2026-08-19 每日论文
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| 从语料到协同演进的能力：面向通用图像生成的能力中心数据设计 | Xingjian Wang | 2026-08-18 | 大规模图像生成受益于数据规模、质量、再平衡和重新标注方面的进步，但传统流程通常孤立地优化特定任务的数据集。核心挑战不仅在于如何策划每个任务特定的语料库，还在于如何根据生成能力之间的依赖关系组织异构监督。我们提出了一种能力驱动的数据基础设施，将能力特定的监督构建与能力对齐的课程调度相结合。其三个专门但可互操作的数据引擎为文本-图像接地、图像间变换和图像-知识关联构建互补的关系监督，而字幕专家则跨任务和粒度对齐T2I和编辑监督。一个多阶段课程沿着能力获取的依赖顺序共同演化任务组成、视觉概念分布、数据质量和图像分辨率，能力感知评估通过定向检索、专家构建和差距感知重采样闭环。在规模上，该框架策划了4.4亿图像的T2I语料库、1.2亿编辑对和超过2700万图像-实体对。借助这一基础设施，我们从零开始训练了两种规模的多模态扩散模型，分别为3B和6B参数。我们在CPI-Bench上进行定量评估，并在多样化的文本到图像和编辑场景中进行定性评估。实验结果展示了广泛的视觉覆盖、多功能的渲染以及跨生成能力的有效迁移。 | |
| 面向放射学报告结构化与质量保证的多智能体AI系统，并包含独立放射科医师评估 | Iryna Hartsock | 2026-08-18 | 目的：开发并评估一个本地部署的多智能体AI系统，用于放射学报告结构化和质量保证。材料与方法：本回顾性研究纳入了2023年和2024年由15名委员会认证放射科医生口述的638份胸部、腹部和盆腔CT检查放射学报告。开发了一个多智能体AI流程，用于执行报告结构化和质量保证（QA）。该系统使用正则规则和本地大语言模型，在句子级别将报告结构化为标准解剖部分。它还检测了“发现”与“印象”部分之间或部分内部的不匹配、性别-解剖冲突，以及未记录的关键发现沟通。两名委员会认证放射科医生独立评估了一个45份报告的子集。结果：多智能体系统将所有报告（22,270个句子）的“发现”部分结构化为预定义的解剖格式，同时保留原始报告内容。系统标记了90份（14.1%）报告，最常见的是部分不匹配（80份报告，12.5%）。在放射科医生评估中，两位审阅者一致认为31份（69%）被正确重构，2份（4%）被错误重构，并对剩余12份（27%）意见不一。两位审阅者一致认为没有遗漏临床重要信息，也没有引入虚构内容。总体QA性能在84%的评估报告中被评为“优秀”或“良好”，其余报告被评为“一般”。结论：一个本地部署的多智能体AI系统在单一流程中结合了放射学报告结构化和质量保证。该系统在放射科医生评估中表现出良好性能。此类系统可能支持放射学实践中报告标准化和质量保证。 | |
| 论自我改进智能体的脆弱性：方差、任务顺序与欠规格化 | Qinyuan Ye | 2026-08-18 | 基于记忆的自我改进智能体——它们通过在线任务流学习，并借助维护文本记忆库随时间提升性能——在近期文献中展现出巨大潜力。然而，这些方法的可靠性方面被严重忽视。在本研究中，我们对两种基于记忆的方法进行了全面重新评估，沿两个维度扩展了评估范围：（1）包含多次运行以量化方差，（2）随机打乱任务顺序以探究任务顺序的影响。通过这些实验，我们得出两个观察结果，揭示了当前方法的脆弱性：首先，在复杂环境和多步骤任务中，智能体评估本质上带有噪声，而叠加自我改进循环可能进一步放大这种噪声。其次，智能体的改进高度依赖于任务顺序。先前工作常采用默认排序，这隐含了一种课程式学习，成为成功的隐藏前提。为更好理解这种脆弱性，我们手动检查了智能体的记忆，并假设任务和环境规格不足是导致此脆弱性的因素。我们通过将能提供更好规格的信息（如详细评分标准和环境反馈）纳入记忆构建过程来验证这一假设。虽然这些附加信息部分弥补了先前实验中的性能下降，但显著差距依然存在，表明其他未表征因素也促成了这种脆弱性。展望未来，我们的工作倡导对自我改进智能体采用更严格的评估协议，通过报告多次运行结果并在挑战性条件下进行压力测试。此外，我们关于规格不足的发现呼吁构建支持有效人类监督的系统与界面，防止智能体以不可预见的方式失败。 | |
| EDITBRIDGE：迈向忠实且高效的超高分辨率图像编辑 | Jiayi Song | 2026-08-18 | 高分辨率图像编辑在专业工作流中的需求日益增长，然而现有的基于扩散的模型受限于二次注意力复杂度和过高的内存需求，仍只能处理低于1K分辨率的图像。一种常见的解决方案采用两阶段流程：先在低分辨率下进行编辑，再独立进行超分辨率处理。然而，这种方法存在两个关键问题：信息发散，即幻觉细节与原始高分辨率（HR）源图像相矛盾；以及纹理退化，表现为过度平滑或过度锐化的伪影。我们提出EditBridge，一种用于高效超高分辨率编辑的扩散桥接框架。与从噪声中重新生成的传统扩散方法不同，我们将细化过程构建为从低分辨率（LR）编辑结果到其高分辨率对应版本的结构化数据到数据转换，并明确以原始高分辨率源图像为条件，以保留真实细节。为了高效整合高分辨率源引导，我们引入了一种基于先验的块状稀疏注意力机制，利用第一阶段编辑中的语义对应关系，将跨图像交互限制在空间对齐区域，从而显著降低计算开销。大量实验表明，EditBridge在高达4K分辨率下实现了高保真编辑和卓越的感知质量，在2K分辨率下实现了3.6至8.4倍的加速，并能在61秒内完成实用的4K编辑。 | |
| TokEval：分词器评估套件 | Clara Meister | 2026-08-18 | 语言模型分词器通常在评估不足的情况下被选择，尽管其设计选择直接影响模型能力。这在一定程度上归因于对哪些分词器属性影响下游性能的哪些方面理解有限。我们引入了TokEval，一个分词器评估指标框架，超越了生育率和压缩率等标准度量，以捕捉语言和结构上有意义的属性，例如UTF-8字符边界完整性和数学中的数字位值边界对齐。为了验证这些指标是否能预测下游模型性能，我们进行了受控的语言模型预训练实验，仅改变分词器的训练数据混合、预分词策略和训练算法。我们在每字节比特数（一种与分词器无关的困惑度版本）以及多个基准上评估了生成的模型，涵盖语言理解、数学推理和代码生成。我们的实验表明，不同的内在属性对模型能力有不同的影响：信息论指标预测语言建模能力（Spearman rho高达0.80），而结构敏感指标，如测量数字和换行处理的指标，与任务准确性相关。我们希望TokEval能实现更有原则的分词器评估，在两者一致的地方用内在测量取代预训练扫描。 | |
| 浓度博弈：贝叶斯更新、遗憾与信息 | Akshay Balsubramani | 2026-08-18 | 我们给出一个学习者和自然之间的两人零和重复博弈，其价值恒等式同时生成贝叶斯更新和指数权重遗憾的精确核算，并提供了广泛浓度现象共享的比较器类变分形式。终端收益是固定相对熵下比较器相对于先验所能获得的最大值，而单步约束是自然在学习者混合行动下移动的信息预算。学习者的行动在其他方面不受限制，吉布斯/贝叶斯权重作为其唯一的贝尔曼均衡器出现——即使得每轮损失独立于自然移动方向的混合行动——其中对数配分函数扮演价值函数的角色。遗憾精确分解为三部分：反映观测结果变化的每轮信息损失、精确核算轮次间测量尺度变化的加性重调温漂移，以及比较器相对于先验所携带的信息。驱动标准遗憾界的方差和有界范围代理是该分解的宽松松弛，该分解普遍成立并支配它们。双方策略从分解中逐项读出，重复博弈产生信息论的自博弈账本，取代通常的二次变分替代。相同的比较器类几何解释了经典大偏差界，而老虎机、后验采样、聚合和提升中的方法都是这一个遗憾分解的特例。 | |
| 代理推荐系统中的委派不对称性：在线约会中双向接受度的测量 | Daria Leshchikova | 2026-08-18 | 以用户名义进行对话的自主LLM代理，是匹配平台中一种新兴的设计模式，但其可行性取决于一个鲜少被审视的条件：用户不仅必须接受将对话委托给代理，还必须接受接收来自他人的代理中介通信。我们通过两项针对主流约会平台活跃用户的大规模调查（生成式个人资料特征N=2,894；自主对话代理N=2,617，以两种语言进行）来研究这一条件。我们基于带潜在回归的分级响应模型，开发了一个代理接受度的潜变量测量模型，并通过模型比较表明，发送意愿和接收代理通信意愿是不同的构念：高度相关（rho=0.92）但可分离（Delta BIC=52），且在不同语言间具有部分测量不变性。该模型量化了一种系统性的委托不对称性：部署自己的代理所需的接受度远低于参与对方代理（阈值-0.38对比+0.32；完全参与为+1.39），且平均部署倾向约为参与倾向的三倍。在基于陈述接受度的随机配对反事实下，仅有4-13%的有向二元组结合了代理部署与接收者参与，且存在显著的性别方向性失衡。设计反事实量化了杠杆效应：互惠要求将交互量削减一半或更多，排除了近三分之二的潜在部署；而基于接收接受度路由代理联系，使每次接触的参与度提升三倍，这一提升在目标项目被剔除的样本外验证中依然稳健（AUC 0.88，受访者级交叉验证下四分位提升3.1倍）。我们讨论了代理推荐系统设计的启示，包括披露、选择加入机制和接受度感知的匹配。 | |
| HLSR：面向实时拥堵规避的混合实时预测选择性动态车辆重路由 | Xiao Wang | 2026-08-18 | 城市交通拥堵降低了生产力，并增加了出行成本和排放。全网实时行程时间最短路径重路由在模拟中可能非常有效，但假设每辆在途车辆在每个决策周期都被重新规划。我们提出HLSR，一种选择性混合实时-预测车辆重路由框架，在有限干预范围内融合实时边缘速度与短期预测。基于双阈值拥堵检测、校准的上游选择和驾驶员定制的行程时间预测，HLSR进一步引入了接近车辆扩展、行程时间加权k最短路径生成，以及用于多成本路径分配的地平线依赖混合实时-预测路段速度。 | |
| 用于无监督动态对比增强MRI重建的原始表示学习 | Veronika Spieker | 2026-08-18 | 动态对比增强MRI的可靠定量分析需要在高欠采样率下实现高质量的时空重建。基于高斯和Gabor基元的扫描特定重建方法在无需大型训练数据集的情况下显示出有前景的结果，但尚未解决动态对比这一额外维度。我们提出了一种基于多维基元的动态对比增强MRI重建框架，该框架将潜在解剖结构、动态对比增强和残余运动分离为独立的时间基函数，从而实现对表示形式的几何解释。我们表明，该架构在重建质量以及提取的主动脉和肾脏增强曲线的准确性方面，均能达到与传统重建方法相当的性能。模块化层级设计可自然扩展到额外的动态因素和更高的加速率。代码可在 https://github.com/compai-lab/ 2026-GaborDCE-spieker 获取。 | |
| StagedWorkspace：面向知识工作代理的版本化工作空间 | Yining Hua | 2026-08-18 | AI代理越来越多地执行知识工作（即生成和修改持久的数字工件，如代码仓库、文档、电子表格、幻灯片、报告），然而它们搜索的解析视图、编辑的原生文件、审查的更改以及提交的工件可能引用同一工作产品的不同版本。我们将此表述为工作区状态契约：每个视图都应明确绑定到演化中的工作区状态的某个版本。编码代理部分通过搜索、差异和测试的仓库契约解决了这一需求，而对于PDF、电子表格、幻灯片、笔记本和混合格式项目文件夹，类似的契约则不那么明确。我们提出StagedWorkspace，一个面向知识工作代理的版本化工作区。该工作区将解析记录和审查差异绑定到原生文件变化时的内容哈希。在OfficeQA Pro和APEX-Agents上的固定框架消融实验中，双解析/原生访问在每个测试模型上都有最高的点估计；相对于更受限的单视图，它将OfficeQA Pass@1提高了8.3-12.1个百分点，APEX平均评分提高了4.7-9.2个百分点。SW-AGENT在OfficeQA上使用Gemini 3.1 Pro得分为63.9%，在APEX上使用GPT-5.4 Nano得分为42.1，而已发布的同模型得分分别为29.3%和25.5。在57个文件编辑任务上的配对审查轴消融进一步发现，当差异可见时，观察到的得分更高。这些结果将工作区状态识别为知识工作代理中的一个实验变量，并激励基准测试将证据、分阶段编辑和提交的工件作为显式状态转换来评分。 |
bioRxiv
| 标题 | 作者 | 发布日期 | PDF链接 | 摘要 |
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| 粪肠球菌生物膜重塑中性粒细胞代谢以抑制抗菌活性 | Antypas, H. | 2026-08-19 | 粪肠球菌是一种机会性病原体，尽管有强烈的中性粒细胞募集，它仍能在生物膜相关感染中持续存在。粪肠球菌如何逃避中性粒细胞的作用仍知之甚少。在此，我们研究了粪肠球菌生物膜如何改变人中性粒细胞的效应功能，并使用了鼠伤口感染模型。我们发现粪肠球菌生物膜抑制中性粒细胞胞外陷阱（NET）形成、细菌吞噬以及中性粒细胞介导的生物膜生长控制。这种抑制部分由粪肠球菌通过乳酸脱氢酶（LDH）产生乳酸所驱动，乳酸使细胞外环境酸化，降低中性粒细胞内pH值，并扰乱糖酵解、三羧酸循环和氧化磷酸戊糖途径。在鼠伤口感染模型中，LDH的缺失增加了中性粒细胞募集和NETosis。我们还发现，高细菌密度（生物膜的一个定义性特征）通过不依赖乳酸的机制抑制NETosis。综合来看，这些发现识别了由细菌代谢和生物膜相关细菌的高密度结构组织介导的生物膜免疫逃避策略。 | |
| 自动化构建用于科学推断的语境化生物医学知识图谱 | Zheng, Y. | 2026-08-19 | 生物医学相互作用本质上是动态的，在特定生理状态下常常发生转变甚至逆转。然而，现有的提取方法将这些复杂机制简化为与上下文无关的二元关联，导致语义损失和矛盾证据。在此，我们提出AutoBioKG，一个端到端框架，通过利用复合三元组在核心关系之外编码环境条件和实体属性来构建上下文感知的知识图谱。该框架由一个在BioOpenIE上训练并进一步通过来自未标记文献的伪标签自训练精化的开放信息提取模型驱动，展现出广泛的泛化能力。值得注意的是，AutoBioKG在DDI、ChemProt和BioRED上取得了最高的零样本F1分数，在每个基准上比最佳基线高出3.6至17.8个百分点。此外，在BioASQ生物医学问答评估中，AutoBioKG生成的图谱在是/否、事实型和列表问题上优于现有方法，特别是在需要细粒度上下文信息的查询中。综合这些结果，支持AutoBioKG作为将非结构化文献转化为结构化、上下文感知生物医学知识的可扩展框架。 | |
| 菊科植物Tanacetum vulgare中单萜类化合物化学多样性的分子来源提示了特化代谢进化的新模型 | Hildebrandt, M. | 2026-08-19 | 高度多样化的次生代谢使植物能够与传粉者、食草动物及保护者进行交流。其化学多样性，涵盖均匀度、丰富度和变异度，包含许多功能未知的化合物，并提出了关于选择如何发生及选择什么的进化难题。由于其复杂性，其在基因组中的编码方式常常未知。为了产生种群水平的化学多样性，性状需允许同一群体中存在高度化学多样性和高度特异性的个体。在此，我们利用代谢组学、转录组学和基因组学，结合田间分析及菊科植物艾菊（Tanacetum vulgare）中单萜合酶的功能测定，识别了产生高种群水平化学多样性的力量：对酶产物特异性的选择、表达缺失等位基因、缺失变异及特化代谢岛驱动个体趋向低化学多样性，而连锁不紧密的酶位点、表达变异等位基因、存在变异及从头酶进化则促进个体高化学多样性。由于分子数据提示选择机制在种群水平上增加化学多样性本身，筛选假说——认为植物在选择前产生多样化学物质的储备库——应被化学多样性选择假说所取代。结果表明，除了通过已知靶向机制的特定化学物质进行植物保护外，即使与邻近个体亲缘关系密切，与其不同也可能是植物保护的重要因素。 | |
| 基于证据约束的药物发现机制性合成 | Sengupta, D. | 2026-08-19 | 机制性药物开发项目往往拥有超出其可安全量化的生物学证据。我们开发了证据约束机制综合（ECMS），这是一个框架，用于分类每项发现所含信息的类型，并仅将该信息转化为对一系列机制性假设的限制。证据转移了可重复集合中支持事件的频率，而非转化为无支撑的系数或生物学真理的概率。在慢性自发性荨麻疹（CSU）的实施中，一个代表性但非详尽的语料库，包含来自53个来源和13个公共数据资源的114项原子发现，编制了18项关系/上下文约束和一个冻结的4,096假设集合。治疗方案评估被构建为连续多节点目标匹配：研究者指定模型节点的期望变化和重要性系数，而包声明的控制变量连续变化。一种确定性Sobol到块细化搜索，在全部4,096个假设上验证，相对于预设启发式演示配置文件下44个确定性锚点中的最佳方案，将目标匹配损失降低了27.3%；改变目标配置文件会改变选定的控制向量，而不改变证据集合。一项补充的仅D参考分析将决策相关的不确定性定位在肥大细胞至疾病关系周围，说明机制优先级取决于声明的目标。ECMS旨在用于药物开发的预校准阶段：它使异构文献可计算，同时保持证据、不确定性和决策偏好相互区分。 | |
| 磷酸化肽段序列约束的监督学习实现SH2结构域结合的全局预测 | Kandoor, A. | 2026-08-19 | 酪氨酸激酶信号传导在多细胞生物的细胞发育和稳态中起关键作用，其主要生化贡献在于驱动磷酸化酪氨酸（pY）与含SH2结构域蛋白之间的相互作用。这种组装对细胞结局的调控至关重要，因此已有多种实验和计算方法被用于理解哪些SH2-pY相互作用会发生，但由于人类蛋白质组中pY位点超过45,000个、SH2结构域有120个，这一任务仍具挑战性。基于全面接触图谱所提示的生物物理约束，本研究探讨一种方法是否可首先通过开发结合多样训练数据的分类策略，来考虑pY序列是否符合SH2结构域识别的共享规则。广泛的验证表明，该方法SpY-C能够将pY位点分类为具有或不具有参与SH2结构域相互作用的潜力。我们发现，从不同实验技术整合的相对较小的代表性SH2结合子集即可提供良好的分类效果。我们利用此分类器注释人类磷酸化蛋白质组及个体实验，探索使用超级SH2结构域试剂进行pY富集的后果，并分析突变对pY位点功能的影响。SpY-C为更快速注释pY功能提供了一步有益的进展，并可能改善针对特定SH2-pY相互作用的下游机器学习方法，这些方法通常基于首轮分类策略。 | |
| 通过朊病毒样传播的可微模拟实现tau扩增速率的空间分辨映射 | Kondo, Y. | 2026-08-19 | 神经退行性疾病表现出特征性但异质性的病理扩散模式，其潜在决定因素仍不清楚。一个核心挑战在于，从神经影像数据推断空间异质的传播动力学构成了一个高维逆问题，在全脑尺度上一直难以解决。在此，我们提出一个可微分的反应-扩散框架，能够从tau PET数据推断空间分辨的tau扩增速率。通过整合基于MRI的正向模拟与误差反向传播，我们的方法重建了人脑中受试者特异性的体素级tau扩增速率图谱。对推断图谱的分析显示，扩增速率与淀粉样蛋白PET呈正空间关联，表明它们捕捉了区域对淀粉样蛋白驱动的tau积累的易感性方面。此外，与转录组数据的整合识别出与扩增区域变异相关的基因表达程序。这些发现提供了一个数据驱动的框架，将分子结构与神经退行性病变中的大规模传播动力学联系起来。 | |
| 内源性脂滴在神经干细胞不同状态间展现出显著的蛋白质组和脂质组差异 | Panfilova, D. | 2026-08-19 | 脂滴（LDs）是包被蛋白质的细胞器，储存中性脂质并调节能量代谢之外的多种细胞过程。在神经干/祖细胞（NSPCs）中，LD的丰度和形态随细胞状态而变化，但LD的分子组成是否同样依赖于状态仍属未知。在此，我们定义了NSPCs及其后代的首个内源性LD蛋白质组和脂质组图谱。状态分辨分析揭示了LD相关蛋白和储存脂质的广泛差异，从而能够识别区分静息态和增殖态的LD特征，并发现众多蛋白在静息态NSPC LDs上的选择性富集。对其中一种蛋白CIDEB的功能探究表明，其敲低会改变LD形态并诱导衰老相关转录程序，提示CIDEB在维持NSPC静息态中发挥作用。这些发现确立了LDs作为NSPCs及其后代中动态特化的细胞器，并为研究LD介导的干细胞状态和谱系进展调控提供了资源。 | |
| TBC-2，一种Rab GTP酶激活蛋白，调控线虫肠道中HLH-30/TFEB和PQM-1转录因子的定位 | Saha, S. | 2026-08-19 | 胰岛素/IGF信号（IIS）抑制DAF-16/FOXO转录因子的核定位，以调控线虫的寿命和应激抵抗。在肠道中，IIS促进DAF-16定位至内体，而TBC-2（一种RAB-5 GAP）的缺失导致DAF-16在内膜上的定位增加，同时减少其核定位，降低DAF-16靶基因表达、寿命和应激抵抗。本研究发现TBC-2差异调控IIS调节的转录因子PQM-1和HLH-30/TFEB的定位。我们的结果表明TBC-2在调控IIS中具有更广泛的作用，且TBC-2可能作用于IIS通路的上游节点。 | |
| 双重PPAR-α/δ激动剂elafibranor通过人心脏模型中的氧化还原-代谢和生物能量重编程减轻TGF-β1诱导的心脏纤维化 | Paw, M. | 2026-08-19 | 背景：心脏纤维化通过持续的成纤维细胞活化、细胞外基质（ECM）沉积和心脏功能受损，驱动不良心肌重塑。当前疗法对心脏纤维化进展的保护作用有限。Elafibranor是一种双PPAR-α/δ激动剂，已获批用于肝病治疗。然而，其在人类心脏纤维化模型中的作用尚未得到充分探索。方法：在互补的人类体外TGF-β1诱导心脏纤维化模型中评估了Elafibranor：二维原代成纤维细胞、三维成纤维细胞球体、自发收缩的三维心脏微组织以及hiPSC来源的心肌细胞。评估了细胞活力、凋亡、成纤维细胞活化、ECM重塑、线粒体呼吸、核苷酸和NAD池、钙处理、收缩性以及转录组谱。结果：在非细胞毒性浓度下，Elafibranor减弱了TGF-β1驱动的心脏纤维化反应。在二维心脏成纤维细胞中，它减少了肌成纤维细胞分化、前胶原11分泌，并部分恢复了线粒体呼吸能力。在三维球体中，它保持了细胞活力，减弱了caspase-3/7活化，并抑制了前胶原11释放。在心脏微组织中，Elafibranor减少了ECM积累，将转录组谱转向氧化还原代谢/细胞保护通路，改变了腺嘌呤核苷酸和NAD池，并部分恢复了收缩参数。在hiPSC来源的心肌细胞中，Elafibranor调节了钙处理、收缩性和线粒体呼吸。结论：Elafibranor通过抑制成纤维细胞活化和ECM重塑，同时促进适应性代谢、氧化还原和生物能量反应，减轻TGF-β1驱动的心脏纤维化，支持平衡的PPAR-α/δ激活作为心脏纤维化的潜在治疗策略。 | |
| 放线菌素D促使RNA结合蛋白进入动态的细胞质颗粒中 | Torun, A. | 2026-08-19 | 放线菌素D（Act D）是一种全局性转录抑制剂，广泛应用于研究和临床实践；然而，其对RNA结合蛋白（RBP）动态变化的影响仍知之甚少。对Act D处理的HeLa细胞RNA-seq数据集的分析揭示了一种富集于RNA代谢、加工和翻译的补偿性应激反应。在此，我们以HuR作为mRNA稳定性RBP的模型，研究了Act D对RBP亚细胞定位的影响。短期Act D处理显著增加了HCT116和HeLa细胞中细胞质HuR的定位，而该蛋白在这些细胞中已知具有活性。对调控HuR核质转运的已知通路分析未能完全解释这种重新分布，提示存在替代机制。为鉴定Act D处理后HuR邻近的蛋白质，我们在HCT116细胞中进行了TurboID标记，随后进行LC-MS/MS分析。鉴定出多种参与RNA调控的蛋白质。概率建模突出显示了FUS——一种在相分离颗粒动态中具有既定作用的RBP——作为候选邻近蛋白。Act D依赖性HuR与FUS之间的相互作用通过分子动力学模拟进行了探究，并通过邻近连接实验验证。此外，Act D处理后RBP细胞质定位的增加伴随着颗粒结构的形成，这些颗粒相对流动，并可通过低渗休克破坏。总体而言，我们的发现表明Act D诱导多种RBP的细胞质重新分布及其被隔离到动态颗粒结构中，揭示了一种先前未被识别的对转录抑制的细胞反应。 |
medRxiv
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| PRAM：事后检索增强可在无需重新训练的情况下适应重症监护预测模型，并可在医院间共享 | Jeong, I. | 2026-08-19 | 医院若获得一个并非自行构建的预测模型，其唯一资源是本地已知结局的患者数据。我们在MIMIC-IV、MIMIC-III和eICU-CRD中，针对急性肾损伤和168小时死亡率，比较了八种策略，覆盖116,010例重症监护住院记录，并在67家和59家eICU-CRD医院中进行了验证。按区分度和净收益对八种策略排序，在78%的医院中急性肾损伤和68%的医院中死亡率的排序结果出现了不同的获胜者。因此，标准可决定在阈值作用点安装的选项是否有益。仅基于本地数据重新训练，在少于1,000名患者时AUROC损失最高达0.095。事后检索增强（PRAM）保持模型冻结，通过替换本地记录库进行适应。在主比较中，其AUROC损失最多为0.0029，在偏移最大的情况下改善了两个冻结模型的校准，且对冻结逻辑模型的影响在医院间差异很小（异质性为0%，而本地重训练为39%至76%）。跨医院比较中，PRAM为死亡率增加了0.020 AUROC，为急性肾损伤增加了0.009。由于相似性在模型外部计算，检索可附加到我们尝试的每个基础模型上。检索估计是两个和的比值，因此医院每次查询可交换16字节而非记录。没有标注结局的医院无法使用八种策略中的任何一种，但查询持有标注结局的医院网络，在84%至88%的站点增加了0.017 AUROC。医院应基于校准、净收益和持有的本地标注患者数量来选择适应策略，而非仅依据区分度。 | |
| MTS-Bench：面向语言模型分诊安全的曼彻斯特分诊系统基准 | Ravichandran, S. | 2026-08-19 | 背景：通用大语言模型（如ChatGPT）正越来越多地被医生和分诊护士用于急诊分诊。近期一项研究报告称，当患者直接向ChatGPT查询时，急诊分诊不足率为51.6%（Ramaswamy等，2026）。DR. INFO是一种基于代理式AI的临床助手，可检索经过整理的临床知识库，并提供特定于MTS的检索配置，在该配置下，系统在推理时还会检索曼彻斯特分诊系统（MTS）教科书。这些系统作为分诊辅助工具在结构化框架下的安全性尚未得到表征。方法：我们改编了Ramaswamy等人发表的临床场景，并将其映射到曼彻斯特分诊系统，生成了涵盖所有五个MTS优先级级别的39个急诊病例。每个病例以两种变体进行评估，一种不含、一种含客观临床数据块（生命体征、检查结果和实验室结果），并在两种性别间进行排列，每种条件产生156个提示。三个系统在有和没有误导性全科医生转诊声明作为锚定语句前置的情况下进行测试，每个系统产生312个提示：DR. INFO基线版、带MTS检索的DR. INFO版和OpenAI GPT-5.1。主要结局是在有序MTS量表上的分诊不足率，使用Fisher精确检验进行测试。结果：GPT-5.1对44.2%的病例分诊不足（69/156；95% CI 36.7至52.1），包括75.0%的红色和73.4%的橙色表现。两种DR. INFO配置均对11.5%的病例分诊不足（18/156；95% CI 7.4至17.5；与GPT-5.1相比，Fisher精确p = 1.0 x 10-10）。GPT-5.1产生了6次危险漏诊（3.8%），而两种DR. INFO配置均未产生（p = 0.030）。当锚定语句前置时，GPT-5.1对8个红色病例中的8个均分诊不足，而两种DR. INFO配置继续对红色病例零分诊不足。在输入中添加客观临床数据将带MTS检索的DR. INFO的分诊不足率从19.2%降至3.8%（p = 0.005）。DR. INFO基线版和GPT-5.1未显示类似变化。性别无显著影响。结论：在此基准测试中，用基于代理式检索增强的系统替代通用大语言模型，并基于经过整理的临床知识库，显著降低了分诊不足率和危险漏诊率。在代理式系统中添加曼彻斯特分诊系统教科书的检索，进一步与对锚定语句的敏感性降低以及当客观临床数据可用时分配的MTS优先级发生适当变化相关。在此评估的三种配置中，只有带MTS检索的DR. INFO在首次接触时结合了临床保守分配，并在额外临床信息到达时进行适当更新。 | |
| 母亲暴露于压力与儿童肥胖风险：一项针对生活在秘鲁贫困城市社区的女性及其5-15岁子女的横断面研究。 | Rougeaux, E. | 2026-08-19 | 摘要 目的 童年期母亲压力可能通过影响养育方式、亲子关系或儿童压力反应而导致儿童肥胖。然而，证据主要基于母亲自我报告的压力，而使用皮质醇等生理指标的研究发现关联不一致。多数研究在高收入环境中进行，限制了普遍性。本研究利用心理和生理压力标志物，在秘鲁一个贫困城市地区的475对母亲及其5-15岁儿童中，采用横断面设计评估母亲压力暴露与儿童肥胖风险。方法 母亲压力暴露包括心理困扰（12项一般健康问卷，将中度/高度困扰与无/低度困扰分类）和适应负荷（AL；通过头发皮质醇、BMI、腰围和血压的潜在剖面分析评估低/中/高AL）。儿童结局包括BMI和腰围年龄别z评分（BAZ和WCAZ）。进行线性回归分析，调整混杂因素。结果 与无/低困扰母亲相比，中度/高度困扰母亲的儿童BAZ和WCAZ分别低0.40（95% CI：-0.66，-0.13）和0.32（-0.53，-0.11）。与低AL母亲相比，中度AL母亲的儿童BAZ和WCAZ分别高1.15（0.41，1.88）和0.74（0.20，1.28），而高AL母亲的儿童BAZ和WCAZ分别高1.43（0.95，1.92）和0.91（0.50，1.32）。母亲皮质醇水平较高独立预测儿童肥胖。结论 高AL母亲的儿童超重或肥胖风险更大，这可能加剧资源受限环境中非传染性疾病的上升负担及相关社会、经济和公共卫生成本。注：稿件中提供西班牙语翻译摘要。 | |
| 挪威医院系统中的患者如何在院内流动？一项全面的病房级与医院级网络分析 | de Blasio, B. F. | 2026-08-19 | 摘要 患者在医院内部及医院之间的流动形成了可促进院内感染传播的网络。许多相关病原体具有长期携带状态，使定植患者能够在多次入院中穿梭于多个病房，从而间接连接不同病房。然而，基于个体患者轨迹的全系统病房层面分析仍然罕见，尽管此类分析能揭示理解和模拟该系统的重要特征。我们利用挪威患者登记册（360万条记录）中的个体患者轨迹，分析了病房和医院层面的网络，覆盖约55%人口在一年内（2012年）的住院护理。我们刻画了全局网络结构，并在病房层面计算了多种中心化指标，评估了基于渗流的连通性。在此基础上，我们结合有向K核分解与高斯混合模型聚类识别了核心病房。分析分别针对住院患者和所有患者进行，并通过跨递增时间间隔连接住院事件来扩展，以探讨关于事件连续性的假设如何影响推断的连通性。此外，还分析了多种基于患者的统计指标。患者流动生成了稀疏、区域结构化的网络，具有明显的核心-边缘组织。流入K核大于流出核，核心病房以主要医院转诊专科为主，内科病房作为关键入口和出口点。社区结构因患者类型而异：所有患者网络主要局限于本地，而住院患者网络跨越医院和地区。时间连接仅增加了所有患者网络中的枢纽主导性，而住院患者结构相对稳定。动态扩散模拟和真实暴发分析独立支持了所识别的结构骨干，表明在简化传播假设下，核心网络枢纽也代表患者介导传播的主要潜在路径。结果揭示了患者流动的稳健层级组织结构，有助于优先安排监测，同时强调预测建模需要病原体特异性流行病学和情境数据。 | |
| 绘制肺纤维化伴或不伴家族史的共同及罕见变异遗传风险图谱 | Lucas, S. | 2026-08-19 | 背景 迄今为止的遗传学研究尚未明确成人起病肺纤维化（PF）的大部分遗传风险。此外，临床上可操作的PF变异知识的缺乏，阻碍了实施基因检测以辅助早期诊断和改善疾病管理的努力。在此，我们评估了罕见和常见变异在有无PF家族史队列中对PF的贡献。方法 对一个家族性队列（包括PF病例及其家庭成员，共85人，代表55个家庭）以及来自澳大利亚IPF登记处（AIPFR）的122例有或无自我报告PF家族史的病例进行了全基因组测序（WGS）。对WGS数据进行了33个先前与PF相关的基因中罕见潜在致病变异的筛查。对罕见且预测可能致病的变异，使用美国医学遗传学与基因组学学会和分子病理学协会（ACMG-AMP）指南进行了正式分类。此外，为检查常见风险变异的贡献，使用16个先前与IPF相关的常见单核苷酸多态性（SNP）生成了加权多基因风险评分（PRS）。PRS由WGS数据为85例临床确诊的家族性病例和122例AIPFR病例生成。在其余202例AIPFR病例中，PRS由TaqMan基因分型数据生成。结果 对来自207名PF个体的WGS数据进行筛查，在家族性和AIPFR队列中均发现了多个罕见的推定致病变异。正式分类显示，在四个家庭（7.3%）中确认了TERT或RTEL1中的致病性（P）或可能致病性（LP）变异，其余大多数变异在另外七个家庭中被分类为意义不明确的变异（VUS；12.7%）。在AIPFR参与者中，四个变异达到P/LP分类阈值（3.3%），另有六人在分类后发现携带VUS（4.9%）。总体加权PRS在家族性PF或无报告家族史的个体之间无显著差异。然而，所有患者组的PRS均显著高于人群对照组。结论 VUS仍占已知PF相关基因中罕见变异的主要部分。对于约80%有确认家族史的个体，在已知PF相关基因中未发现潜在致病变异，也没有证据表明高负担的常见变异对这些家庭的患病风险有贡献。同样，我们未发现证据表明高负担的常见变异对无报告家族史个体中PF风险的显著比例有贡献。 | |
| 使用LIBRA-seq绘制肾移植受者中BK多瘤病毒特异性B细胞反应图谱 | Marchand, S. | 2026-08-19 | BK多瘤病毒（BKPyV）是肾移植受者（KTR）中的主要并发症，目前尚无特异性抗病毒治疗可用。调整免疫抑制治疗可使大多数伴有BKPyV DNA血症的KTR清除病毒（控制者），但少数患者未能清除病毒（非控制者）。在此，我们将LIBRA-seq（一种将抗体序列数据与抗原特异性关联的技术）应用于四种BKPyV基因型的完整病毒衣壳，以研究和比较控制者（n=8）与非控制者（n=3）中BKPyV特异性B细胞库。共获得5197种BKPyV特异性抗体的序列，并通过ELISA和中和试验（n=24种抗体）验证了预测的抗原特异性。交叉反应模式在个体间具有可重复性，且所有患者均存在结合多种BKPyV基因型的B细胞。然而，富集表达广谱中和抗体的特定B细胞亚群仅占BKPyV特异性库的1.2%，且并非在所有患者样本中均检测到。广谱特异性和同型转换抗体的比例以及体细胞超突变率在峰值DNA血症后随时间增加，且在两组患者中相当，表明BKPyV非控制者所发起的体液反应不存在可识别的缺陷，并支持体液免疫单独不足以控制已建立的BKPyV复制的观点。这项工作表明LIBRA-seq可成功应用于完整病毒衣壳，并为在临床相关环境中分析抗病毒B细胞库和抗体特异性提供了框架。 | |
| 暴露于心理社会逆境的双胞胎表观遗传衰老提示性别特异性的情境结局 | Mposhi, A. | 2026-08-19 | 遗传背景是将心理社会逆境（PSA）与生物衰老联系起来的研究中的一个主要混杂因素，而很少有设计能完全控制它。我们使用了免疫双胞胎队列中针对PSA不一致的同卵双胞胎（MZ）对，以保持遗传背景恒定并直接分离其表观遗传特征。在28对PSA不一致的MZ双胞胎对（18对女性，10对男性）中，通过六个时钟（Horvath、Hannum、弹性网络、Levine、GrimAge v2、DunedinPACE）测量了表观遗传年龄加速（EAA），对内的PSA差异来自六份问卷，并使用逆境和精神病理学维度模型（DMAP）进一步解析为威胁和剥夺领域。在全样本中未出现组级EAA差异，但按性别分层分析则呈现不同情况。暴露于PSA的男性在Hannum、Levine和DunedinPACE时钟上相对于其基因相同的同卵双胞胎显示出降低的EAA；女性则无此类变化。然而，在对内，较大的PSA不一致性与女性中更高的EAA相关，这由羞耻感、负面生活事件和威胁驱动，而在男性中则与剥夺相关的EAA变化相关。由于同卵双胞胎共享基因型、发育时间及大部分早期环境，这些对内效应无法用遗传变异解释，反而指向一种真正性别特异、情境依赖的逆境生物嵌入。鉴于分层样本量较小，这些发现是初步的，但它们提供了迄今最清晰的证据之一，即在遗传背景保持恒定时，PSA留下的表观遗传足迹因性别而异。 | |
| 多基因风险评分对心血管疾病的预测：卒中幸存者中的风险因素控制与残余心血管风险 | Bragazzi, N. L. | 2026-08-19 | 背景：卒中仍是全球范围内导致死亡和长期残疾的主要原因，尽管采取了最佳的二级预防措施，幸存者中仍存在较高的残余血管风险。遗传性多基因风险对这一残余易感性的贡献尚不明确。方法：我们分析了来自英国生物银行的2,701名卒中幸存者（平均年龄59.8±7.1岁，61.7%为男性）。卒中及冠状动脉疾病（CAD）多基因风险评分（metaGRS），分别包含约320万和170万个遗传变异，基于大规模全基因组关联研究并使用惩罚回归方法得出。主要结局为主要不良心血管事件（MACE），次要结局包括卒中复发和血管危险因素控制。采用Cox模型检验metaGRS与MACE及卒中复发事件的关联，而基线危险因素控制的关联则通过逻辑回归评估。中介分析量化了metaGRS通过HbA1c、低密度脂蛋白胆固醇和血压对MACE的间接效应。结果：在12年间，共发生731例MACE事件（27.1%）和351例卒中复发事件（13.0%）。CAD-metaGRS与未来MACE独立相关（年龄和性别调整后的每标准差增加HR为1.15，95%CI 1.07-1.24；p<0.001），而较高的卒中及CAD metaGRS均与较差的血糖控制相关。较高的CAD-metaGRS也与较差的血脂控制相关。中介分析确定血糖调节是多基因风险与复发血管事件关联的重要通路。结论：心血管疾病的多基因风险评分与卒中幸存者的复发血管事件及血管危险因素控制相关，提示在二级预防中具有潜在可操作的见解，值得进一步研究。 | |
| 双动杯在后外侧入路初次全髋关节置换术后预防脱位的有效性及其与单极杯在老年患者中的成本效益比较。 | OLVG hospital, | 2026-08-19 | 理由：脱位是早期翻修手术的主要原因。为解决脱位问题，20世纪70年代在法国开发了双动性（DM）髋臼杯。该杯应提供更高的稳定性，并在生物力学上降低脱位风险。在荷兰，大多数DM杯用于特定患者，例如认知障碍患者以及因复发性脱位而进行翻修的患者。尽管DM杯使用增加，且在某些国家广泛使用，但缺乏其（成本）效果的高质量证据。本研究旨在通过试验填补这一知识空白。判断DM杯有效性所需的大部分信息已包含在荷兰关节成形术登记册（LROI）中。该登记册非常适合用于嵌套随机对照试验以实现此目标。目的：主要目的是调查在采用后外侧入路的初次全髋关节置换术（THA）中，使用DM杯与单极杯在老年患者术后1年时髋关节脱位数量是否存在差异。次要目的是：调查翻修数量是否存在差异；调查DM杯与单极杯在1年随访时的成本效果和成本效用；调查术后2年DM杯与单极杯之间髋关节脱位和翻修数量是否存在差异；调查术后1年和2年DM杯与单极杯之间患者报告结局是否存在差异；比较随机DM组患者与观察性队列DM组患者的髋关节脱位、翻修数量和PROM数据。最后，将基于LROI中登记的翻修和死亡率数据评估DM杯和单极杯的长期生存率。研究设计：在欧盟（EU）内进行前瞻性多中心国际、单盲RCT，嵌套在国家登记册中。研究人群：年龄[≥]70岁，接受择期初次THA的患者。干预（如适用）：干预组接受带双动性杯的THA，对照组接受带单极杯的THA。主要研究参数/终点：主要：脱位数量。次要：成本、患者报告结局和植入物生存率。 | |
| 评估主成分与混合模型方法对英国生物银行中多基因风险评分在不同祖先人群中可移植性的影响 | Harikrishnan, A. S. | 2026-08-19 | 多基因风险评分（PRS）在精准医学中具有巨大潜力。然而，当应用于与全基因组关联研究（GWAS）训练群体不同的群体时，其预测性能往往会减弱。这种可移植性问题有许多潜在来源，其中一个相对未被充分探索的贡献因素是GWAS汇总统计中残留混杂的存在。特别是，训练群体特有的混杂可能导致预测性能无法转移到其他群体，因此改善群体分层控制可能潜在地提高PRS的可移植性。在此，我们研究了通过纳入主成分和使用混合模型进行不同程度的群体分层调整，是否改变了英国生物银行中三个广泛祖先群体的PRS可移植性。PRS使用欧洲训练数据构建，针对冠状动脉疾病和2型糖尿病，随后在南亚、非洲和拉丁美洲参与者中进行评估。我们发现，增加主成分调整并未在祖先群体或表型间产生一致的可移植性趋势，尽管LDSC截距略有减少。然而，观察到对转移性的显著祖先和表型特异性效应。混合模型关联未显著改变PRS的区分度或可移植性。这些发现强调需要更好地理解PRS中残留混杂的性质，以及改善GWAS结果的因果有效性是否能最终提高预测准确性在不同群体间的转移性。 |