跳转至

2026-09-18 每日论文

来源 独立页面
arXiv arXiv
bioRxiv bioRxiv
medRxiv medRxiv

arXiv

标题 作者 发布日期 PDF链接 摘要
具有障碍感知约束装置的编码代理用于安全机器人操作 Bingxin Xu 2026-09-17 PDF 编码智能体已成为机器人操作领域一种颇具前景的范式:语言模型将机器人控制器编写为程序,以这种方式构建的智能体如今无需针对特定机器人进行训练即可操作机器人。然而,这一范式是否同样安全,尚未被追问。我们在安全约束下评估编码智能体,其中每个任务将一个操作目标与一个机器人不得触碰的障碍物配对。智能体追求目标,但在大多数情况下会与障碍物发生碰撞,将任务完成视为其唯一目标而忽视安全。智能体在其推理轨迹中会对障碍物进行推理,且提示词中已经禁止触碰它,因此无论是感知还是指令都没有过错;过错在于规划,其中所陈述的约束从未成为优先事项。通过将操作分解为路径阶段和接触密集时刻,我们定位了失败的根源。在路径上,模型无法将安全约束置于优先位置,因为它既没有畅通路径的概念,也没有在所选路径变得不可行时重新规划的概念。在接触时,它没有意识到接触执行同样受同一约束的约束。为弥合这一差距,我们提出 SafeHarness,它为模型配备了两个障碍物感知 harness,使其能够将安全约束置于优先位置。障碍物感知路径规划将物体作为边界框进行定位,并在其上以路点序列的形式绘制候选路径。随后,智能体提前规划一条路径,对其进行验证,必要时重新规划,然后才执行。障碍物感知接触执行则选择接触位置,使接触本身避开障碍物。SafeHarness 达到了 71.9% 的任务成功率和 87.5% 的避碰率,分别超过此前 SOTA 6.5% 和 27.0%。这些结果分别是同一智能体在没有 harness 时的 $2.3\times$ 和 $1.5\times$。
嵌入模型以独特的方式进行度量 Juri Opitz 2026-09-17 PDF 嵌入空间定义了语义相似性和距离的概念。我们研究这些嵌入是否反映了质量、距离、时间和体积的物理测量,这些测量具有唯一、客观的语义等价性和距离概念。我们发现物理测量在嵌入空间中仅被弱建模,相反可以观察到相当奇特的测量模式。进一步分析表明,物理测量的嵌入表示受到表面字符串相似性的强烈影响,而相似性的重新校准并未显著改善对齐。
工作空间模型:通过显著性驱动监督的轻量级机器人记忆 Nitish Dashora 2026-09-17 PDF 复杂的机器人操作任务通常需要对过去事件和动作的长期记忆。由于以完整历史为条件会使策略容易产生虚假关联并降低性能,许多策略记忆方法通过昂贵的VLM查询在环内压缩历史信息,仅处理任务显著信息。在本文中,我们提出了一种替代方法,在训练时进行计算密集的VLM查询,以学习一个轻量级的潜在记忆,该记忆可以在部署时高效查询。我们的表示,我们称之为\textbf{工作空间令牌},通过以下方式训练:(1)使用VLM识别完成任务所需的当前和历史信息,然后(2)使用集合重建解码器损失将这些信息蒸馏到工作空间令牌中。在仿真和硬件中,我们表明工作空间令牌可以在部署期间作为观测的即插即用替代品,使策略能够解决记忆密集型任务,而无需在环内进行VLM推理。有趣的是,我们发现工作空间令牌不仅更轻量,而且还能带来更好的策略性能。
4D基础模型能记住吗? Guangzhao He 2026-09-17 PDF 感知和记忆视觉世界是导航和与环境交互的基础。当前的4D基础模型,例如相机可控的视频模型或4D重建模型,能够感知和重建动态环境,但它们对已感知内容的记忆能力如何仍是一个未解问题。现有基准大多依赖像素级指标,并且缺乏物体离开视野后的真值,使其无法以物体为中心的方式对照参考来评估视觉记忆。为填补这一空白,我们提出了PersistBench,一个数据集和指标套件,利用360°视频作为全知真值,并提出三个评估方面:物体恒存性、运动连续性和外观保持性。跨多种类别评估各类模型后发现,当前模型只能维持短期一致性,一旦物体离开视野,这种一致性就会显著下降。我们的发现凸显了当前模型能力与稳健视觉记忆之间的差距(“看见并不等于记住”),为4D基础模型的未来发展提供了指导。数据集和代码可在项目页面获取:https://guangzhaohe.com/persistbench。
SplashSplat:从真实世界多视角视频重建飞溅液体 Peiyu Liu 2026-09-17 PDF 一次飞溅仅持续几分之一秒:液片撕裂成韧带和液滴,外观依赖视角且几乎没有纹理,几乎没有足够持久的东西可供追踪。因此,重建研究一直集中在烟雾、合成液体或缓慢变形的表面上。据我们所知,尚不存在同步多视角的飞溅液体数据集。因此,我们引入了一个包含20个真实场景的基准,从连贯水流到剧烈飞溅,由七台同步、标定的4K相机以60帧每秒拍摄,并带有手动精修的各视角液体和容器掩码以及固定的评估划分。我们进一步提出SplashSplat,其构建基于一个单一原则:仅在观测能够约束之处施加物理结构。从掩码融合得到的逐帧液体SDF提供几何,连续SDF之间的水平集传输产生粗略速度场,沿该流场平流的拉格朗日载体根据每个新观测进行校正,并在覆盖丢失处重新播种,解码局部高斯以进行可微渲染。SplashSplat在我们的真实捕获和一个合成基准上优于最先进的动态高斯泼溅方法,具有物理上更合理的运动和更低的训练成本。同一表示无需重新优化即可支持时间插值和风格迁移。
FAMOS:从稀疏观测中进行前馈三维关节建模 Kevin Qu 2026-09-17 PDF 从稀疏单目视角对铰接物体进行建模具有挑战性,因为每次观测只能揭示部分几何和运动证据。大多数前馈方法从单次观测推断铰接关系,因此严重依赖学习到的类别级形状先验。我们提出FAMOS,一种前馈模型,可从稀疏、无序的部分点云集合中预测可动部件分割和关节参数。我们的模型对多个观测进行联合推理,并自然支持可变数量的输入,包括单视角。为了跨观测聚合铰接线索,我们引入多状态铰接Transformer,采用交替的状态级注意力和全局注意力。我们进一步提出观测铰接跨度目标,用于监督每个部件在输入观测中所表现出的运动范围,鼓励模型充分利用整个观测集。为克服现有数据集规模和多样性的限制,我们引入程序化数据生成器,在训练期间合成自标注资产。在PartNet-Mobility、ACD和ArtiCraft-10K上的实验表明,相较于前馈和基于优化的基线方法均取得了一致改进。项目页面:https://kevinqu7.github.io/famos
Paint-Anything:面向图像生成与编辑的统一任意颜色控制 Ji Xie 2026-09-17 PDF 专业设计要求任意颜色控制:能够以任意24位十六进制值为对象指定目标颜色,用于图像生成和编辑。已有研究探索了颜色生成、编辑和着色,但通常依赖专用的颜色表示或专门的推理流程。大语言模型的进展提供了更简单的起点:即使是紧凑模型也能将十六进制值与颜色语义关联起来。我们提出Paint-Anything,通过对象级颜色监督学习用于生成和编辑的共享十六进制提示接口。我们开发了一条数据流水线,通过对象定位、感知颜色标注和编辑对合成,从真实图像构建Paint-500K。由于阴影使真实图像标签只能近似颜色,我们用纯色锚点补充这种监督,其像素与配对的十六进制值精确匹配。这些锚点仅在高噪声时间步使用,将低噪声训练留给自然图像。我们进一步引入任意颜色基准(ACBench),包括ACBench-T2I和ACBench-Edit,以衡量两个任务中对象级十六进制颜色保真度。在FLUX.2-4B上,Paint-Anything相对于基础模型将ACBench-T2I和ACBench-Edit分数分别提升85.3%和28.3%,消融实验支持该训练方案。在比较方法中,它还取得了最高的平均CompColor分数。
ERCPMP-Gx:用于结直肠息肉病形态学、组织病理学和基因组学表征的内镜图像与视频数据集 Zahra Ghaffari 2026-09-17 PDF 遗传性息肉病综合征可作为结直肠癌的前驱病变,并与广谱的结肠外肿瘤相关。对这些综合征的早期识别和准确分类对于及时诊断、个体化患者管理以及针对受影响家族的目标性监测策略至关重要。然而,公共内镜数据集大多围绕单个散发性息肉进行组织,且没有任何一个在患者层面将息肉病表型与组织病理学和胚系检测结果相关联。在此,我们提出ERCPMP-Gx,这是一个内镜、组织病理学和基因组数据集,旨在支持人工智能(AI)在结直肠息肉病的识别、表征和分类中的应用。大多数操作使用Olympus EVIS X1系统,采用白光内镜(WLE)、窄带成像(NBI)、放大NBI(M-NBI)以及带近焦模式的NBI,产生了160张图像及配套视频片段。约80%的病例代表临床和/或遗传学确诊的遗传性息肉病综合征(PG),包括家族性腺瘤性息肉病(FAP)、Peutz-Jeghers综合征(PJS)、幼年性息肉病综合征(JPS)和神经节细胞瘤综合征(GNS),而其余20%包括具有重叠形态特征的非遗传性息肉和息肉样病变(Non-PG),纳入以支持鉴别分类。每条发布的记录在可用的情况下均与标准化内镜标注、代表性组织病理学和临床报告的胚系检测结果相关联,形成一个AI就绪的患者层面标注框架。该数据集可在Mendeley公开获取(https://doi.org/10.17632/nzyfc544bx.2)。有关最新更新和更多信息,读者可参阅DataBioX网站:https://databiox.com。
分布偏移如何塑造神经偏微分方程代理模型中的预训练收益? Pochinapeddi Sai Bhargav 2026-09-17 PDF 预训练神经偏微分方程代理模型可以在几何形状或建模物理发生变化时减少所需的新计算流体力学数据量。然而,分布偏移的不同组成部分如何影响这一收益仍不清楚。我们在一个翼型族的254,909个RANS解上预训练代理模型,并在两个匹配来流范围的目标设置下,将其微调到一个新的翼型族:相同的Spalart-Allmaras(SA)建模,以及加入$e^N$转捩建模的SA。在$N=1000$时,预训练模型在相同SA目标上达到了从头训练模型使用$3.25\times$样本量的精度,而在转捩建模目标上则需要$2.58\times$样本量。到$N=5000$时,这一排序发生反转($1.56\times$对$1.86\times$)。在$N=1000$时,采样更多不同翼型会降低两个目标上的误差,但只有在相同SA目标上,增益的增加大于观测到的抽样间波动($3.3\times$到$4.0\times$)。这些结果表明,预训练价值联合取决于目标数据预算、目标数据覆盖范围,以及源域与目标域是否在建模物理上存在差异。
量化前沿LLM智能体的过度声称倾向 Nolan Smyth 2026-09-17 PDF 前沿编码智能体正日益被信任能够长时间自主工作,然而智能体的最终回复往往是用户所能看到的关于其工作的唯一说明。我们量化了前沿智能体夸大任务完成情况的倾向,这种虚假陈述可能误导用户。当智能体的最终回复与其上下文中的信息相矛盾时,即为夸大。这一定义无需推断意图,且独立于任务是否成功。我们提出了OverclaimBench,一个由五个文件审查场景、基于转录的覆盖度测量以及已注册的植入缺陷组成的评估套件。我们在其各自的生产命令行界面中评估了八个专有前沿模型,并在单一固定测试框架下评估了四个开放权重模型,在OverclaimBench上发现:1)在67.9%的运行中,智能体并未阅读所有被要求审查的文件;2)在未阅读所有文件的运行中,智能体有80.4%的时间具有误导性(各模型为59–96%),要么虚假声称已阅读所有文件,要么遗漏了覆盖不完整这一事实;3)要求委派给子智能体提高了阅读覆盖度,但在仍然不完整的审查中,绝大多数仍具有误导性;4)虚假声称完成完整审查的智能体遗漏植入缺陷的比率约为阅读了每个文件的智能体的1.8倍,表明完成声明可能掩盖实质性失败。总之,这些结果表明,智能体的最终回复并非其行动的可信说明。

bioRxiv

标题 作者 发布日期 PDF链接 摘要
瞳孔大小和瞳孔变化在整个成年生命周期中与不同的皮层神经化学系统相关 Riley, E. 2026-09-18 PDF 瞳孔测量常被用作蓝斑(LC)活动的替代指标,但这种关系是否随生命周期而变化尚不清楚,而由于已知LC生物学随年龄变化,确立这一点十分重要。我们在89名19至78岁的成年人执行视觉oddball任务时,同步采集了瞳孔测量和多回波fMRI数据。oddball诱发的瞳孔反应在所有年龄组中都很稳健,但在中年组最强。oddball诱发的LC BOLD反应相对较弱,且不能预测个体瞳孔反应,因此我们刻画了全脑范围内的瞳孔-BOLD耦合。瞳孔大小及其一阶导数在不同时间尺度(2.25秒和5.00秒)和不同空间模式上与BOLD相关。与19个PET图谱对比,导数耦合与去甲肾上腺素转运体(NET)密度独特相关,而大小独特耦合与μ阿片(MOR)和大麻素CB1密度相关。只有瞳孔导数特异性的BOLD活动关系(耦合范围和与NET的关联)随年龄减弱,尽管二者仍然显著;其他瞳孔-BOLD关系未随年龄不同。因此,瞳孔大小和瞳孔变化在整个生命周期中携带关于皮层活动的不同信息。
长双歧杆菌nexti亚种的发现、功能及全球动态:婴儿肠道中一种新型降解淀粉的亚种 Ennis, D. 2026-09-18 PDF 长双歧杆菌是婴儿肠道微生物组中一个基础且遗传多样的成员,但在宏基因组数据中解析其亚种仍然具有挑战性。在此,我们利用来自LLNEXT母婴队列的4,577份粪便宏基因组以及包含1,220个基因组和宏基因组组装基因组(MAGs)的全球数据集,对长双歧杆菌物种进行了深入的系统发育表征。我们鉴定出一个新的、地理分布广泛的谱系:长双歧杆菌nexti亚种。通过多相分类分析,包括平均核苷酸同一性和数字DNA-DNA杂交,确认了其亚种水平的分化。与长双歧杆菌物种的其他成员不同,BL. nexti携带α-淀粉普鲁兰酶,并能在可溶性淀粉和通常普鲁兰多糖上生长,这与α-葡聚糖利用一致。在LLNEXT队列中,BL. nexti在配方奶喂养的婴儿中富集,并显示出与垂直传播一致的证据。在全球范围内,尽管BL. nexti地理分布广泛,但它在不同人群中通常以较低的相对丰度持续存在。通过解析此前未分类的长双歧杆菌多样性的主要部分,本研究为驱动发育中婴儿微生物组组装的特殊谱系和生态动态提供了新的见解。
LLMsFold:整合大型语言模型与生物物理模拟进行从头药物设计 Waththe Liyanage, W. W. 2026-09-18 PDF 新小分子的发现具有挑战性,原因在于化学空间的广阔性和蛋白质-配体相互作用的复杂性,导致成功率低且工作流程耗时。在此,我们提出LLMsFold,一个结合大语言模型(LLMs)和生物物理基础工具的计算框架,用于设计和验证靶向致病蛋白的新小分子。该流程首先通过基于几何的口袋检测识别靶蛋白上可行的结合口袋。随后,来自LlaMA家族的700亿参数Transformer模型在强制药物相似性的提示约束下生成候选分子作为SMILES字符串。每个分子由Boltz-2评估,这是一个基于扩散的蛋白质-配体共折叠模型,可预测结合态3D结构和结合亲和力。有前景的候选分子通过强化学习循环进行迭代优化,该循环优先考虑高预测亲和力和合成可及性。我们在两个具有挑战性的靶点上展示了该方法:ACVR1(激活素A受体1型),与进行性骨化性纤维发育不良(FOP)相关;以及CD19,一种在大多数B细胞淋巴瘤和白血病细胞上表达的表面抗原。最优候选分子显示出强计算机结合预测和良好的类药物特征。所有代码和模型均已公开,以支持可重复性和进一步开发。
OpenAntigens:一个结构感知的数据库,用于跨人类细胞表面和分泌蛋白质组的抗原构建体设计 Teixeira, A. A. R. 2026-09-18 PDF 在抗体发现、重组试剂制备、结构生物学和计算结合剂设计中,选择蛋白质的哪个区域进行表达仍然缺乏标准化。对于人类细胞表面蛋白和分泌蛋白,这需要在订购DNA之前综合考虑拓扑结构、加工过程、预测和实验结构、修饰、相互作用伙伴、直系同源物、旁系同源物以及交叉反应风险。OpenAntigens是一个免费、无需登录的数据库,包含5328个人类分泌蛋白、GPI锚定蛋白、单次跨膜和多次跨膜蛋白的构建体设计报告。它整合了UniProt拓扑结构、AlphaFold pLDDT和PAE、PDB先例、InterPro和Pfam结构域、小鼠和食蟹猴直系同源物、旁系同源物和家族背景、Open Targets疾病关联、伙伴和组装背景以及BLAST搜索。它提供55305个构建体建议,涵盖完整设计区域、PDB支持的边界、注释结构域、pLDDT/PAE衍生区域和膜表达选项,另有148722个序列相似性命中,帮助选择构建体和评估交叉反应性。对于具有兼容AlphaFold模型的靶标,交互式设计器将序列、结构、pLDDT和PAE关联起来,允许用户修改边界并导出物种等效序列,同时提供实时半胱氨酸和修饰警告。OpenAntigens将可重复的构建体建议、比较背景和浏览器编辑整合在一个工作流程中,减少了跨资源的手动协调。OpenAntigens可在openantigens.org获取。
Rossmann2x2折叠通过一个由顺序且协同的折叠单元组成的确定途径获得其天然结构 Sosa, R. 2026-09-18 PDF 尽管在预测蛋白质结构方面取得了进展,但蛋白质如何达到其天然状态仍然是一个持续争论的话题。我们提出了一项关于保守的Rossmann2x2折叠的单分子力谱研究。利用新型单分子方法,我们实时追踪并标注了Ross——这一拓扑结构的代表——的去折叠和再折叠中间体。该蛋白质沿一条单一的可逆途径折叠,涉及离散且协同的折叠单元或折叠子的有序和顺序组织。这种严格的事件顺序源于一个初始的、自主折叠单元(主要折叠子)的形成,随后是次级折叠子的组织,其次级折叠子的稳定性取决于它们与先前已组织折叠子的相互作用。这一过程如果被普遍化,将极大地简化蛋白质折叠机制,因为在自然界中识别折叠子及其折叠层级,应能允许从序列预测任何天然蛋白质的折叠途径。
脂质偶联对大肠杆菌和哺乳动物细胞胞质积累的结构依赖性效应 Coffin, D. J. 2026-09-18 PDF 脂化是一种广泛使用的促进膜渗透的策略,但支配脂质驱动积累的因素在哺乳动物和革兰氏阴性菌包膜之间是否共享仍未解决。在此,我们将基于氯代烷叠氮的膜穿透(CHAMP)测定应用于在HeLa细胞和大肠杆菌细胞中系统设计的脂质偶联物文库。CHAMP由我们课题组开发,将一个干扰性最小的叠氮标签与胞质锚定的HaloTag配对,以直接定量胞质积累。两种系统显示出不同的趋势:大多数脂质修饰降低了大肠杆菌的胞质积累,而更大、更疏水的偶联物,包括中链、环化和含杂原子的脂质,则优先被哺乳动物细胞内化。通过系统地编辑化合物骨架,并单独扰动细菌包膜的各个层,我们解析了电荷、骨架组成和特定包膜屏障如何塑造这些模式。总之,这些结果表明脂化是一种情境依赖性的渗透策略,而非普遍适用的策略。通过表明疏水修饰经常阻碍进入大肠杆菌胞质,这项工作为具有胞质靶点的脂化抗菌药物稀缺提供了一种基于通透性的假说,并划定了在双层包膜中亲脂性驱动的优化可能失败之处。
脑损伤与行为之间映射的无监督学习 Wahle, I. A. 2026-09-18 PDF 人类病变研究为在实验干预受到高度限制的情况下,探讨脑区与行为结果之间的关系提供了最直接的途径之一。然而,这些研究面临一个重大挑战,即在识别特定脑区病变与特定行为结果之间的关系时,如何确定脑区和行为结果应被分析的适当粒度水平。在此,我们展示了一种新的数据驱动方法——因果特征学习(Causal Feature Learning, CFL),它能够同时学习适当的分析层次以及病变与认知障碍之间的关系。该方法避免了先验地指定脑区和具体的结果测量指标,从而有助于发现新的交叉性病变-行为映射。我们表明,在典型相关分析(Canonical Correlation Analysis)无法提供可解释结果的模拟数据集中,CFL能够稳健地恢复病变行为映射。随后,我们表明,CFL利用一个大型病变被试数据集,能够恢复已知的语言缺陷和视空间加工方面的病变-行为映射,并且我们展示了如何使用CFL在将病变映射到抑郁症状时识别新的结果分组。
精神分裂症中的GABA能中间神经元病理学:一项跨细胞类型、脑区和皮层分层的系统综述与荟萃分析 Mulvey, A. G. 2026-09-18 PDF 引言 伽马氨基丁酸能中间神经元被认为参与精神分裂症的病理生理过程,但关于不同脑区和中间神经元亚型缺陷性质的证据仍存在矛盾。我们采用元分析、多层次线性建模方法,以识别精神分裂症中涉及的中间神经元、皮层层次和脑区,以及对环路功能的影响。方法 遵循PRISMA指南,我们进行了从建库至2025年11月的系统检索和元分析,纳入研究精神分裂症中小白蛋白、生长抑素、钙结合蛋白和钙视网膜蛋白中间神经元密度或mRNA表达的研究。我们纳入了44项研究的数据,包括736名精神分裂症患者和814名健康对照。排除非细胞特异性、非人类或间接替代研究。线性混合效应模型在考虑皮层层次、细胞类型和脑区的同时量化缺陷,提供了中间神经元病理图谱。我们进一步分析伽马氨基丁酸能中间神经元的变化,以确定缺陷是否优先靶向与自上而下或自下而上加工更相关的皮层层次、细胞类型和脑区。结果 小白蛋白和生长抑素中间神经元显示显著减少,尤其是在第3/4层,而钙结合蛋白和钙视网膜蛋白中间神经元受影响较小。缺陷广泛分布于皮层和皮层下区域。对比分析显示,精神分裂症的特征是中间神经元缺陷优先影响自下而上信号传导——特别是第3/4层的小白蛋白和生长抑素中间神经元,这些神经元对伽马波段同步和前馈感觉加工至关重要。讨论 这些发现提供了迄今为止关于精神分裂症中伽马氨基丁酸能中间神经元最全面的元分析,以及关于环路功能障碍的新视角,并对计算模型具有启示意义。这些结果强调需要使用能够以分子层面更精确方式定位缺陷的方法,在整个大脑中进行更广泛的采样。
溶酶体pH的耗散会损害巨噬细胞中LPS诱导的溶酶体小管的形成并使已存在的溶酶体小管崩解。 Anwar, S. 2026-09-18 PDF 溶酶体降解被靶向处置的细胞外和细胞内物质。溶酶体呈现由V-ATPase建立的酸性环境,该环境促进这种水解活性并为膜运输提供动力。有趣的是,虽然溶酶体通常呈球形形态,但脂多糖激活的巨噬细胞将溶酶体重组为扩展的管状网络。这一管状化过程需要微管、动力蛋白和驱动蛋白马达,以及Rab7和Arl8b GTP酶。在此,我们试图确定V-ATPase和溶酶体pH是否对巨噬细胞中LPS介导的溶酶体管状化重要。我们发现抑制V-ATPase阻止了溶酶体管状化并使预先形成的管状结构崩溃。然而,V-ATPase也控制mTORC1活性,而mTORC1本身是管状化所需的。为了区分溶酶体pH和mTORC1,我们转向NH4Cl。NH4Cl碱化溶酶体pH但不干扰mTORC1活性;然而NH4Cl阻断了溶酶体管状化,表明酸性溶酶体pH是溶酶体重塑所必需的。此外,将pH钳制到酸性或碱性pH值均导致管状结构崩溃,表明pH梯度促进管状化,而非特定的pH值。为了更好地理解溶酶体pH如何帮助溶酶体管状化,我们检查了微管组织和溶酶体运动;消除酸性溶酶体pH并未改变这些特性,表明马达仍与溶酶体相关联。另一方面,虽然LPS未改变球形或管状溶酶体的平均pH,但生长中的管状结构相对于近中心端显示出更酸性的外周端。基于这一观察,我们提出沿管状结构的局部pH梯度可能通过调节催化管状生长的因子来实现管状化。
不完整的参考文献使批量去卷积目标不可识别,但识别具有可计算的精度代价 Jiang, H. 2026-09-18 PDF 背景。基于参考的去卷积从混合样本谱中估计细胞类型比例。不完整的参考会损害这些估计,但许多补救方法只返回点估计。我们将重现估计的算子来源与识别其目标的信息和精度区分开来。结果。在一个缩减参考下的两个算子历史给出不同的估计量:196420个样本-删除对中有28.2%的总变差差异大于0.1;锁定每个学习组件使路径完全相同。在九个队列中,算子历史逆转了952个关联符号中的160个,其中31个具有显著路径,并改变了126个的显著性。观测等价的补全可以填充开放单纯形并逆转保留类型的排序。在联合零暴露条件下,共享结构使继承的边界保持不变;一到六个未校准视图也给出了相同的边界。一个谱库将估计量输出包络收缩了98.93%,却覆盖了42.77%的全参考效应,并有19个错误符号证书;条件锐边界保持在[-1, 1]。将RNA产量视为精确值会把区间坍缩为点,而这些点不覆盖七个流量测量的目标中的任何一个:没有覆盖的收缩是虚假的确定性。校准的跨模态锚点在六种类型下将宽度收缩到0.51,但不证明任何有效符号。精确的RNA产量从RNA贡献中识别细胞分数;血液中的决定性符号需要{+/-}2.6%的代理精度,并几乎完全收缩供体异质性和动态范围包络。结论。不完整参考去卷积是一个识别问题,而不仅仅是估计问题。补救方法必须根据收缩、覆盖、认证和针对留出目标的错误认证来评分。fitdrop实现了这种评分以及用于规划决定性测量的精度前沿。

medRxiv

标题 作者 发布日期 PDF链接 摘要
无保护接触:尼日利亚母婴阻断 cascade 中产前检查率高、乙肝检测极少——距离消除还有多远? Abanni, S. I. 2026-09-18 PDF 乙型肝炎是肝癌最主要的可预防病因之一,在高负担地区,大多数慢性感染是在围产期获得的。尼日利亚承担着非洲最重的乙型肝炎负担。预防母婴传播需要一系列产前步骤:检测孕妇、根据结果采取行动、为新生儿接种疫苗。目前尚无全国代表性研究将这些步骤整合为一条单一的预防级联。我们构建了尼日利亚首个全国性乙型肝炎母婴预防级联,并测量了其与世界卫生组织三重消除目标的差距。我们分析了2023-24年尼日利亚人口与健康调查,这是尼日利亚首个同时包含孕产妇乙型肝炎模块和婴儿出生剂量记录的调查。在13,341名过去三年内最近一次活产的女性中,每人与其孩子的免疫接种记录相关联,我们使用复杂抽样方法估算了级联各步骤的覆盖率(产前保健就诊、产前保健中的乙型肝炎检测、收到结果以及婴儿出生剂量),并考察了其与财富、教育、居住地、出行时间和地区的分布模式。尽管72%的母亲接受了产前保健,但仅12.3%(95% CI 11.4-13.2)在那里接受了乙型肝炎检测,而在少数接受检测者中几乎所有人都收到了结果:损失发生在检测环节,而非结果反馈环节。婴儿出生剂量覆盖率为55.0%(53.1-56.9),低于目标35个百分点,且其水平与母亲是否接受检测无关,这与普遍、非靶向接种的做法一致;分娩地点而非母亲检测是婴儿获得出生剂量的主要相关因素。两个步骤均呈现明显的梯度分布:产前检测率从最贫困财富五分位数的2.6%到最富裕的32.4%不等,且在西北区最低,而该区是尼日利亚患病率最高的地区。尼日利亚已经通过产前保健覆盖了大多数母亲,但很少利用这一接触机会进行乙型肝炎检测,且普遍出生剂量仅完成一半。该国远未达到消除目标,且在病毒最流行的地区差距最大。将乙型肝炎检测整合入产前保健,使其免费并向高负担的北部倾斜,将把已经实现的接触转化为保护。
南非农村和城市地区体重不足和超重青少年女孩的DXA衍生身体成分与血压 Crouch, S. H. 2026-09-18 PDF 背景:青少年期血压升高是心血管风险的早期标志,尤其是在同时经历营养不足和营养过剩的环境中。然而,在营养极端情况下,详细身体成分与血压之间的关系仍知之甚少。我们研究了南非体重不足和超重青春期女孩中,双能X线吸收法(DXA)衍生的身体成分与血压之间的关联,以评估血压的多层次相关因素。方法:Ntshembo试验纳入了1268名13-19岁女孩,分别来自农村Agincourt和城市Soweto。参与者被选为体重不足或超重。血压在单次访视中测量三次,并分类为临床血压类别范围。DXA提供了脂肪量(FM)、去脂软组织量(FFSTM)及相关指数的测量。结果:平均收缩压和舒张压分别为110.0{+/-}11.2mmHg和68.7{+/-}8.2mmHg;21.1%的参与者血压处于升高或高血压范围。与体重不足青少年相比,超重青少年的收缩压和血压类别更高。DXA衍生的肥胖指标与收缩压和血压类别呈正相关。FFSTM与收缩压显示强关联。较高的FM/FFSTM与血压升高(RRR=4.25,95%CI:1.77-10.20)和高血压范围血压(RRR=19.04,95%CI:6.43?56.40)相关。照护者高血压范围血压与青少年高血压范围血压独立相关(RRR=1.72-1.82)。久坐行为与血压升高独立相关,突出了一个可改变的行为目标以及代际风险。关联在收缩压方面比舒张压更为一致。结论:FM和FFSTM均与血压呈正相关,尤其是收缩压。区域百分比分析与以下情况一致:当总脂肪更多分布于中心而非外周时,血压更高。
血尿素氮与白蛋白比值和肾结石之间的关联:基于NHANES的横断面研究 Zhu, F. 2026-09-18 PDF 肾结石是一种疾病,其中尿液中的溶质沉淀在泌尿空间中形成结晶聚集体。血尿素氮与白蛋白比值(BAR)作为一种常见的炎症指标,其与肾结石的关联尚不明确。利用NHANES 2007-2020数据,我们比较了肾结石患者与对照组的基线特征,并通过加权多因素logistic回归(WMLR)、限制性立方样条(RCS)、分层分析和XGBoost评估了BAR与结石的关系,并在一个独立外部队列中进行了验证。包括BAR和年龄在内的20个基线特征在两组间存在显著差异(P < 0.05)。在所有WMLR模型中,BAR与肾结石风险呈正向非线性关联(OR > 1,P < 0.05)。亚组分析显示,在女性(OR = 1.10,P < 0.001)、低维生素A摄入(OR = 1.10,P < 0.001)、高饮水量(OR = 1.11,P < 0.001)、年龄< 50岁(OR = 1.14,P < 0.01)以及受教育程度低于高中(OR = 1.11,P < 0.01)的人群中关联稳定。XGBoost识别出BAR和饮水量为突出的危险因素(AUC = 0.658)。外部验证证实了正向关联(模型1 OR = 1.029,95% CI 1.016-1.043;模型2 OR = 1.030,95% CI 1.016-1.044;模型3 OR = 1.029,95% CI 1.015-1.045;均P < 0.001),RCS证实了非线性剂量-反应关系(非线性P = 0.0006)。年龄[≥] 60岁、男性和女性亚组均显示出显著关联(ORs = 1.027-1.034)。在XGBoost中,BAR是最重要的预测因子(Gain = 0.265)。这些发现揭示了BAR与肾结石之间的显著关联,为预防和风险分层提供了理论见解;BAR可能作为肾结石管理中的一个有价值标志物。
美国成年人中戊型肝炎病毒免疫球蛋白G血清阳性与肾功能障碍 Abu Saadeh, A. 2026-09-18 PDF 背景 戊型肝炎病毒感染在特定临床人群中与肾脏表现相关。既往暴露的血清学证据是否与普通人群的肾功能障碍相关仍不确定。方法 我们对2009-2018年以及2021年8月至2023年8月的六个美国国家健康与营养调查周期进行了横断面分析。纳入年龄[≥]20岁、具有有效戊型肝炎病毒免疫球蛋白G水平、血清肌酐水平、尿白蛋白与肌酐比值以及协变量数据的成年人。结局包括估算肾小球滤过率降低(<60 mL/min/1.73 m2)、白蛋白尿(白蛋白与肌酐比值[≥]30 mg/g [3.39 mg/mmol])及其复合结局。调查加权logistic回归模型包括未调整模型、调整年龄和性别的模型,以及进一步调整人口学和临床协变量的模型。结果 在30,428名成年人中,2,911名为血清阳性;加权血清阳性率为8.29%。血清阳性参与者比血清阴性参与者年龄更大(加权均值,60.7岁对46.5岁)。在未调整分析中,血清阳性与所有三项二分类结局均相关,但在调整年龄和性别后,估计值接近无效值。完全调整后的比值比分别为:滤过率降低0.99(95%置信区间,0.85-1.16),白蛋白尿1.05(0.91-1.22),复合肾功能障碍1.05(0.93-1.19)。在一项二次分析中,血清阳性与调整后平均滤过率高出1.57 mL/min/1.73 m2相关(95%置信区间,0.71-2.43)。结论 调整后,戊型肝炎病毒免疫球蛋白G血清阳性与二分类肾脏结局无显著相关。衰减主要发生在调整年龄和性别之后。这些发现并不能确定不存在关联,也未涉及活动性或持续性感染期间的肾损伤。
乳腺癌治疗期间的膳食摄入及其与乳腺癌女性心脏代谢风险标志物变化和心理结局的关联:一项前瞻性队列研究方案 Asbaghi, O. 2026-09-18 PDF 背景:全身积极治疗,包括单纯化疗或联合HER2靶向治疗,是乳腺癌管理的基石,但常引发不良的心血管代谢、人体测量学和心理紊乱。尽管积极治疗期间的膳食摄入可能调节这些并发症,但利用重复膳食评估和标准化临床终点的严格前瞻性队列证据仍然有限。目的:本前瞻性队列研究的主要目的是探讨乳腺癌女性在积极癌症治疗期间的膳食摄入与内脏脂肪指数(VAI)变化之间的纵向关联,VAI作为主要心血管代谢终点。次要目的是检查膳食暴露与个体心血管代谢标志物、身体成分、心理困扰和健康相关生活质量之间的关联。方法:在伊朗德黑兰招募100名经组织学确诊为原发性乳腺癌的女性组成前瞻性队列,在全身治疗开始时入组,并前瞻性随访六个月。该队列涵盖接受标准化疗方案(持续4.5至6个月)的患者,包括接受序贯HER2靶向治疗的患者。积极治疗期间的 habitual 膳食摄入通过九份24小时膳食记录进行评估,这些记录系统地分布在治疗早期、中期和晚期阶段(包括工作日和周末)。临床、人体测量学、生化和心理结局在基线(治疗前)和6个月随访时进行评估。主要多变量线性回归模型将6个月时的VAI指定为因变量,并调整其基线水平、年龄、基线体重指数、肿瘤分期、积极治疗方案、随访期体力活动和总能量摄入。次要分析将评估关键次要心血管代谢参数、心理结局和探索性研究结束时血清25-羟基维生素D浓度。回归结果将报告为未标准化系数(B)及95%置信区间和标准化系数({beta})。结论:本前瞻性方案概述了一种标准化方法,以确定积极全身治疗期间的膳食摄入是否与不良心血管代谢轨迹和心理负担相关,从而为积极乳腺癌治疗期间量身定制的营养干预提供关键证据。
物质使用障碍位点的共享和独特染色质可及性及三维功能相互作用暗示了大脑以外的细胞类型 Trang, K. B. 2026-09-18 PDF 目的:近期全基因组关联研究(GWAS)已揭示物质使用障碍(SUDs)的多个位点,包括有证据表明这些性状在遗传病因学上存在重叠。然而,潜在的SUD因果变异、效应基因和细胞背景的范围仍不清楚。近期胰高血糖素样肽-1(GLP-1)受体激动剂的临床试验已显示出对酒精和烟草消费的有希望效果,这引发了SUD遗传风险是否存在于代谢细胞类型以及神经细胞类型中的问题。我们试图绘制四种SUD的细胞类型特异性遗传结构,并检验观察到的代谢富集是否反映了与2型糖尿病(T2D)共享的因果生物学。方法:我们将来自59种多样化人类细胞类型的3D基因组数据集(高分辨率启动子聚焦Capture-C/Hi-C、ATAC-seq、RNA-seq)与近期针对酒精(AUD)、烟草(TUD)、阿片类(OUD)和大麻使用障碍(CanUD)的GWAS汇总统计量整合,使用分层LD回归(S-LDSC)。我们进行了SUD与T2D之间的局部遗传相关分析(LAVA),对共享位点处的基因表达和染色质可及性进行了多变量整合(DIABLO),并随后进行双向两样本孟德尔随机化(MR),以检验T2D与每种SUD之间的因果关系。结果:在按性状进行错误发现率(FDR)校正后,TUD在胰腺{beta}细胞(4.6倍)、-细胞(4.0倍)、下丘脑神经元和iPSC衍生神经元中显示出显著的遗传力富集。CanUD显示出FDR显著的富集,集中在下丘脑神经祖细胞中(7.4倍)。LAVA识别出1,550个具有显著局部遗传相关的位点,其中114个特异性地位于T2D与至少一种SUD之间。随后的MR揭示,T2D的遗传易感性对AUD具有保护作用(逆方差加权{beta} = -0.027,P值 = 1.6x10-5,463个工具变量),在五种MR方法中的四种中一致,并且不存在方向性多效性。细胞-细胞相互作用建模表明,每种SUD扰乱了不同的神经-内分泌信号轴。
探索社交网络在赞比亚卢萨卡青少年和年轻人中影响性传播感染披露的作用,运用健康行为模型。 Witola, G. 2026-09-18 PDF 披露性传播感染(STIs)是性传播感染预防和控制的一项关键策略。然而,对于15-24岁的青少年和年轻人(AYP)而言,披露仍然是一项挑战,通常受到多种动态因素的影响,这些因素塑造了AYP是否披露以及向谁披露的选择。本研究旨在利用能力、机会和动机-行为(COM-B)模型,在赞比亚卢萨卡了解哪些因素影响了AYP披露其性传播感染状况以及向谁披露的决定。这项定性研究于2024年4月至8月开展,包括对参与横断面性传播感染患病率调查的AYP进行的二十次深度访谈,其中包括被诊断患有性传播感染者、自我报告性传播感染症状者,以及报告曾经接受过治疗者(无论是否有症状)。此外,还开展了五次与AYP的焦点小组讨论(FGDs),以及另外六次与社区成员的焦点小组讨论。随后使用COM-B模型对数据进行了主题分析。披露的能力受到AYP对性传播感染知识有限的影響。披露的物理机会受到青年友好型性与生殖健康(SRH)服务的可获得性和可及性的影响,而社区和自我污名,以及人际关系和家庭动态也影响了AYP披露其性传播感染状况的社会机会。披露的动机受到对自身整体健康的关切、个人价值观和信念,以及在感染性传播感染时寻求支持的需要的影响。然而,对负面反应的恐惧降低了AYP披露其性传播感染状况的动机和意愿。AYP披露性传播感染诊断的决定受到个人和社会影响网络的塑造。社会支持在披露中发挥着重要作用,支持性的社会网络促进了这一过程,从而鼓励个人寻求治疗。性传播感染干预措施不仅应关注个人,还应致力于提高性传播感染意识、减少污名,并利用更广泛社区背景中现有的社会支持。
室间隔心肌消融术与改良Morrow心肌切除术治疗梗阻性肥厚型心肌病:1年血流动力学与传导结局 Jiao, J. 2026-09-18 PDF 背景:在梗阻性肥厚型心肌病中,外科心肌切除术高度有效,但存在公认的术后传导障碍风险。经皮心肌内室间隔射频消融术(Liwen 手术)是一种创伤更小的替代方案,但关于纵向血流动力学轨迹和传导系统安全性的头对头比较仍然很少,限制了循证治疗选择。方法:这项单中心回顾性队列纳入 2018 年至 2023 年接受治疗的 211 例患者(124 例 Liwen,87 例改良 Morrow 心肌切除术)。主要纵向分析纳入 133 例具有 1 年随访和连续数据的患者(75 例 Liwen,58 例改良 Morrow 心肌切除术)。重复结局采用线性混合效应模型和广义估计方程进行分析,并针对基线协变量进行调整。结果:两种手术均降低了 LVOT 压差,但轨迹不同(交互作用 P=0.002)。1 年时,协变量调整后的平均 LVOT 压差在 Liwen 术后仍高于心肌切除术后(16.1 对 1.3 mmHg,P<0.001)。然而,调整后 1 年新发传导异常预测概率在 Liwen 术后明显更低(5% 对 62%,P<0.001),Liwen 组无永久起搏器植入。两组中大多数患者均达到压差 <30 mmHg(82% 对 96%;名义 P=0.308)。Liwen 的手术时间更短(80 对 185 分钟),住院时间更短(11 对 16 天)。严重不良事件发生率相似(8.1% 对 9.2%),但事件特征不同。结论:改良 Morrow 心肌切除术在 1 年时实现了更完全的 LVOT 压差降低,而 Liwen 消融术的传导异常更少、手术时间更短、住院时间更短。这些发现突出了更完全的血流动力学缓解与更低的传导系统损伤之间具有临床相关性的权衡,需要前瞻性研究确认。
特里布万大学教学医院普通健康检查人群中幽门螺杆菌感染与血脂异常的相关性。 Man Shrestha, T. 2026-09-18 PDF 背景 幽门螺杆菌是一种高度流行的慢性感染,可诱导持续性胃部炎症,并日益被认为与脂质代谢改变有关。多项研究表明幽门螺杆菌感染与血脂异常之间存在关联,可能促进动脉粥样硬化和心血管疾病;然而,研究结果仍不一致,因果关系存在争议。目的 本研究旨在确定幽门螺杆菌感染与血脂异常之间的关联。材料与方法 本研究是一项在尼泊尔加德满都特里布万大学教学医院(TUTH)进行的横断面研究,该医院为三级转诊中心。研究对医生在一般健康检查(GHC)门诊收集的记录进行了回顾性分析。数据从已有的医疗记录中回顾性收集。研究人群包括在研究期间有记录的幽门螺杆菌血清学状态且有可用血脂谱结果的患者。使用根据文献改编的预测试标准化问卷收集人口学特征、临床表现、用药情况、生活方式因素和已知合并症的信息。人体测量采用标准化方法。体重指数(BMI)按体重(kg)除以身高(m2)的平方计算。结果 本研究共纳入242名参与者,并根据幽门螺杆菌血清学将其分为三组——血清阴性、不确定和血清阳性。在研究中,BMI和体重与LDL(r = 0.208,p = 0.008)和总胆固醇(r = 0.187,p = 0.017)呈显著正相关。体重与总胆固醇呈正相关(r = 0.204,p = 0.009)。空腹血糖与脂质参数之间未观察到显著相关性,提示幽门螺杆菌感染可能与体重增加有关,但与明显的高血糖无关。本研究结果显示,有和无幽门螺杆菌感染者的平均空腹血糖(FBS)水平无统计学显著差异。(FBG:血清阴性参与者为5.37 {+/-} 1.20 mmol/L,不确定参与者为5.29 {+/-} 0.93 mmol/L,血清阳性参与者为5.56 {+/-} 0.92 mmol/L(p = 0.347))。在其他危险因素中,发现男性与幽门螺杆菌感染之间存在显著关联(幽门螺杆菌血清阳性男性(49.1%)与血清阴性男性(26.5%)相比,p = 0.004)。幽门螺杆菌检测阳性患者的吸烟状况无显著差异,饮酒显示出弱相关性(P=0.064)。结论 研究结果表明,幽门螺杆菌血清阳性与较高的体重和血脂异常显著相关,尤其是总胆固醇和LDL胆固醇水平升高,突出了对幽门螺杆菌阳性患者进行血脂筛查和减重的重要性。
长期使用一款电子游戏疗法未发现游戏相关问题增加的证据:一项随机对照试验的探索性终点发现 Lukka, L. 2026-09-18 PDF 用于心理健康的数字疗法常面临患者参与度低的问题,这限制了其临床效果。使用电子游戏媒介提供治疗的干预措施可能提高参与度和治疗效果,但游戏相关问题的潜在出现仍是一个安全性问题,也是临床利益相关者关注的问题。我们在一项三臂随机对照试验中考察了长期辅助使用电子游戏疗法Meliora是否与游戏相关问题的变化有关。参与者为经访谈确认患有重性抑郁障碍、基线时无明显游戏或赌博问题的成年人。意向治疗队列(n = 1,001)的平均年龄为33.4岁(SD 9.3),64%为女性。从基线到干预后(第12周),Meliora组的游戏成瘾量表(GAS-7)评分下降(平均变化,-0.63分;95% CI,-0.91至-0.34;dz = -0.24;Holm校正p < 0.001),而使用高度相似电子游戏疗法的Sham组未观察到变化(平均变化,-0.02分;95% CI,-0.25至0.28;dz = -0.01;Holm校正p = 0.900)。组间分析显示,Meliora组的GAS-7变化比Sham组更负(校正平均差,-0.19分;95% CI,-0.30至-0.08;d = -0.13;Holm校正p = 0.001),表明Meliora组的下降相对更大,而Meliora组与TAU组之间的变化相似(校正平均差 = 0.04分;95% CI,-0.08至0.15;d = 0.03;Holm校正p = 0.509)。干预使用时间、体验到的沉浸感及其交互作用与Meliora组或Sham组中GAS-7评分的变化均无显著关联。使用[≥]25%恶化阈值时,Meliora组10.4%的参与者出现恶化,Sham组为15.3%,TAU组为9.8%,组间差异无统计学显著性。在干预暴露更多的参与者中进行的补充符合方案分析结果与ITT结果一致。这些发现未提供证据表明,在适当筛选的患者中,使用具有防止过度使用保障措施的干预时,长期使用电子游戏疗法与游戏相关问题增加有关。