2026-08-18 每日论文
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| 不要丢掉“接力棒”：通过智能子任务探索与转换感知记忆实现长时程机器人操作 | Bingxin Xu | 2026-08-17 | 长程机器人操控将多个接触丰富的技能串联成一个多阶段任务。视觉-语言-动作（VLA）模型日益擅长掌握单个技能，但链条仍然失败：错误累积超出策略的纠正能力，且一个子任务默默限制下一个子任务。一种有前景的方案冻结VLA，并让LLM代理负责：它以语言规划，用解析原语在自由空间中移动，仅在接触丰富段调用VLA，并将适应写入语言记忆。应用于长程任务时，它两次失效。（1）能力来自测试时的全任务探索，其成本在阶段上呈乘法增长：若一个阶段需T次试验，K阶段任务约需T^K次，且失败不揭示由哪个阶段引起。（2）它没有转换表示：VLA原语携带退出条件但无进入条件，因此子任务可能以继任者无法使用的形式成功。我们提出BATON。针对（1），BATON将子任务作为探索单元：每个子任务在廉价的短程场景中探索，其解决方案存入记忆；长程轨迹随后由这些解决方案组合而成，而非整体发现。成本变为加法（T*K），且每次失败归因于单一阶段。针对（2），BATON为探索配备转换感知记忆。子任务内，验证代理管理调用转换：仅在腕部视图确认场景就绪后调用VLA。子任务间，交接转换恢复被前驱残留干扰的进入状态，前瞻转换选择继任者可继承结果的策略。不更新参数。在长程基准RoboMemArena上，BATON将任务成功率提升11.6%，累计成功率提升14.9%，优于SoTA。 | |
| 基于Q的变分逆强化学习 | Ondrej Bajgar | 2026-08-17 | 开发安全且有益的AI，要求系统能够依据人类偏好进行学习和行动。然而，手工明确指定这些偏好往往不可行。逆向强化学习（IRL）通过从专家行为中推断偏好（以奖励函数表示）来解决这一挑战。我们引入了基于Q的变分逆向强化学习（QVIRL），这是一种新颖的贝叶斯IRL方法，主要通过学习最优Q值上的变分分布，从专家示范中恢复奖励的后验分布。与以往方法不同，QVIRL结合了可扩展性与不确定性量化，这对于安全关键应用以及主动学习至关重要。我们在多种任务中展示了QVIRL在学徒学习中的强大性能，包括网格世界、月球着陆器、高速公路环境以及两款ATARI游戏，既使用静态专家数据也采用主动学习。这是首个从原始像素观测中训练贝叶斯IRL的方法。 | |
| 像素空间文生图扩散模型训练的实证研究 | Dengyang Jiang | 2026-08-17 | 本文探讨了生成建模中一个日益重要的课题：像素空间扩散模型。尽管已有大量研究涉足此领域，但多数聚焦于小规模或类别条件设定。因此，一种能够匹敌或超越成熟潜空间模型的像素空间训练实用方案仍难以实现。通过全面的实证研究，我们首先观察到，直接在像素空间进行大规模预训练比在潜空间收敛速度显著更慢。这一发现促使我们提出一种从潜空间到像素空间的策略，该策略在潜空间高效获取生成先验，并在后训练阶段过渡至像素空间。随后，我们系统研究了控制这一过渡的关键设计选择，包括权重初始化、数据组成、预测目标、解码器架构及噪声调度，并确定了一种实用方案，使所得像素空间模型能够匹敌或超越其潜空间对应模型，同时实现3.18至4.75倍的端到端推理加速。我们希望这些发现能为未来像素空间生成研究提供有价值的实证见解和实用指导。 | |
| 超越屏幕的评估：资源受限创业者对AI生成商业计划的集体评估 | Qi Zhao | 2026-08-17 | 创业者越来越多地使用ChatGPT等终端生成式AI技术来处理高风险的文档，如贷款申请和商业计划书，其中AI生成的错误——错误的价格、虚构的产品——可能影响贷款或融资结果。当前支持AI生成文本评估的方法假设单一用户独自在屏幕上评估输出。这对资源受限的创业者来说尤其具有挑战性，因为他们的数字和AI技能差异很大。在这项早期阶段的工作中，我们探索如何将评估改为在小组环境中组织并作为集体活动完成。我们扩展了BizChat，一个AI驱动的商业规划工具，增加了一个评估模块，将每个生成的声明与创业者的原始输入相连接。我们与马里兰州的社区组织合作，将BizChat嵌入各种创业项目中，其中工作坊参与者（N=14）通过思考-配对-分享讨论评估他们的计划。初步发现表明，像声明到输入链接这样的界面脚手架为参与者提供了具体、个人化的评估基础，而小组环境则将其扩展到屏幕之外：参与者要求打印副本，使用评分标准跨计划比较，并利用同伴的知识来验证他们难以独自判断的内容。 | |
| $τ_0$-VLA：一种具有世界模型引导测试时计算的层级机器人基础模型 | Xiaowei Cai | 2026-08-17 | 长程机器人操作要求机器人既能可靠地执行单个技能，又能在扩展任务中连贯地编排这些技能。大多数分层视觉-语言-动作（VLA）模型通过单次前向传播做出每个此类决策，缺乏为困难或关键选择分配额外计算的机制。我们引入τ₀-VLA，一种分层机器人基础模型，将高层子任务生成表述为通过世界模型引导的测试时计算实现的可扩展计算推理问题。在每个推理步骤中，高层策略使用执行记忆生成一个子任务，并在必要时在提交输出前搜索替代方案。低层策略随后在多种机器人实体上执行生成的子任务。该策略在40,115小时的异构真实世界数据上训练，并采用多模态协同训练。在领域内和分布偏移设置中，分配额外的测试时计算显著提高了下一子任务预测准确性，这些增益转化为长程机器人操作任务中更高的闭环成功率。 | |
| 利用现代优化与AlphaEvolve改进矩阵乘法指数 | Emilien Dupont | 2026-08-17 | 当前关于矩阵乘法指数$ω$的最佳界限是通过激光方法的改进版本——组合损失分析获得的（Duan等人，2022；Williams等人，2024；Alman等人，2025）。在本笔记中，我们处理了这一方法核心的优化问题，并提出了若干改进。首先，我们重新表述了优化问题，使其能够在比以往更广泛的设置中求解。其次，我们利用机器学习的最新进展，为此问题设计了一种新的优化算法。最后，我们通过AlphaEvolve对所得优化算法进行了细化。我们的综合方法得出了$ω$ < 2.371177的上界，改进了此前的最佳界限2.371339。 | |
| Hit-and-Run与坐标Hit-and-Run的谱间隙 | Yunbum Kook | 2026-08-17 | 对于任意包含单位球的凸体 $\mathcal{K}\subset\mathbb{R}^{n}$，Hit-and-Run 的谱间隙为 $Ω(1/(n^2 C_{\mathsf{PI}}))$，其中 $C_{\mathsf{PI}}$ 是 $\mathcal{K}$ 上均匀分布 $π$ 的庞加莱常数。这意味着 Hit-and-Run 从任意起始分布 $π_0$（其中 $M=χ^2(π_{0}\,\ | |
| AutoSR：通过搜索研究状态实现自动符号回归 | Kejia Zhang | 2026-08-17 | 我们引入自动符号回归（AutoSR），一个全自动系统，通过搜索持续的科学调查而非孤立的方程来实例化研究空间符号回归。有限且含噪的数据往往产生数值上竞争性的表达式，这些表达式在观测范围之外暗示非常不同的行为，使得数值拟合和句法复杂度不足以衡量科学可信度。现有方法主要集中于改进表达式，但搜索通常仅保留结果公式和分数，丢失了科学记录，如动机和探针，这些信息指导下一步尝试什么。AutoSR在\textbf{研究状态}中保留此记录，将每个候选方程与其分支上发展的推理、计算证据和独立审查相结合。提议者-审查者代理在渐进加宽蒙特卡洛树搜索（PW-MCTS）下发展这些状态，该搜索在竞争调查间分配计算，而累积的研究记录最终综合成最终报告，解释主导关系及其选择依据。在两个基准套件的九个选定挑战中，AutoSR在每个案例中恢复代数等价关系，包括三个没有已发表系统恢复的cp3-bench问题和六个结构多样的LSR-Transform问题。总体而言，AutoSR将符号回归从方程级搜索扩展到自动化科学调查，使科学知识和累积证据塑造探索内容及结果方程的论证方式。 | |
| 矩形侧支亥姆霍兹谐振器降噪频率数据高效预测的分析先验框架 | Jiaming Li | 2026-08-17 | 高保真有限元模拟能够为侧支谐振器提供准确的数值预测，但生成大型模拟数据集成本高昂，且当模拟标注数据稀缺时，纯数据驱动的替代模型可能变得不可靠。本研究开发了一种解析先验学习框架，重用低成本解析模型，在有限的高保真模拟预算下提高数据效率。考虑了两条互补路径。当推理时解析模型仍可用时，将其保留为显式基线，模拟数据仅用于学习解析与模拟之间的差异。当需要自包含预测器时，首先从大量低成本评估中将解析映射蒸馏为学习先验，然后用有限的模拟数据进行校准。该框架在矩形侧支亥姆霍兹谐振器上进行了评估，使用了86个模拟标注几何体和8,998个非重叠的仅解析几何体。解析模型实现了平均绝对误差（MAE）为1.333赫兹。直接支持向量回归（SVR）达到3.375赫兹，而残差SVR将MAE降至0.426赫兹。直接多层感知器（MLP）达到1.109赫兹，而解析先验预训练将误差降至0.556赫兹（冻结先验残差适应）和0.371赫兹（全模型微调）。在20至70个模拟标注案例的训练预算范围内，解析校正和解析先验预训练均相对于直接学习持续提高了数据效率。这些结果表明，当模拟数据稀缺时，解析先验信息能显著提高高保真预测性能，显式校正和先验蒸馏满足互补的部署需求。 | |
| 基于深度学习的微流控装置中循环肿瘤细胞表型的数据高效且可解释的分类 | Serena Su | 2026-08-17 | 循环肿瘤细胞（CTC）表型的准确分类可为评估转移潜力提供有价值的信息。无标记微流控装置提供了一种流体动力学障碍路径，能将CTC的微妙生物物理特征（包括大小和可变形性）转化为独特的运动学轨迹。然而，控制这些轨迹的高度非线性流固耦合作用使得从轨迹数据推断细胞表型的逆问题在解析上难以处理。尽管深度神经网络（DNNs）已成为解决这一逆问题的强大方法，但其有效性受到轨迹数据有限性和缺乏物理可解释性的制约。为应对这些挑战，我们提出了一种可解释且数据高效的DNN框架，用于基于轨迹的CTC分类。为缓解数据稀缺问题，我们开发了子序列（SubSeq）策略，这是一种有针对性的增强方法，在训练过程中随机提取信息丰富的局部轨迹片段，以促进对局部模式的学习。我们进一步应用梯度加权类激活映射来识别驱动模型预测的轨迹特征和微流控装置的物理区域。实验结果表明，SubSeq在评估的基线和增强方法中提高了分类准确性。此外，可解释性分析表明，局部轨迹片段包含与准确分类相关的大量生物物理信息。这为SubSeq提供了合理性依据，并突显了全长轨迹的冗余性。更广泛地，所提出的框架将微流控几何结构视为细胞力学特性的物理编码器，提供了可能为未来诊断装置设计提供参考的机制性见解。 |
bioRxiv
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| 完整的原始干扰素抗病毒信号网络在文昌鱼中的存在，揭示了脊椎动物干扰素免疫的基底脊索动物起源 | Lin, J. | 2026-08-18 | 干扰素（IFN）抗病毒信号级联在脊索动物中的进化起源长期以来一直难以捉摸，因为在基础头索动物中尚未通过生化手段重建功能完整的IFN机制。本研究结合系统发育学、AlphaFold3结构预测、多组学分析以及全面的体外和体内功能实验，在现存所有脊椎动物的姐妹群——文昌鱼（Branchiostoma japonicum）中鉴定了一个完整的原始IFN网络。文昌鱼编码一对未分化的BjTBK1/IKK旁系同源物，它们形成细胞质异源二聚体，其保守的激酶结构域磷酸化位点对于下游IRF驱动的IFN激活是必需的。尽管与脊椎动物IFN的初级序列同源性极低，BjIFN1/2仍具有紧凑的螺旋核心折叠，暗示其与脊椎动物黏膜型III型IFN可能存在结构上的相似性。我们鉴定了两个原始II类细胞因子受体BjCRFB1和BjCRFB2，它们作为功能性IFN传感器发挥作用。系统发育和三级结构验证确认，这些未分化的祖先受体原型出现于脊椎动物IFN受体亚功能化之前，且它们在病毒攻击后不同的时间诱导谱与脊椎动物IFN{lambda}信号所调控的黏膜免疫监视高度相似。AlphaFold3配体-受体对接在所有测试组合中鉴定出BjIFN2和BjCRFB2为最优结合对，但所有建模复合物均产生较低的界面评分，表明祖先分子间相互作用较弱。下游信号转导依赖于两个STAT旁系同源物BjSTATa和BjSTATb，它们共同介导核心抗病毒效应基因的转录激活。保守的GTP酶BjMx作为关键的IFN刺激效应因子，抑制病毒复制并维持组织免疫稳态。综合来看，我们的结构和功能证据表明，完整的层级IFN信号装置在基础头索动物中已完全组装，早于脊椎动物的辐射分化。文昌鱼IFN级联保留了核心祖先分子特征，包括结构依赖的配体保守性和原始的弱亲和力配体-受体相互作用。本研究填补了一个长期存在的进化空白，并提供了明确的功能证据，证明IFN介导的先天免疫构成祖先脊索动物特征，而非脊椎动物特有的进化创新。同时，本研究提出假设，黏膜监视可能代表脊索动物IFN防御的祖先模式。 | |
| 模态链推理使多模态蛋白质建模与设计成为可能 | Liu, C. | 2026-08-18 | 推理已成为大语言模型的核心能力，然而在科学基础模型中如何表述推理仍不明确，因为科学知识分布在相互依赖、领域特定的表示中。在此，我们引入模态链推理，将表示组织为有序计算链，每条链调节下一条的预测或生成。基于这一原理，我们开发了ProteinReasoner，一种多模态生成式蛋白质基础模型，在共享自回归架构中顺序连接氨基酸序列、进化约束和三维结构。在零样本结构预测、逆折叠和适应性预测中，ProteinReasoner优于两种多模态蛋白质基础模型，而受控比较支持模态链的功能贡献。我们进一步将此原理扩展到预训练之外：跨连续结构状态重组链可实现多构象预测，而引入实验反馈作为额外模态则实现了无需目标特定参数更新的蛋白质优化上下文学习范式。特别是，在热稳定性和亲和力成熟评估中，该范式优于匹配的微调模型，并显示出比目标特定主动学习基线更强的平均性能。这些结果确立了模态链推理作为蛋白质科学中统一且有效的基础建模策略。更广泛地，它们为其他科学领域中跨相互依赖表示的推理提供了一条通用路径。 | |
| 紧凑型寡聚化基序启动子用于可调转录控制（COMPACT），实现哺乳动物细胞中稳健、可调及双向的基因表达 | Katzman, C. | 2026-08-18 | 来自哺乳动物和病毒基因组的天然启动子常用于驱动转基因表达。然而，它们的大小、序列和结构复杂性可能阻碍启动子活性的可预测调节，增加沉默易感性，消耗病毒载体中的宝贵空间，并增加与宿主基因组同源重组的风险。在此，我们系统比较了COMPACT与常用天然参考启动子。COMPACTs约跨越200个核苷酸，包含核心转录起始元件上游的转录因子结合位点重复序列。为在挑战性生长条件下评估COMPACT架构，我们首先实施高通量筛选，以识别在CAR-NK疗法相关应激条件下于YTS细胞中维持强效且稳健活性的概念验证型COMPACTs。在21天实验中，COMPACTs在饥饿和缺氧条件下比所有评估的天然启动子更好地保留了初始活性，且最强的COMPACT在所有条件下持续产生比CMV启动子高6-22倍的转基因表达。这些COMPACTs在其他细胞系中仍具功能性，但未一致优于天然启动子，强调了在相关背景下筛选的重要性。模块化COMPACT架构实现了启动子调节和两个转基因的双向表达。这些发现确立了COMPACTs作为天然启动子的实用替代方案，适用于细胞疗法、基因疗法和生物制造等多种应用。 | |
| 跨物种BAC转基因揭示长程调控驱动脑内催产素受体表达及社会行为的变异 | Zhang, Q. | 2026-08-18 | 尽管催产素（OXT）在脊椎动物中表现出高度保守的神经解剖学模式，但大脑中催产素受体（OXTR）的分布在不同物种间差异显著，并与物种特有的社会行为相关。为探究脑内Oxtr表达的系统发育可塑性及其社会行为后果的基因组基础，我们生成了携带包含整个草原田鼠Oxtr基因座及其侧翼基因间调控区域的细菌人工染色体（BAC）的转基因小鼠。我们建立了八个独立的“田鼠化”小鼠品系，表达草原田鼠Oxtr（pvOxtr）。引人注目的是，尽管所有转基因小鼠品系中乳腺的Oxtr表达保守，但每个品系均表现出与小鼠和草原田鼠均不同的大脑表达独特模式。结合小鼠基因组的拓扑关联结构域（TAD）分析，我们的发现表明，与Oxt不同，大脑中Oxtr表达模式涉及BAC插入片段之外的远端调控元件的贡献。相反，外周组织中Oxtr表达似乎对这些远端影响具有抗性。此外，具有不同脑Oxtr表达模式的田鼠化小鼠品系在配偶偏好和母性行为上表现出差异，提供了直接的功能证据，表明脑Oxtr表达的变异可驱动社会行为的差异。我们提出，脑Oxtr表达在转录水平上对与远端基因组元件的长程相互作用敏感，使其更易受多种调控影响。这支持一个模型，即调控灵活性促进社会行为的进化多样化，同时维持必要的外周Oxtr表达。 | |
| 鞘内抗体在多发性硬化症中与EBV BRRF2及人类抗原发生交叉反应 | Schulte-Frankenfeld, P. M. | 2026-08-18 | 鞘内抗体合成是多发性硬化（MS）的标志性特征。尽管已知MS中部分鞘内合成抗体靶向病毒抗原，但其抗原特异性谱尚未完全明确。我们结合噬菌体免疫沉淀测序（PhIP-Seq）的全蛋白质组抗体谱分析与跨区室分析（MICAR），在MS个体（n = 40）和非MS对照（n = 83）的配对脑脊液和血清样本中，以肽段分辨率研究鞘内抗体合成。虽然MS中的鞘内抗体反应呈多特异性，并包含针对多种病毒的反应性，但我们识别出一个亚群，其对EB病毒（EBV）蛋白BRRF2内先前描述的基序（BRRF2408-415）具有趋同性鞘内抗体反应。这种基序导向的反应显示出与多种中枢神经系统表达的人类抗原的交叉反应性。在独立队列中，包括n = 909名MS个体和n = 311名对照（含NMOSD和MOGAD患者），针对BRRF2408-415的血清抗体在8.36%的MS个体和0.64%的非MS对照中检测到，对应MS的比值比为14.1（95% CI: 4.4-86.04）。在MS个体中，BRRF2408-415血清阳性与鞘内IgG合成增加相关。针对BRRF2408-415的抗体与人类靶标（包括TRIM71和RTN2）的交叉反应性，通过竞争ELISA和基于细胞的实验得到证实。综合来看，这些数据定义了MS亚群中一种与EBV BRRF2相关的鞘内抗体特征，该特征具有人类靶标交叉反应性。这一特征识别出MS中一种高度特异的血清学标志物，并可能支持未来对异质性MS谱系的分层。 | |
| 抗体依赖性异型合胞体驱动COVID-19炎症与疾病进展 | Yang, Y. | 2026-08-18 | 重症COVID-19的特征是深度免疫失调和过度炎症。异常的髓系反应驱动过度炎症，但精确机制仍不明确。在此，我们证明某些刺突抗体促进单核细胞/巨噬细胞与病毒感染肺细胞之间异型合胞体的形成，导致过度的炎症细胞因子释放。这种抗体依赖性合胞体形成需要FcγRI（CD64）和ADAM10，以及刺突S2亚基的六螺旋束组装。值得注意的是，与病毒感染的上皮细胞相比，这些合胞体表现出更强烈的促炎特征。在体内，亚中和抗体浓度在SARS-CoV-2感染小鼠中放大炎症并加重疾病，而不增加病毒载量。此外，对COVID-19患者死后肺组织的单细胞RNA测序提示，单核细胞/巨噬细胞来源的合胞体是炎症细胞因子的关键细胞来源。综上，这些发现定义了一种抗体依赖性炎症增强的新机制，有助于解释重症COVID-19中的过度炎症反应，并提示针对该通路的新治疗机会。 | |
| ResLit：一个面向抗菌药物耐药性的大规模自动化文献挖掘数据库 | Skoulakis, A. | 2026-08-18 | 抗菌药物耐药性产生了大量且快速增长的文献，但目前尚无资源能在规模上提供全面、基于证据的AMR发现数据库。我们推出ResLit，这是一个自动化流程和公共数据库，用于挖掘AMR文献中的耐药基因、突变、微生物和机制。从200万条候选PubMed记录中，BioMistral-7B将摘要筛选至356,000篇相关论文；多层次检索获取了117,000篇全文，随后Qwen3-30B进行了两步提取。ResLit包含3,120个基因和13,593个突变，与CARD、ResFinder和NCBI参考基因目录交叉关联，覆盖四个证据层级。它还支持社区驱动的自动化输出和参考数据库的策展。免费访问www.reslit.info。 | |
| SAR11基因组图谱：用于海洋中最丰富细菌分支功能分析的基因组与基因目录 | Nishino, S. | 2026-08-18 | SAR11分支，又称Candidatus Pelagibacterales目，是海洋中最丰富的细菌谱系之一，在海洋生物地球化学循环中发挥核心作用。然而，许多SAR11基因的功能尚未被表征，这凸显了对一个全面、整合的目录的需求，以支持该分支内的基因组、功能和生态学分析。在此，我们介绍了SAR11基因组图谱（SAR11 Genome Atlas），这是一个以直系同源群（OG）为中心的交互式网络资源，整合了542个SAR11基因组，包括所有132个培养菌株基因组，并附带功能注释、共线性、系统发育分布、宏转录组表达和预测蛋白质结构信息。为展示其实用性，我们利用环境表达谱鉴定了与高纬度环境相关的OG，恢复了已知参与冷适应的OG，并对未表征蛋白的功能提出了假设。我们进一步分析了系统发育分布模式，以识别互斥的功能模块，包括候选的Mn/Zn稳态和磷酸盐获取替代系统，并将这些模块与不同的海洋环境相关联。这些案例研究共同表明，SAR11基因组图谱支持将环境信号与目标基因连接起来的互补分析，并利用系统发育或功能分布生成关于生态特化的假设。通过用户友好的网络界面，SAR11基因组图谱使研究人员无需专门的计算专业知识即可探索基因组、环境和结构信息。所有数据和分析输出均可在线免费访问，网址为[https://stsnsn.github.io/SAR11_Atlas/]。因此，SAR11基因组图谱提供了一个可扩展的框架，用于生成和测试将SAR11基因组变异与蛋白质功能和海洋学背景联系起来的假设，推动海洋微生物生态学和生物地球化学的进展。 | |
| 摆动尿苷tRNA写入器MnmA塑造密码子依赖性应激反应系统 | Omeoga, C. H. | 2026-08-18 | 大肠杆菌利用摆动尿苷（U34）修饰来调节密码子解码，但单个tRNA写入酶如何塑造基因表达仍不清楚。在此，我们鉴定出MnmA——tRNALys、tRNAGln和tRNAGlu的U34硫醇化酶——作为连接密码子导向翻译与调节子控制和应激反应的核心调控因子。MnmA缺失耗尽了依赖s2U的摆动修饰，阻止了香叶基（ges2U）和硒代（se2U）修饰的形成，导致生长缺陷、过氧化氢酶活性降低以及多层面基因表达失调。{triangleup}mnmA细胞表现出与RpoS和OxyR调控通路相关的广泛适应性转录重编程，同时伴随蛋白质输出受损。内源性和标签蛋白分析揭示了转录调控因子、适应性和解毒蛋白（包括RpoS、OxyR、FliA、KatE和KatG）的特异性损伤。多聚体谱分析和多聚体相关RNA测序表明，MnmA缺乏会全局性降低翻译能力，并使mRNA丰度与翻译效率脱偶联，这种效应在氧化应激下加剧。我们开发了全基因组密码子使用映射分析，识别出五个密码子定义的基因簇，其中特定簇富含Lys、Gln和Glu密码子，受MnmA缺失影响不成比例。综合这些发现，支持摆动尿苷硫醇化及下游修饰与相应密码子架构配对，以协调调节子控制器和与细菌适应性相关的应激反应网络的翻译。 | |
| Cdc42通过维持v-SNARE协调唾液腺腺泡细胞顶端膜形成与分泌颗粒成熟 | Shitara, A. | 2026-08-18 | 唾液腺上皮腺泡细胞在发育过程中建立顶端-基底极性和分泌能力，这些过程需要紧密协调的膜运输。Rho家族GTP酶Cdc42是上皮极性的关键调节因子，但很少与体内囊泡融合机制相关联。利用腺泡细胞特异性缺失Cdc42的小鼠，我们发现Cdc42缺失导致顶端表面附近小囊泡积累，水通道蛋白AQP5在这些囊泡中成簇滞留，且管腔形成缺陷。Cdc42缺陷的腺体表现出两种囊泡相关SNARE蛋白VAMP2和VAMP4的选择性减少，而VAMP8、t-SNARE和内吞标记物未改变。相应的mRNA未减少，表明Cdc42通过转录后机制维持这些v-SNARE。Cdc42缺陷的腺泡细胞还积累了浓缩空泡，这是一种未成熟的分泌颗粒形式，表明颗粒成熟受损。我们提出Cdc42通过维持这些v-SNARE协调两种不同的膜重塑过程：VAMP2支持含AQP5囊泡与顶端膜的融合，而VAMP4支持分泌颗粒成熟。这些发现将囊泡融合机制确定为Cdc42依赖性极性控制的靶点，对分泌腺疾病具有潜在意义。 |
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| 心肌应变可能反映心脏移植术后的晚期移植物损伤，而非急性排斥反应 | Taipale, M. | 2026-08-18 | 背景心脏磁共振成像（CMR）T1和T2映射能准确检测急性心脏移植排斥反应，但CMR衍生的应变成像的诊断价值仍不确定，尤其是右心室应变。将供体来源细胞游离DNA（dd-cfDNA）纳入复合参考标准的数据有限。我们评估了CMR衍生的左、右心室应变和射血分数在检测儿童和成人心脏移植受者急性排斥反应中的诊断准确性。方法对移植后1-24个月的儿童和成人心脏移植受者，以及移植后3-14年发生的五次额外急性排斥反应发作期间，进行了1.5T CMR研究的盲法分析。使用半自动后处理量化左、右心室应变和射血分数。急性排斥反应采用包含心内膜心肌活检（EMB）、临床评估和dd-cfDNA的复合参考标准定义。诊断性能通过受试者工作特征（ROC）分析得出的截断值评估。结果在58名患者的214次CMR研究中，识别出13例急性排斥反应。检测急性排斥反应的诊断性能在儿童右心室纵向应变中为中等（AUC 0.782，95% CI 0.565-0.999），而所有其他心脏功能参数在儿童和成人患者中均表现出有限的区分能力（AUC 0.536-0.739）。基于单个排斥反应指标（EMB、临床评估和dd-cfDNA）的模型也显示出较差的诊断准确性。结论CMR衍生的左、右心室应变和射血分数在独立检测急性排斥反应方面能力有限。然而，应变异常，尤其是儿童患者的RVLS，可能反映更晚期排斥反应中的下游功能效应，并可能补充T1和T2映射在评估排斥反应严重程度方面的作用。临床试验注册ClinicalTrials.gov标识符：NCT04311346 | |
| 了解社区对猪带绦虫囊尾蚴病的知识与实践：印度旁遮普省养猪户社区的基线调查结果 | Sharma, R. | 2026-08-18 | 本研究旨在评估印度旁遮普省养猪社区对猪带绦虫猪带绦虫病和囊尾蚴病的知识、态度和实践（KAP）。方法：采用包含35个问题的结构化问卷，对五个地区的719名养猪户进行了横断面调查，以评估知识、态度和实践。采用单变量逻辑回归分析确定与良好知识相关的因素。结果：总体知识水平极低（平均14.32）。仅2.8%的人达到良好知识水平，83.3%听说过猪带绦虫病，而仅5.7%听说过囊尾蚴病。养猪实践显著预测良好知识（p=0.010），集约化系统比散养系统高出3.46倍（OR=3.464，95% CI-0.979-12.261）。职业接近显著性（p=0.54）。尽管100%报告洗手，但知识-实践相关性不显著（r-0.033，p=0.378）。仅8.8%愿意参与大规模药物管理计划。结论：旁遮普省养猪社区对猪带绦虫传播的关键知识缺口仍然存在。迫切需要针对低识字率人群的基于视觉的健康教育和基础设施改善。关键词：猪带绦虫，囊尾蚴病，知识，态度，实践，养猪。 | |
| 印度成人2型糖尿病与非糖尿病患者的宏量营养素摄入与碳水化合物质量：多中心I-STARCH-1横断面研究 | Kapoor, N. | 2026-08-18 | 背景/目标：印度饮食仍以碳水化合物为主；近期ICMR-INDIAB调查-21发现，碳水化合物约占全国总能量摄入的62%，同时蛋白质摄入相对较低，但该调查未按糖尿病状态评估碳水化合物质量。I-STARCH-1研究描述了印度成人中伴有和不伴有2型糖尿病（T2DM）者的宏量营养素摄入及碳水化合物质量，并与2014年原始STARCH（评估膳食碳水化合物含量研究）队列进行描述性比较。方法：这项多中心横断面研究从印度14个邦的29个医疗中心招募了1104名成人（690名T2DM患者和414名非T2DM者）。膳食摄入通过三次非连续24小时回顾法评估，并使用印度医学研究委员会-国家营养研究所（ICMR-NIN）食物成分表进行统一处理。按T2DM状态和地理区域比较宏量营养素摄入，以STARCH 2014作为历史参考。同时评估探索性膳食质量指数（DQI）和蛋白质-脂肪质量指数（PFQI）评分。结果：碳水化合物占总能量摄入的62.1%，脂肪占25.1%，蛋白质占12.8%。简单碳水化合物占碳水化合物总摄入量的20.3%，而纤维摄入量仍较低（约15克/天）。T2DM成人从碳水化合物中获取的能量比例低于非T2DM者（61.0%对64.1%）。膳食模式在不同地理区域间大体一致。与STARCH 2014的描述性比较显示，I-STARCH-1中碳水化合物摄入较低、脂肪摄入较高、简单碳水化合物比例较高，且探索性DQI和PFQI值较差。便利诊所抽样和横断面设计限制了结果的普适性和因果推断。结论：印度成人的碳水化合物摄入仍较高，而碳水化合物质量欠佳，表现为低纤维和高简单碳水化合物摄入。研究结果支持优先关注碳水化合物质量、纤维和蛋白质充足性，而非仅减少碳水化合物总量。 | |
| 利用免疫组织化学特征探索机器学习模型以揭示ALS发病机制中的通路 | Kuruvilla, J. M. | 2026-08-18 | C9orf72中的六核苷酸重复扩增是肌萎缩侧索硬化症（ALS）和额颞叶痴呆最常见的遗传病因，但相关炎症和蛋白病标志物所包含的预测信息仍未得到充分表征。在此，我们基于Rifai等人的数字病理学研究，从10例C9orf72-ALS病例和10例对照的定量死后测量中，重建了五个机器学习就绪数据集，涵盖Iba1、CD68、GFAP、TDP-43和FUS。我们评估了随机森林、支持向量机、XGBoost、逻辑回归、人工神经网络及集成方法，并结合预处理、超参数优化和生物标志物特异性特征重要性分析。在常规3折交叉验证下，模型性能随生物标志物和分类器的不同而变化，没有单一算法能在所有生物标志物上持续达到最高的敏感性、特异性和准确性。Iba1在随机森林中表现最强，达到88%的敏感性和83%的特异性。然而，当使用患者分组的5折交叉验证评估随机森林时，所有五种生物标志物的性能均下降，与常规交叉验证相比，准确性降低6.98-14.52%，敏感性降低5.68-18.90%，特异性降低2.86-13.04%。尽管如此，在患者分组评估下，Iba1仍是随机森林中表现最强的生物标志物。特征重要性分析进一步显示了生物标志物特异性的预测特征，分类通常分布在多个病理测量中，而非由单一特征主导。这些发现表明，定量神经病理学中机器学习性能的估计对验证设计敏感，并强调了当多个病理观察来自同一患者时，患者层面分离的重要性。需要进一步使用完全嵌套的患者分组交叉验证，以确定模型在未见患者上的比较性能。 | |
| 在中低收入国家引入候选疫苗VPM1002以预防结核病的潜在健康与经济影响：一项建模研究 | Clark, R. A. | 2026-08-18 | 背景 结核病（TB）候选疫苗VPM1002在最近的III期试验中未证明有效性，目前正与印度监管机构进行讨论。然而，低效力的结核病疫苗仍可能具有公共卫生价值。我们评估了在低收入和中等收入国家（LMICs）引入VPM1002可能带来的健康和经济影响。方法 我们将结核病动态模型校准至79个LMICs的流行病学和人口统计数据。假设疫苗将在2027-2047年间引入，常规每年为6岁队列接种，并通过两次每10年一次的运动为较大年龄人群接种，疫苗有效期为3年，效力为16.9%（95%置信区间=-13.3至39.1%），并预防结核病。我们估算了到2050年避免的累计症状性结核病病例和结核病相关死亡，并从卫生系统和社会角度评估了成本效益。结果 结果显示，在79个LMICs中，2027-2050年间可能避免670万（95%不确定性区间=-4.0至14.9）例症状性结核病病例，以及70万（-0.4至1.5）例结核病相关死亡。假设疫苗成本为每剂0.75美元，与不接种相比，在79个建模LMICs中的15个（19%）中，VPM1002接种可能具有成本效益，阈值设为卫生系统角度下人均国内生产总值的1倍；从社会角度看，在79个国家中的28个（35%）可能具有成本效益，在14个国家（18%）中占主导地位。结论 VPM1002 III期试验未证明有效性，因此结果可能出于偶然。然而，如果真实疫苗效力与观察到的点估计一致，那么在LMICs全面推广可能避免一部分症状性结核病病例和结核病相关死亡，并在一些国家可能具有成本效益或节省成本。尽管可能不可行，但通过更大规模的III/IV期研究获得更精确的VPM1002效力估计将是有用的。 | |
| 2026年刚果民主共和国本迪布焦埃博拉疫情的动力学、最优控制及溢出风险 | Li, J. | 2026-08-18 | 2026年，刚果民主共和国（DRC）爆发了本迪布焦埃博拉病毒（BDBV）疫情，截至8月11日，报告确诊病例4566例，死亡2128例，可能成为全球有记录以来最大规模的埃博拉疫情。我们建立了一个易感-暴露-感染-死亡-康复（SEIDR）模型，纳入三类干预措施，即公众自我防护、安全埋葬以及治疗与康复，以评估早期传播动态、当前疫情轨迹和跨境溢出风险，并为防控策略的制定提供依据。基于截至7月31日的累计确诊病例数据，对多个候选起始日期进行敏感性分析，确定3月28日为持续传播的最佳起始日期，3月31日至4月3日是最可能的疫情暴发窗口期。截至7月31日，基本再生数（R0）为1.83（95%置信区间：1.81-1.84）。当58.12%的易感人群采取防护行为时，传播链可被有效阻断。通过将非支配排序遗传算法II（NSGA-II）与庞特里亚金最小值原理（PMP）相结合，我们得出了一种每两周调整一次的时变最优控制策略，可将疫情持续时间缩短约7个月。利用国际移民存量数据和基于Facebook IP的流动性数据，结合Prophet预测模型，我们评估了溢出风险。7月底，四个国家被认定为极高风险。与现状情景相比，优化控制策略可大幅降低全球输入风险。建议非洲刚果（金）邻国、欧洲法国和北美加拿大加强入境筛查和防范准备。 | |
| 印度综合疾病监测计划（IDSP）持续绩效评估的数字就绪框架——基于比哈尔邦2016-2018年周疫情报告的研究 | Srivastava, D. K. | 2026-08-18 | 背景：公共卫生监测系统的评估是一项计划性义务，但大多作为定期、外部委托的活动进行，需要专门资源和额外数据收集。印度综合疾病监测计划（IDSP）通过周报生成持续的疫情暴发数据，但缺乏常规、嵌入式的绩效评估机制。本研究评估了IDSP疫情暴发检测与响应在多项监测属性上的质量，并仅利用常规计划数据开发了加权综合绩效评分框架。方法：在比哈尔邦38个地区开展了一项横断面评估研究，使用IDSP中央监测单位2016—2018年周报中的二手数据（n=559起疫情暴发）。评估了六项监测质量属性——及时性、完整性、代表性、相对敏感性、可接受性和灵活性。基于专家意见得出的属性权重（n=25名专家）开发了加权综合绩效评分量表。计算地区级得分并缩放至100分。结果：及时性是表现最差的属性，三年中在48小时内通报的疫情暴发不足15%。私营部门参与完全缺失——所有38个地区三年的可接受性得分均为0。完整性是最强属性，所有年份均超过95%。平均综合得分持续偏低（23—27分，满分100分），且地区间差异随时间扩大。四个地区（10.5%）三年得分均为0。结论：本研究为IDSP疫情暴发检测与响应提出了一个动态、基于常规数据的综合绩效评估框架。该模块化、可配置的框架可在任何行政层级（从区块到国家）运作，并与数字健康信息平台兼容，无需额外数据收集即可实现持续、嵌入式的绩效监测。该框架已在印度政府注册为知识产权。关键词：疾病监测；IDSP；IDSR；绩效评估；综合评分；疫情暴发检测；及时性；完整性；相对敏感性；数字健康 | |
| 适应性枢纽重组区分癫痫中的认知保留与衰退 | Imtiaz, T. | 2026-08-18 | 认知障碍影响高达80%的耐药性癫痫（DRE）患者，然而在疾病特征相似的患者中，这种障碍的基础仍知之甚少。既往研究主要集中于识别导致认知衰退的局灶节点，而对与认知保留相关的更广泛网络重组特征描述不足。在本研究中，我们假设大脑重组其功能网络枢纽的能力，而非潜在病理程度，区分了认知弹性患者与认知受损患者。我们研究了一个回顾性队列，包括105名DRE患者和60名健康对照，均接受静息态功能神经影像学检查。DRE患者根据涵盖领域一般和领域特定水平的综合神经心理学评估，分为癫痫认知中性（ECN）和癫痫认知受损（ECI）亚组。亚组在关键疾病特征上无差异，包括癫痫病程、发病年龄、发作侧化和病灶状态（p>0.05）。我们表征了全脑、典型功能网络和皮层下水平的枢纽组织，并使用枢纽破坏指数总结每位受试者的功能重组。我们发现两组中全脑拓扑结构均得以保留，而破坏集中于突显网络，并在皮层下结构中分离，两组均表现为海马节点强度降低和丘脑节点强度增加，后者随认知负担加重更为显著。网络间连接从ECN中的局灶性选择性上调转变为ECI中的弥漫性过度连接。关键的是，中心性的枢纽破坏指数（HDI）区分了各组，其中ECN组显示出从典型枢纽向替代中继区域的最大中心性再分布，而ECI组则表现出相对较少的重组（ECN vs ECI: d=0.52, p=0.029；Bonferroni校正）。相同模式在个体领域内也成立，语言和记忆功能保留的患者表现出更大的枢纽重组。这些横断面发现将癫痫中的认知障碍与适应性枢纽重组能力降低而非单纯病理联系起来。由于中心性的HDI可在个体水平计算，它可能提供一种客观的影像生物标志物，以补充神经心理学测试，帮助识别有认知衰退风险的患者，并为DRE的预后咨询和手术规划提供信息。 | |
| 肾脏病学领域大语言模型的鲁棒性差距 | Soejima, A. | 2026-08-18 | 背景：基准测试表现是否反映稳健的临床推理而非表面模式识别仍不确定。我们通过“以上答案均不正确”（NOTA）替换，评估了最先进的大语言模型（LLMs）在肾脏病学委员会更新题目上的稳健性。方法：从210道日本肾脏病学会委员会更新题目（2014-2023年）中，两名肾脏病学家独立审查所有项目。替换后NOTA成为唯一正确答案的题目被纳入，最终得到145道验证题目。GPT-5、GPT-4o、Gemini 2.5 Pro和Gemini 2.0 Flash在默认设置下通过应用程序接口进行评估。主要终点是准确率，配对差异使用精确双侧McNemar检验评估。结果：所有模型在NOTA替换后准确率显著下降：GPT-4o从66.21%降至19.31%（下降46.90个百分点）；GPT-5从87.59%降至73.10%（下降14.48个百分点）；Gemini 2.0 Flash从58.62%降至31.03%（下降27.59个百分点）；Gemini 2.5 Pro从86.90%降至55.86%（下降31.03个百分点）；所有P值均小于0.001。GPT-5在两个版本中下降幅度最小且准确率最高。结论：所有评估的LLMs在NOTA替换后均显示出显著的稳健性差距。较新的模型可能更稳健，但多项选择准确率仍是临床推理稳健性的不完整衡量指标。 | |
| 母体和胎儿的细胞程序共同调控妊娠并发症及胎盘耐受性 | Normand, R. | 2026-08-18 | 胎盘是一个短暂存在的器官，协调着对健康妊娠至关重要的母胎相互作用，然而调控胎盘功能障碍的多细胞原理仍知之甚少。在此，我们呈现了人类胎盘的多模态单细胞图谱，利用配对单细胞RNA测序、CITE-seq和T细胞受体测序，对来自68名供体的超过120万个细胞进行了分析，覆盖自发性早产、早产和足月子痫前期、胎儿生长受限、1型糖尿病以及健康足月和早产妊娠。我们定义了115种胎盘细胞群体，包括先前未被识别的母体和胎儿亚群，揭示了免疫、血管、滋养层和基质区室中意想不到的细胞多样性。跨疾病分析表明，母胎髓系失衡几乎贯穿所有疾病状态，而滋养层细胞、胎儿巨噬细胞和胎儿内皮细胞则表现出显著且条件特异性的失调。我们进一步识别了保守的干扰素刺激巨噬细胞群体，它们作为构成性稳态哨兵发挥作用，并定义了与健康及复杂妊娠中胎盘T细胞克隆扩增相关的候选多细胞免疫调节微环境。综合来看，这些发现为胎盘功能与功能障碍建立了一个全面的细胞框架，可为主要产科疾病的精准诊断和治疗策略提供指导。 |