel数据集上将相机估计精度较此前最佳结果提升77%。我们还证明，学习到的寄存器可改进视觉-语言-动作模型并支持与语言的对齐，这表明重建可作为空间理解领域强大且可扩展的代理任务。项目页面：http://vggt-omega.github.io/ | |
| 在图像生成中为球形流匹配对齐潜在几何结构 | Tuna Han Salih Meral | 2026-05-14 | 用于图像生成的潜在流匹配通常沿线性路径将高斯噪声传输到变分自编码器的潜在表示。然而，两个端点的分布都集中在薄球壳上，即使预处理对齐了半径，欧几里得弦仍会偏离这些球壳。通过将每个潜在令牌分解为径向分量和角度分量，我们利用分量交换探针实验证明：解码后的感知和语义内容主要由方向承载，半径的贡献微乎其微。因此，我们将数据潜在表示投影到固定令牌半径上，将高斯噪声的径向投影作为球面先验，在冻结编码器的条件下微调解码器，并用球面线性插值替代线性插值。由此产生的测地路径在每个时间步都保持在球面上，其速度目标在构造上纯属角度变化。在匹配训练条件下，该方法在不同图像分词器上持续改善类别条件ImageNet-256的FID指标，不改变扩散架构，且无需辅助编码器或表征对齐目标。 | |
| RAVEN：基于一致性模型GRPO的实时自回归视频外推 | Yanzuo Lu | 2026-05-14 | 因果自回归视频扩散模型通过从已生成内容外推未来块，支持实时流式生成。从高保真双向教师模型中蒸馏此类生成器可得到具有竞争力的少步模型，但训练期间遇到的历史分布与推理时产生的历史分布之间存在持续差距，限制了长时域生成质量。我们提出实时自回归视频外推网络（RAVEN），这是一种训练时测试框架，将每次自展开重新打包成交替的干净历史端点序列与含噪去噪状态序列。该公式使训练注意力与推理时外推对齐，并允许下游块损失监督未来预测所依赖的历史表示。我们进一步提出一致性模型组相对策略优化（CM-GRPO），将一致性采样步骤重构为条件高斯转移，并直接对此核应用在线强化学习（RL），避免了先前流模型RL公式中采用的欧拉-丸山辅助过程。实验表明，RAVEN在质量、语义和动态程度评估上均超越近期因果视频蒸馏基线，且CM-GRPO与RAVEN结合时能提供进一步增益。 | |
| FutureSim：重放世界事件以评估自适应智能体 | Shashwat Goel | 2026-05-14 | AI智能体正越来越多地被部署在动态、开放式的环境中，这要求它们能够随着新信息的到来实时适应。为了在实际应用场景中有效衡量这一能力，我们提出构建基于真实世界事件时间顺序回放的仿真系统。我们开发了FutureSim系统，在该系统中，智能体在与其知识截止日期之后的世界事件进行交互时，需要预测这些事件——系统会按时间顺序回放真实新闻文章，并在模拟周期内逐步揭示问题答案。我们对前沿智能体在其原生框架下进行评测，测试它们预测2026年1月至3月三个月内世界事件的能力。FutureSim揭示了这些智能体能力的显著差异：表现最佳的智能体准确率仅为25%，而许多智能体的Brier技能得分甚至低于完全不进行预测的基准。通过细致的消融实验，我们展示了FutureSim如何为研究长期测试时自适应、搜索、记忆及不确定性推理等新兴研究方向提供现实场景。总体而言，我们希望这一基准设计能够为衡量AI在真实世界长时间跨度开放式适应能力方面的进展铺平道路。 | |
| Articraft：一种用于可扩展铰接式3D资产生成的智能体系统 | Matt Zhou | 2026-05-14 | 学习理解可动3D物体的一个瓶颈是缺乏大规模且多样化的数据集。本文提出利用大型语言模型来弥补这一差距，并大规模生成可动资产。我们将生成可动3D资产的问题简化为编写构建该资产的程序。随后引入了一个新的智能体系统Articraft，能够自动编写此类程序。我们设计了一套程序化接口和工具框架，帮助大型语言模型高效完成这一任务。该模型需针对一个领域特定SDK编写代码，用于定义部件、组合几何体、指定关节，并编写测试以验证生成的资产。工具框架为模型提供受限的工作空间和接口，验证生成的资产，并返回结构化反馈。通过这种方式，大型语言模型无需关注编写URDF文件或管理复杂软件环境等细节。实验表明，该方法生成的可动资产质量优于当前最先进的可动资产生成器和通用编码智能体。利用Articraft，我们构建了Articraft-10K数据集——涵盖245个类别、超过1万个可动资产的精选数据集，并展示了其在可动资产模型训练、机器人仿真及虚拟现实等下游应用中的实用价值。 | |
| VGGT-Edit：基于残差场预测的前馈式原生三维场景编辑 | Kaixin Zhu | 2026-05-14 | 高质量三维场景重建近期在可泛化前馈架构方面取得进展，使得单次前向传播即可生成复杂环境。然而，尽管这些模型在静态场景感知中表现优异，其响应动态人类指令的能力仍十分有限，这限制了它们在交互式应用中的使用。现有编辑方法通常依赖二维提升策略，即独立编辑各视角图像后再将其提升回三维空间。这种间接流程常导致纹理模糊和几何不一致，因为二维编辑器缺乏跨视角保持结构所需的空间感知能力。为解决这些局限，我们提出VGGT-Edit——一种用于文本条件原生三维场景编辑的前馈框架。VGGT-Edit引入深度同步文本注入，将语义引导与骨干网络的空间位姿对齐，确保指令的稳定锚定。该语义信号随后由残差变换头处理，直接预测三维几何位移以形变场景，同时保持背景稳定性。为确保高保真结果，我们采用包含几何精度与跨视角一致性约束的多项目标函数监督该框架。我们还构建了DeltaScene数据集——通过自动化流程生成的大规模数据集，并采用三维一致性过滤确保真值质量。实验表明，VGGT-Edit显著优于二维提升基线方法，产生更锐利的物体细节、更强的多视角一致性，并实现近乎即时的推理速度。 | |
| 几何一致性定量视频世界模型评估 | Jiaxin Wu | 2026-05-14 | 生成式视频模型正越来越多地被研究作为隐式世界模型，但评估它们是否产生物理上合理的3D结构和运动仍具挑战性。现有大多数视频评估流程严重依赖人工判断或学习型评分器，这些方法具有主观性且对几何失效的诊断能力较弱。我们提出PDI-Bench（透视畸变指数），这是一个用于审计生成视频几何一致性的量化框架。给定生成片段，我们通过分割和点跟踪（如SAM 2、MegaSaM和CoTracker3）获取以对象为中心的观测，通过单目重建将其提升至3D世界空间坐标，并计算一组投影几何残差以捕捉三个失效维度：尺度-深度对齐、3D运动一致性和3D结构刚性。为支持系统性评估，我们构建了PDI-Dataset，涵盖旨在挑战这些几何约束的多样化场景。在现有最优视频生成器上，PDI揭示了常见感知指标无法捕捉的几何特异性失效模式，并为迈向物理基础视频生成和物理世界模型提供了诊断信号。我们的代码和数据集可在https://pdi-bench.github.io/获取。 |
bioRxiv
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| mTOR通过一种类似胆汁酸的激素机制以及DHS-26/DHRS1来调控寿命 | Schilling, K. | 2026-05-17 | mTOR通路是细胞代谢和生长的核心调控因子，其下调可延长不同物种的寿命。在秀丽隐杆线虫中，mTOR通过非细胞自主方式影响机体寿命，但其潜在机制尚不明确。本研究发现，TORC1调控因子raga-1/RRAGA的缺失会促进胆汁酸样激素——达法酸（DA）的生成，并通过依赖DA激素生物合成基因及其同源核激素受体DAF-12（哺乳动物法尼醇X受体FXR的同源物）延长寿命。通过功能基因组筛选，我们鉴定出进化保守的短链脱氢酶DHS-26/DHRS1是mTOR-类固醇轴中此前未知的下游调控靶点和效应因子，对机体寿命至关重要。线虫DHS-26主要在管关联神经元中高表达，这些细胞对生长发育至关重要，提示存在神经内分泌机制。小鼠DHRS1同样受mTOR信号和核受体FXR调控，表明mTOR-DHS-26/DHRS1轴具有进化保守性。这些发现表明，mTOR信号通过调控胆汁酸样激素的可利用性和核受体信号转导，系统性影响后生动物寿命。 | |
| 一种工程化耐盐嵌合T7 RNA聚合酶，用于通过简单批量转录实现高产率、低免疫原性的RNA合成 | Fang, Y. | 2026-05-17 | mRNA疗法的快速发展对体外转录（IVT）产品的质量和可扩展性提出了严格要求。然而，在T7 RNA聚合酶（T7 RNAP）介导的转录过程中，双链RNA副产物和3'末端异质性的积累会强烈触发有害的先天免疫反应并降低翻译效率。现有的酶工程策略常难以平衡盐耐受性、体积产率和产物纯度之间的权衡。本研究报道了一种新型盐耐受型T7 RNAP工程策略，通过将优化的突变型聚合酶与多种DNA结合域（如Sso7d、MC1）融合，系统开发了一系列嵌合T7 RNAP突变体，旨在高离子强度条件下增强催化活性和模板选择性，同时抑制RNA依赖性RNA聚合酶活性。我们的先导嵌合突变体在高达270 mM NaCl浓度下展现出卓越的盐耐受性和持续合成能力。值得注意的是，这些突变体将双链RNA形成量显著降低至0.001%以下，同时大幅提升转录本完整性和3'均一性，从而促进线性mRNA和环状RNA的优异翻译效率。关键的是，这种增强的盐耐受性无需以RNA产量为代价，为下游工艺优化提供了更广泛的灵活性。在酶促环状RNA合成系统中，这些突变体实现了非补料分批配置（初始rNTP浓度各15 mM），使产量提升50%，并达到前所未有的15 mg/mL滴度。本研究为工业化生产高浓度、低免疫原性RNA提供了兼顾质量与产量的强效酶学解决方案。 | |
| 从液滴中学习：人工智能引导的液体活检特征在癌症研究中的整合 | Andueza, M. | 2026-05-17 | 癌症是全球性的重大健康问题，发病率和死亡率持续上升。早期检测、肿瘤特征描述和疾病监测对于及时有效的治疗至关重要，最终可降低死亡率。液体活检作为一种有价值的检测工具，能够通过非侵入性方法检测体液中的肿瘤源性生物标志物，并已展现出转化潜力。为提高生物标志物灵敏度，高通量测序平台可产生海量数据。人工智能在实现大规模复杂数据整合中发挥关键作用。本文旨在评估基于人工智能的整合研究在液体活检领域的现状，并提供方法学指导。首先，我们通过PubMed检索发现，整合液体活检特征的研究文献较少，尤其是应用人工智能的研究。采用后一种方法时，明确研究目标至关重要，这将指导后续方法学环节，包括研究设计、患者选择标准、样本量、液体活检特征性质及待收集的元数据。具体而言，我们提出数据预处理策略与工具，包括标准化、批次校正、异常值及缺失数据处理。此外，我们推荐多种机器学习/深度学习方法进行特征选择以确保模型稳健性，并强调对选定模型进行严格内部和外部验证的重要性。评估临床实用性和可解释性常被忽视，但对实际应用至关重要。总之，我们为液体活检科学界提供基于人工智能的方法学指导，以弥合两个领域间的鸿沟，并增强液体活检特征的整合分析。 | |
| 关于监管安全性测试中无动物替代方法（NAM）预验证的报告：InfiniteLungDT，一种用于预测材料引发的慢性中性粒细胞性肺部炎症的体外学习数字孪生模型 | Urbancic, I. | 2026-05-17 | 迄今为止，尚无符合监管机构要求的无动物替代方法，用于预测慢性炎症、提供相关剂量反应、发病时间及炎症持续时间。本研究证明，通过体外学习构建的中性粒细胞性肺部炎症数字孪生模型（InFiniteLungDT），可在无需了解可吸入材料固有特性的情况下，通过测量其体外诱导的早期生物学效应动态，获取与慢性中性粒细胞性肺部炎症相关的监管关键信息。我们为每种具有体内暴露数据的材料构建了数字孪生模型，主要基于包含49种不同纳米材料的体内滴注数据集和7组符合OECD TG 412标准的体内吸入数据集（总计约3094次单次小鼠暴露和364次大鼠暴露，以及约775/225只未暴露小鼠/大鼠对照组），用于预测浓度依赖性时间演变的肺部中性粒细胞浸润，并评估终点指标及最低观察到有害作用水平（LOAEL）的可重复性与准确性（预测能力）。结果显示，滴注暴露的预测准确率为93%，吸入暴露为84%。考虑到结果交付时间不足一周，这证明从急性到慢性条件下吸入材料效应的评估，其速度和成本可比参考动物研究快数个数量级且更为经济。 | |
| 重组腺病毒血清型4在小鼠模型中的转基因表达动力学与复制潜力及其作为单纯疱疹病毒疫苗的应用 | Vostal, A. C. | 2026-05-17 | 人腺病毒血清型4型（Ad4）被用作一种具有复制能力的口服疫苗，可安全有效地预防美军人员中的Ad4呼吸道疾病。重组Ad4候选疫苗可在仓鼠、非人灵长类动物和人类中诱导针对呼吸道病毒的黏膜和全身免疫应答。尽管鉴于小鼠模型中存在大量免疫学工具，评估Ad4候选疫苗在该模型中的应用极具价值，但此前因担忧病毒无法在小鼠体内复制而受到限制。本研究构建了表达荧光素酶（Ad4-Luc）或2型单纯疱疹病毒糖蛋白D（Ad4-gD2）的重组Ad4载体，以鉴定转基因表达动力学、Ad4载体复制情况、HSV-2免疫应答及对HSV-2感染的保护效果。在BALB/c小鼠和人源化小鼠经鼻接种后7小时至20天内，均观察到局部荧光素酶活性。后续接种Ad4-Luc时，BALB/c小鼠的荧光素酶表达降低，而人源化小鼠仍保持强表达，提示野生型小鼠产生了针对载体的免疫应答。在接种Ad4前用西多福韦处理的BALB/c小鼠肺组织中，Ad4 DNA含量降低但荧光素酶活性未受影响，表明Ad4在肺组织中发生了低水平复制。经鼻接种Ad4-gD2的小鼠血清中产生了HSV-2中和抗体，且在HSV-2阴道攻毒后，疾病评分降低、存活率提高、病毒脱落减少。总体而言，BALB/c小鼠模型对Ad4黏膜感染呈半允许状态，但其转基因表达水平足以支持基于Ad4的候选疫苗研究。 | |
| 在一项种族限制的观察性队列中，HPV共感染负担、阴道微生物群重组及宿主背景与宫颈癌前病变风险相关。 | Tossas, K. Y. | 2026-05-17 | 背景：高危型人乳头瘤病毒（HPV）感染是宫颈癌发生的必要条件，但仅凭HPV检测无法区分一过性感染与具有最高进展风险的病变。本研究通过整合基于L1基因的HPV分型、16S rRNA阴道微生物群分析及关联临床元数据，在阴道微生物组健康项目（VaMHP）的黑人/非裔美国人和白人分析队列中，评估HPV载量、阴道微生物群结构及宿主背景变量是否共同表征宫颈上皮内瘤变3级（CIN3）。结果：在1181名参与者中，75人患有CIN3。CIN3与HPV阳性相关（55/75, 73.3% vs 431/1106, 39.0%；比值比[OR] 4.31, 95% CI 2.55-7.29；Fisher精确检验p = 7.9×10^-9），且在HPV阳性参与者中与多重HPV感染相关（35/55, 63.6% vs 176/431, 40.8%；OR 2.54, 95% CI 1.42-4.54；p = 0.0022）。CIN3阳性样本中的HPV群落表现出更高的香农多样性、更高的菌株丰富度、更高的均匀度及显著的β多样性分离。在阴道微生物群分析中，α多样性在CIN3状态间无差异，但群落组成存在差异，且经多重检验校正后，卷曲乳杆菌是唯一在CIN3中减少的分类群。种族、年龄和甲硝唑暴露是宿主因素网络中的核心节点。在预测模型中，整合元数据、HPV和阴道微生物群特征的完整集成模型（auROC = 0.745）优于HPV+阴道微生物群模型（auROC = 0.670）和仅HPV模型（auROC = 0.440）。结论：本队列中CIN3与病毒载量、阴道群落结构及宿主社会临床背景的协同变化相关。结果支持结构-功能解释，即卷曲乳杆菌主导状态的丧失和失调相关群落的富集，定义了更易导致HPV持续感染和癌前病变的宿主-微生物组环境。这些发现超越了描述性组学，表明微生物组和宿主背景特征为仅HPV模型提供了非冗余的判别信号。 | |
| 将抗病毒药物重新用于肺炎克雷伯菌去定植的新途径 | Anderson, N. | 2026-05-17 | 肺炎克雷伯菌（Kp）是一种常见的抗生素耐药病原体，定植于胃肠道并可扩散至外周部位，引发包括菌血症、尿路感染和肺炎在内的多种感染。肠道Kp定植是后续感染的风险因素，因为定植菌株通常与感染分离株相对应。因此，在Kp扩散前通过去定植策略靶向定植部位的病原体，是降低感染风险的有效方法。本研究评估了现有药物（其抗菌活性此前未被充分表征）作为Kp去定植候选药物的再利用潜力。为此，我们筛选了一个抗病毒化合物库，检测其对Kp的活性。我们鉴定并验证了六种此前未被报道具有抗Kp活性的化合物。随后，我们针对一组临床Kp菌株筛选了这些化合物的子集，发现其活性具有菌株特异性，且特异性程度因化合物而异。最后，我们在模拟人类肠道环境的条件下测试了这些化合物的活性，发现其活性依赖于生物环境。综上，这些发现支持进一步研究抗病毒药物作为Kp肠道去定植疗法的潜力。 | |
| KaryoScope：面向泛基因组时代的快速、免比对序列注释工具 | Ranallo-Benavidez, T. R. | 2026-05-17 | 泛基因组时代正在以当前注释方法无法匹敌的速度产生长读长测序数据和完整基因组组装。现有工具均为单一特征类别（重复序列、着丝粒卫星或基因）而构建，在基因组变异最丰富且蕴含临床重要变异的区域——着丝粒、亚端粒及近端着丝粒短臂——恰恰表现不佳。我们在此提出KaryoScope，一种无需比对的单次通量碱基分辨率注释方法，可在标准工作站上数分钟内完成任意特征类别的组装注释。应用于人类泛基因组参考联盟第二版组装时，KaryoScope将SST1大卫星鉴定为罗伯逊易位融合点的重复序列，首次实现与面肩肱型肌营养不良症相关的4q和10q亚端粒区D4Z4大卫星结构多样性的泛基因组普查，并揭示此前未表征的着丝粒结构多态性，包括经荧光原位杂交验证的染色体特异性卫星丢失及兆碱基级重排。该工具附带人类基因组预构建KaryoScope数据库，亦可为任何参考基因组或注释源构建额外数据库。这些能力共同将基因组中最易变异的区域纳入比较、临床及泛基因组规模分析的范畴。KaryoScope可通过https://github.com/barthel-lab/KaryoScope获取。 | |
| 对尿液微生物组的比较分析识别出潜在的益生菌 | Anand, R. | 2026-05-17 | 尿路感染是全球最常见的细菌感染，其治疗正日益受到抗菌药物耐药性的挑战。益生菌通过竞争性排斥尿路病原体并产生免疫调节剂增强宿主免疫力，为缓解抗菌药物耐药性提供了有前景的途径。尽管具有潜力，但在发现尿路保护性益生菌菌株与优化用于泌尿道递送的制剂之间仍存在关键空白。本研究分析了尿路感染患者和健康个体的尿液微生物组，以识别用于预防和管理尿路感染的潜在益生菌候选菌株。采用标准化流程处理公开的泌尿道16S rRNA扩增子测序数据，包括序列质量评估、分类学分配和微生物功能预测。比较分析显示，尿路感染患者与健康对照组的微生物组成存在显著变化。鉴定出的优势菌门包括酸杆菌门、放线菌门、拟杆菌门、弯曲菌门、蓝藻门、厚壁菌门、梭杆菌门、微菌门、变形菌门和互养菌门。整体差异丰度分析表明，大肠杆菌是尿路感染相关的主要菌种，而卷曲乳杆菌在健康样本中富集。此外，预测性功能分析显示，与有益微生物相关的代谢途径在健康组中富集。总体而言，本研究强调了不同尿液微生物组特征与感染状态的关联，支持卷曲乳杆菌作为预防和控制尿路感染最具前景的益生菌。 | |
| 青春期前卵巢切除术改变了雌性小鼠背内侧纹状体间接通路神经元兴奋性及探索/利用平衡 | Hall, C. D. | 2026-05-17 | 决策回路在不同生命阶段（如幼年、青少年或成年）以及雌性生殖周期的较短时间尺度上受到调节，以适应不断变化的环境和生理需求。卵巢激素信号可能通过调节参与适应性决策的神经回路来促进这种灵活性。本研究探讨了青春期前卵巢切除术（pOVX）如何影响成年雌性在气味引导的多选逆转任务中的表现。在逆转学习过程中，与假手术对照组相比，pOVX雌性表现出独特的错误模式。为表征决策策略，我们拟合了一个强化学习模型来分析初始辨别阶段和逆转阶段中逐次试验的行为。假手术雌性在逆转阶段表现出逆温度参数（β）显著增加，这与转向更倾向于高价值选项的剥削性选择策略一致。相比之下，pOVX雌性未表现出阶段依赖性的β增加，提示它们继续采用更具探索性的策略。为识别该行为表型的神经相关性，我们在背内侧纹状体（DMS）——一个参与调节动作选择及探索/剥削选择策略的区域——进行了全细胞膜片钳记录。与假手术组和未处理对照组相比，pOVX雌性中表达多巴胺受体2型（D2R）的间接通路棘状投射神经元（iSPN）的内在兴奋性显著升高。最后，为验证D2R(+) iSPN兴奋性增加是否可能因果性地导致探索性逆转表型，我们在完整雌性小鼠中通过化学遗传学方法激活了DMS D2R(+)神经元。该操作增加了逆转学习过程中的探索性选择，重现了pOVX后观察到的模式。综合这些数据表明，青春期状态可能通过长期调节DMS iSPN内在兴奋性，影响雌性在辨别阶段与逆转阶段之间调整决策策略的能力。 |
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| MAS1受体失调及人类血管性认知障碍中代偿状态失败的转录组学证据 | Kimra, C. H. | 2026-05-17 | 背景：血管性认知障碍与痴呆（VCID）被认为源于弥散性神经血管单元（NVU）功能障碍而非局灶性病理改变，但人类VCID脑组织的转录组结构及其内源性反向调节信号状态尚未完全明确。明确保护性通路是否被激活及其失效原因，对于寻找尚无获批疗法的疾病治疗靶点至关重要。方法：对顶叶上回组织（GEO:GSE303449；n=40；19例VCID，21例对照；模型：年龄标准化+性别+疾病状态）进行批量RNA测序，通过差异基因表达分析（DESeq2 v1.38.0）和预排序基因集富集分析（fgsea v1.24.0），随后进行Spearman相关性分析、PI3K-Akt通路水平分析、前沿基因分解及单核RNA测序内皮细胞特征分析（GEO:GSE282111）。结果：在51,962个检测基因中，VCID与对照组间无单个基因达到FDR<0.05的差异表达阈值。但基因集富集分析识别出8个显著富集的上调通路程序（均FDR<0.05），涵盖炎症、应激反应、细胞骨架和凋亡信号，符合弥散性网络水平失调而非单基因主导效应的特征。MAS1/ANG1-7相关信号基因集（54个基因）是唯一达到显著性的反向调节通路（NES=1.381，FDR=0.0127）。MAS1受体表达与NF-kB通路驱动因子TLR4（Spearman rho=-0.804）和IKBKB（Spearman rho=-0.797；两者FDR=4.73×10^-9）呈强负相关（绝对值Spearman rho≥0.64）。此外，MAS1下游效应因子与内皮激活标志物之间的12项相关性中有9项呈FDR显著正相关，表明下游保护性效应程序是由炎症应激共同激活而非受体直接调控。单核RNA测序支持VCID脑组织中MAS1通路富集信号的内皮特异性。PI3K-Akt前沿基因分解显示炎症与血管保护分支在基因水平上存在96%的非重叠性。结论：人类VCID脑组织在缺乏显著单基因效应的情况下呈现协调的通路水平失调，符合弥散性转录网络应激驱动的疾病特征。MAS1/ANG1-7血管保护轴在转录水平被激活且富集于内皮，但受体表达与炎症信号呈负相关，而下游效应因子仍保持转录活性。这种模式提示VCID顶叶上回存在代偿失败状态。该结构符合转录启动但受体受限的保护程序特征。这些发现表明，恢复MAS1受体水平输入至已启动的下游程序的治疗策略，可能成为VCID的可行治疗方向，有待实验验证。 | |
| 女性在计划阴道分娩或剖腹产时，需要哪些结局信息来支持知情选择？——一项共识研究。 | Ekong, A. | 2026-05-17 | 背景 分娩方式决策辅助工具（DA）可提供信息并支持讨论计划阴道分娩或剖宫产相关的潜在风险与收益（结局）。证据表明，DA能提升患者知识水平、减少决策冲突、最小化决策支持中的不一致性（尤其在产科环境中），并促进知情决策。尽管有这些益处，目前常规产前护理中仍缺乏针对分娩方式的DA。本文概述了我们为达成共识所遵循的流程，即确定计划分娩方式应纳入DA的结局指标。 方法 结局识别与筛选分三个阶段进行。第一阶段从系统综述、NICE剖宫产指南及利益相关者定性访谈中汇总出长列表结局。第二阶段通过两轮德尔菲调查优化该列表，优先考虑被认为重要的结局。若≥70%的全体参与者或70%的女性/伴侣将其评为至关重要（7-9分），且<15%评为不重要（1-3分），则视为达成共识。第三阶段通过两次利益相关者共识会议最终确定结局列表。 结果 共识别出71项结局。经过两轮德尔菲调查及共识会议后，54项结局被评为至关重要。17项结局在调查与共识阶段均持续被评为非关键，即每个阶段≥70%的参与者认为其对于孕期女性知情决策并非必需。其中8项因NICE建议被保留，最终排除9项结局。最终列表包含44项母体结局和18项儿童结局。母体结局涉及分娩辅助、分娩时并发症、恢复期问题、盆底功能、心理问题、性功能及未来妊娠。儿童结局涉及发病与死亡、疾病、肥胖、认知发育及身体发育问题。 结论 共确定62项优先结局，拟纳入计划分娩方式DA。 | |
| 未被遗忘：患者对基因变异重分类的体验 | Gupta, P. | 2026-05-17 | 目的：在临床基因组学中，基因变异重分类日益常见，但关于患者在常规临床护理中如何经历重新联系与变异重分类的有限数据尚存。方法：我们对20名在常规临床基因检测后收到变异重分类结果的成年患者进行了半结构化定性访谈。访谈内容涵盖情绪反应、沟通体验及基因检测的感知价值。采用模板分析法（一种主题分析法）对数据进行分析。结果：研究识别出三大主题。参与者指出需改进重分类结果的沟通方式，尤其在时机、形式及情境化方面（主题1）。重分类经历也塑造了患者对基因检测价值的认知，多数参与者认为尽管检测具有动态性，但仍有价值（主题2）。此外，许多参与者将重分类视为个性化持续护理的体现，从而增强了对基因检测及生物医学研究的信任（主题3）。参与者普遍倾向于被告知重分类结果（无论类型），但重分类方向会影响情绪反应及偏好的沟通方式。从不明确意义变异降级为良性或可能良性的结果被参与者广泛视为有意义。结论：变异重分类被体验为个性化持续护理的信号。及时、情境化、以患者为中心的重新联系实践可减少不确定性、强化信任，并帮助患者避免被遗忘感。 | |
| PCV20疫苗在英国儿童中的预期健康与经济影响：一项动态传播模型研究 | Warren, S. | 2026-05-17 | 背景 尽管英国长期使用儿童肺炎球菌结合疫苗（PCV）产生了显著影响，但肺炎球菌疾病负担仍然较重，主要由非PCV13血清型驱动。更高价疫苗（如20价PCV，即PCV20）可能带来额外的公共卫生和经济效益，但其在当代英国环境中的价值尚未利用近期数据得到充分评估。 方法 我们利用COVID-19后的英国流行病学数据（2001年至2023年）更新了一个年龄结构动态传播模型，比较儿童PCV20与PCV13及PCV15的效果。在10年时间范围内，我们评估了成本效益和需接种人数（NNV），涵盖侵袭性和非侵袭性疾病病例、死亡、成本、质量调整生命年以及增量成本效益比。PCV20在1+1和2+1接种方案下进行评估；PCV13和PCV15在1+1方案下评估。情景分析探讨了关键不确定性因素。 结果 PCV20预计可预防更多病例和死亡，优于PCV13或PCV15，这得益于其更广泛的血清型覆盖和间接效应。与低价疫苗相比，PCV20的两种接种方案均具有优势或节省成本，且NNV更低。PCV20较高的疫苗接种成本被下游医疗支出的减少所抵消。 结论 在英国实施儿童PCV20接种可带来显著健康收益，同时提高经济效率，支持及时采用该疫苗。 | |
| 真实世界电子健康记录衍生的连续治疗线无进展生存期，为转移性乳腺癌风险分层提供依据 | Zhao, X. | 2026-05-17 | 基于指南的转移性治疗线数（mLoTs）建议，尤其是二线及后续治疗，由于后期治疗疗效量化存在挑战，相对较为匮乏。因此，能够捕捉治疗与疾病进展之间相互作用的可扩展真实世界证据尤为宝贵——随着治疗方案日益个体化、混杂因素加剧，且进展很少作为结构化电子健康记录终点被记录。我们提出一个框架，用于：（i）利用放射学锚定的进展证据，从纵向电子健康记录中重建临床一致的转移性治疗线数；（ii）在高度异质性队列中，基于治疗线起始的多模态快照生成个体化无进展生存期（PFS）估计。在2,881名患者贡献的8,791条转移性治疗线数中，所选模型在2年时间范围内展现出良好区分度（Antolini's C = 0.681 ± 0.006；1年累积/动态AUC = 0.824 ± 0.008）。预测风险分层在不同治疗线数和肿瘤亚型中紧密追踪Kaplan-Meier趋势，支持各亚组间校准度相似的风险分层。模型预测主要依赖于近期转移负荷和肿瘤标志物等临床合理信号，对监测频率或亚型标签依赖性有限，且对模态消融具有稳健性。综上，该框架支持转移性治疗线数PFS模式的可扩展证据生成，并提供可解释、广泛校准的预后判断，以指导异质性转移性临床实践中的风险评估和护理规划。 | |
| 在真实世界健康数据集中检测模拟病原体释放 | Moss, R. | 2026-05-17 | 电子疾病综合征监测系统（EDSyS）旨在在单个临床医生或医疗机构识别出健康监测数据中的危险病原体及其他异常信号之前，提前检测到这些事件。然而，EDSyS系统主要使用模拟健康监测数据进行评估，这些数据未必能捕捉真实世界健康数据的丰富性和复杂性。我们对现有EDSyS系统EpiDefend进行了更新和扩展，该系统结合了集成预测和递归贝叶斯估计，采用支持人口统计和空间结构的粒子滤波框架。我们模拟了多种传染性和非传染性病原体的释放，并将由此产生的病例注入真实世界健康数据集。在此，我们评估了EpiDefend检测这些模拟释放的敏感性和特异性，并根据临床医生和微生物学家提供的病原体特异性临床检测时间估计，测量了检测时间。结果表明，对于临床诊断可能具有挑战性的疾病，如Q热（贝氏柯克斯体）和兔热病（土拉弗朗西斯菌），EpiDefend能够可靠地提前于临床检测时间。相比之下，对于可相对快速临床诊断的病原体，如吸入性炭疽和肺鼠疫，要超越临床检测时间极为困难。我们的研究结果表明，EpiDefend可能能够在临床诊断确认前，以低误报率可靠地检测某些病原体的真实世界引入或释放，这将是EDSyS系统的一项里程碑式成就。 | |
| 中老年人群中总免疫球蛋白E及吸入性过敏原特异性免疫球蛋白E的决定因素 | Al Fatly, M. | 2026-05-17 | 背景：在慢性病负担日益加重的老年人群中，免疫球蛋白E（IgE）的决定因素仍不明确。明确IgE的决定因素有助于改善其在过敏及IgE相关疾病评估中的临床解读。目的：探究年龄、性别、吸烟、饮酒、体重指数（BMI）、糖皮质激素使用及季节对总IgE（tIgE）和吸入性过敏原特异性IgE（sIgE）的潜在影响。方法：基于鹿特丹研究数据，采用多变量线性回归分析tIgE和sIgE的决定因素，并通过线性混合模型评估纵向变化及糖皮质激素的影响。结果：共纳入8769名参与者，其中478人具有重复IgE测量值。年龄与tIgE呈U型关系，与sIgE呈L型关系（均p<0.001）。女性tIgE水平较低（OR [95%CI]：0.69 [0.65-0.74]），而当前吸烟者（1.34 [1.23-1.46]）、高BMI（1.01 [1.01-1.02]）、局部糖皮质激素使用者（1.27 [1.07-1.50]）及吸入性糖皮质激素使用者（1.93 [1.64-2.26]）的tIgE水平较高。女性（0.96 [0.92-1.00]）、既往吸烟者（0.87 [0.83-0.91]）及当前吸烟者（0.72 [0.68-0.76]）的sIgE水平较低，而局部糖皮质激素使用者（1.20 [1.07-1.35]）及吸入性糖皮质激素使用者（1.20 [1.07-1.35]）的sIgE水平较高。随时间推移，tIgE和sIgE水平下降（p<0.001），但使用糖皮质激素后未出现显著变化。结论：本研究确定了年龄、性别、吸烟、BMI、季节及局部和吸入性糖皮质激素为tIgE和sIgE的决定因素。纳入这些因素可改善IgE在过敏及IgE相关疾病诊断和管理中的临床解读。未来研究应探讨这些因素如何影响老年人群中IgE与慢性疾病的关系。 | |
| 女性循环与脂肪组织中羟基脂肪酸脂肪酸酯的谱图：肥胖程度、年龄及急性运动的影响 | Rossmeislova, L. | 2026-05-17 | 目的 羟基脂肪酸脂肪酸酯（FAHFAs）是由脂肪组织（AT）主要产生的抗糖尿病和抗炎脂质因子。由于运动训练可提高FAHFA水平，我们研究了急性运动（AE）及模拟运动条件对循环和脂肪细胞中FAHFA水平的影响。方法 临床试验（NCT05572905）纳入60名女性，按BMI（瘦型 vs. 肥胖型）和年龄（年轻 vs. 年长）分组，并结合人脂肪细胞体外实验。在基线特征评估（身体成分、最大摄氧量、胰岛素敏感性、脂肪组织/血浆FAHFAs）后，受试者交叉接受AE和对照干预，并重复采血进行FAHFA分析。结果 在脂肪组织中，瘦型和年长女性的FAHFA水平分别高于肥胖型和年轻女性；年长女性还表现出向13/12碳支链FAHFAs水平升高的转变。所有组的循环FAHFA水平相似，且与胰岛素敏感性、最大摄氧量或脂肪组织FAHFA水平无正相关。尽管AE增加了循环游离脂肪酸（FFA），但血浆FAHFAs在AE和对照干预后均下降。在脂肪细胞中，FAHFAs不受糖皮质激素影响，但在脂解作用下随脂肪酸氧化（FAO）相关基因表达增加而升高。然而，阻断线粒体FAO可部分模拟脂解效应，而过氧化物酶体抑制虽单独无作用，却协同增强了脂解驱动的FAHFA生成。结论 虽然肥胖和衰老调节脂肪组织中的FAHFA水平，但循环水平保持稳定且不受AE影响，这质疑了皮下脂肪组织作为其全身主要来源的观点。体外实验中，FAHFA合成受高FFA可用性驱动，但受竞争性过氧化物酶体FAO的限制。 | |
| 美国成年人购买有机食品与高血压之间的关联：NHANES 2007-2010 | Choi, C. | 2026-05-17 | 背景：由于人们认为有机食品对健康有益，对其需求日益增长。目前关于有机食品健康影响的证据有限。目的：评估在美国具有全国代表性的群体中，以购买有机食品作为有机食品消费替代指标与高血压之间的关联。方法：这是一项横断面研究，纳入9173名年龄≥18岁、且来自2007-2010年美国国家健康与营养调查中同时具备有机食品购买和高血压数据的参与者。有机食品购买情况及频率通过调查问卷获取。高血压定义为收缩压≥130毫米汞柱/舒张压≥80毫米汞柱、当前正在服用降压药物或自我报告诊断为高血压。我们采用多变量逻辑回归，结合样本权重并调整潜在混杂因素，评估有机食品购买与高血压状态之间的关联（调整后比值比[aOR]及95%置信区间[CI]）。结果：研究发现，与不购买有机食品者相比，购买有机食品者患高血压的几率降低11%（aOR=0.89，95% CI：0.75-1.06）。在所有有机食品购买频率类别中，均观察到较低的高血压几率：与从未购买有机食品者相比，偶尔购买者降低13%（aOR=0.87，95% CI：0.67-1.14），有时购买者降低9%（aOR=0.91，95% CI：0.71-1.16），经常或主要购买者降低17%（aOR=0.83，95% CI：0.55-1.27）。结论：我们的研究结果表明，作为有机食品消费替代指标的有机食品购买行为，可能与较低的高血压几率相关。这些发现可能反映了有机食品消费的真实益处（包括较低的农药残留和更高的营养成分），或反映了注重健康、身体健康且受教育程度较高个体的健康寻求行为。 | |
| 2000年至2019年169个国家儿童阑尾炎死亡率的地理聚类与空间溢出效应分析 | yang, z. | 2026-05-17 | 背景 阑尾炎是一种易于治疗的外科急症，但在资源有限地区仍是儿童可预防性死亡的原因之一。尽管近期研究已记录了全球儿童阑尾炎的疾病负担，但尚无研究系统性地分析其地理聚集性或空间溢出效应。了解高死亡率国家是否存在地理聚集现象，以及邻国之间是否相互影响预后，对于制定区域性外科能力建设策略至关重要。 方法 我们对2000年至2019年间169个国家0-14岁儿童的阑尾炎病死率进行了空间分析。数据来源于《2023年全球疾病负担研究》和世界银行数据库。我们计算了全局莫兰指数以评估空间自相关性，使用Getis-Ord Gi*识别局部热点区域，并拟合空间滞后模型和空间误差回归模型，在调整人均GDP、医生密度和基本卫生设施覆盖率后量化空间溢出效应。 结果 全局莫兰指数在2000年为0.621（p < 0.001），2010年为0.621（p < 0.001），2019年为0.592（p < 0.001），表明存在强烈且持续的空间聚集性。99%置信水平下的热点区域持续集中在撒哈拉以南非洲和南亚部分地区，地理分布在过去二十年间变化甚微。空间误差模型拟合效果最佳（AIC = 212.6），其空间误差系数（λ）为0.663（p < 0.001），表明约66%的残差变异可由未观测到的区域因素解释。在最终模型中，较高的人均GDP（β = -0.497，p < 0.001）和较高的医生密度（β = -0.568，p < 0.001）与较低的病死率独立相关，而基本卫生设施覆盖率无显著关联（p = 0.284）。 结论 儿童阑尾炎病死率表现出强烈且持续的地理聚集性。显著的空间溢出效应表明，区域性外科能力建设的协调可能比各国独立投资更为有效。应优先关注撒哈拉以南非洲和南亚的热点国家，重点在于扩大外科医疗队伍，而非仅依赖广泛的经济增长。 |