2026-10-07 每日论文
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| Tetris3D：通过相互契合的物体生成3D场景 | Jaeyeong Kim | 2026-10-07 | 我们提出Tetris3D，一个用于单图像3D场景重建的生成框架，能够以场景形式恢复在物理和几何上一致的物体。现有方法通常独立生成物体或隐式地耦合它们，难以为确保相互交互的相邻物体之间细粒度空间兼容性提供充分指导。为解决这一问题，我们显式地将每个物体的生成条件建立在其周围物体的几何结构及其物理关系之上，引导其形状和姿态在场景中保持几何和物理上的合理性。此外，我们引入了ComOb，一个基于物理模拟的数据集，包含120万个场景，涵盖多样物体类别之间的物理交互，并带有逐物体网格和成对物理关系标注。在合成和真实世界场景上的综合实验表明，Tetris3D即使在交互区域被遮挡时也能恢复一致的物体形状和姿态，并在生成质量和物理稳定性方面均达到最先进性能。 | |
| 永不回头：从第一人称视频理解三维物体记忆中的持久性 | Shravan Chaudhari | 2026-10-07 | 当我们在世界中活动并完成日常任务时，会遇到一些可能之后才会变得相关的物体。我们能够回忆起把某物放在哪里，或者容器里装了什么，即使当时并不知道之后会需要这些信息。在这里，我们研究一个具身助手如何通过观察一个人的日常活动，从第一人称视频中构建类似的记忆。我们提出 Ledger，一种持久的三维物体记忆，它结合了物体位置、其历史以及上下文描述。它关联整个录制过程中的观察，并在物体离开视野后仍保留它们，包括那些人从未触碰过的物体。它按静止位置对每个物体的观察进行聚类，并且只有在反复出现证据后才记录一次移动，从而减少定位噪声的影响。简短描述保留了诸如物体内容或支撑表面等细节。它将这些记录保存下来，以便之后回答空间问题，而无需访问原始图像或视频。我们的记忆将 HD-EPIC 准确率从 29.7% 提升到 42.6%，将 UCS-Bench 准确率从 33.8% 提升到 38.5%，并在返回预测上以 0.99 米的中位误差定位 Ego4D 物体。我们的分析识别出时间持久性、上下文描述和检索之间的互补作用。我们对每个包含多个场景的 100 条拼接流进行的研究，进一步暴露了检索和构建两方面的失败。与单场景流相比，逐场景构建部分恢复了跨场景变化中损失的性能。 | |
| 在RLVR中将探索与优化解耦 | Saif Punjwani | 2026-10-07 | 现代语言模型在已训练好的检查点之上，通过可验证奖励的强化学习（RLVR）进行训练。RLVR 的一个关键承诺是发现新的推理策略。原则上，模型可以采样出其先前训练数据中不存在的新想法。然而在实践中，用强新颖性激励来增强 RLVR 收效有限，并且可能降低模型质量。由于可验证奖励只监督模型知识和行为中很窄的一部分，这类退化难以恢复。为此，我们在一个称为探索-蒸馏（ExpDis）的框架中将探索与优化解耦。我们用一个奖励中的新颖性 bonus 训练一个或多个探索者策略，对其轨迹进行正确性和质量过滤，并将其蒸馏到一个单独的学生策略中。随后，学生策略在没有新颖性 bonus 的情况下训练。我们重复上述过程若干轮，在探索与优化之间交替。这种解耦使我们能够积极地扩展探索，而不会降低学生策略。在七个数学推理基准和两个模型家族上，ExpDis 在相同的墙钟时间预算下优于 DAPO。此外，我们观察到 pass@$k$ 扩展性有所改善，这表明 ExpDis 产生的模型能够生成更多样化的正确解。 | |
| EngramEdit：通过条件记忆实现大语言模型中的解耦知识更新 | Hongru Cai | 2026-10-07 | 条件记忆架构如DeepSeek Engram利用输入n-gram查找学习到的嵌入，以有限的额外计算扩展大语言模型（LLM）的容量。除模型扩展外，该架构已展现出将事实知识存储与通用计算解耦的潜力，为在保持Transformer主干固定的同时更新事实知识提供了一条有前景的路径。实现这一潜力具有挑战性，因为同一事实的不同表达可能激活不同的n-gram嵌入，而更新共享嵌入可能无意中改变模型对其他事实的预测。我们提出EngramEdit，通过条件记忆实现解耦知识更新。EngramEdit首先计算目标记忆表示，使模型在多种表达下预测更新后的事实。然后联合更新共享n-gram嵌入，使其在多种表达和编辑下匹配这些目标，并对频繁复用的嵌入施加更强的更新惩罚，以保留无关知识。实验表明，EngramEdit通过条件记忆实现独立的事实知识更新，达到近乎完美的编辑成功率。修订后的知识可用于未见过的表达和多跳推理，在思维链（CoT）提示下准确率接近最强基线的三倍。即使事实更新不断累积，无关知识和通用能力也基本得以保留。这些发现表明，EngramEdit将条件记忆转变为可编辑的知识接口，将其作用从模型扩展延伸至支持解耦知识更新。 | |
| 基于交通和充电需求预测的联网自动驾驶车辆预测性路径重规划 | Tony Kinchen | 2026-10-07 | 在本文中，我们考虑混合交通中联网自动驾驶车辆（CAVs）的预测性重路由问题，并兼顾电动汽车充电需求。我们提供了一个框架，将扩散卷积循环神经网络（DCRNN）与一种考虑拥堵、CO2排放、路线长度和充电需求的路由策略相结合。DCRNN利用历史网络观测数据来预测交通状况和充电需求。这些预测随后用于评估符合条件的CAVs的可行备选路线。当备选路线能够保持与原始目的地的连通性并改善规定的路线成本时，路线变更被接受。我们在SUMO中，在五种CAV渗透率水平（从5%到45%）下，于受控交通中断场景中评估所提出的框架。我们将其性能与K最短路径路由、预测密度路由、V2X主动路由以及不进行重路由的参考场景进行比较。在所考虑的场景中，与参考场景相比，所提出的框架将平均行程时间指数降低约1.8%，并在主动路由方法中实现了最低的平均行程时间指数、最高的平均速度和最低的总CO2排放。在所有五种渗透率水平下，它接受了41次路线变更，而K最短路径路由为146次，V2X主动路由为153次。参考场景保持了较低的总排放和行驶距离，说明了拥堵缓解与重路由带来的额外行驶之间的权衡。 | |
| 长WAM：扩展世界-动作模型的上下文 | Wei Huang | 2026-10-07 | 实时机器人控制需要足够的视觉历史来推断运动与任务进展，但处理这些历史会延迟动作。我们提出 Long-WAM，一个模型-系统框架，用于在实时控制约束下扩展因果世界-动作模型的上下文。我们的核心发现是：能够访问历史并不等同于真正利用历史：当视频基础模型以自回归方式预训练时，更长的历史带来的收益要大得多。我们首先从机器人视频和第一人称视频中学习无动作标签的因果预测，然后在世界-动作适配过程中保留这种从历史到未来的结构。在 RoboCasa GR-1 上，将上下文从 0.0 秒增加到 19.2 秒使成功率从 63.3% 提升到 78.7%，而双向预训练的初始化则没有净收益；机器人领域的自回归预训练进一步提高了 GR-1 和 LIBERO-Long 上的峰值成功率。Long-WAM 在 LIBERO-Long、RoboTwin 2.0 和 DOMINO 上也取得了所比较方法中的最佳结果。流式观测编码、异步执行和硬件特定加速使其能够在 RTX 5090、DGX Spark 和 Jetson AGX Thor 上部署而不牺牲未来预测；在 RTX 5090 上，每个动作块（包括未来视频潜在预测）耗时 107.4 毫秒。在 Unitree G1 和 YAM 上的实时部署支持动态和长时程操作，包括动态叠杯任务中 95% 的成功率，而 Pi0.5 和 Fast-WAM 在 20 次试验中均未成功。作为一个记忆驱动的执行器，Long-WAM 还能在复合任务中补充更高层的规划。 | |
| 重尾噪声下的去中心化SGD：最优收敛速率与梯度裁剪的作用 | Aleksandar Armacki | 2026-10-07 | 重尾噪声在现代机器学习中已被广泛观察到，这促使人们采用梯度裁剪和归一化等方法。虽然这些方法在集中式设置中已被充分理解，但在去中心化设置中却知之甚少，因为在去中心化设置中，对局部梯度施加非线性会影响优化和共识。近期关于去中心化非凸优化的研究在重尾噪声下同时考察了裁剪和归一化，其中裁剪产生次优速率，而归一化需要局部动量或小批量才能收敛。这引出了一个问题：使用非线性的基线去中心化方法能否在重尾噪声下达到最优收敛速率？我们以裁剪去中心化随机梯度下降（$\mathtt{DSGD}$）给出了肯定的回答。对于有界 $p$ 阶矩噪声下的光滑非凸代价函数，$p \in (1,2]$，我们证明裁剪 $\mathtt{DSGD}$ 在高概率和期望意义下均达到阶最优速率。此外，我们建立了智能体数量上的线性加速，据我们所知，这对于带裁剪的去中心化方法尚未被证明。关键的技术要素是对共识间隙的精细分析，该分析利用了裁剪的结构，将网络效应归入高阶项。我们的结果突显了去中心化设置中裁剪与归一化之间的一个重要区别：归一化 $\mathtt{DSGD}$ 可能无法收敛，而裁剪保留了幅度信息，使 $\mathtt{DSGD}$ 能够收敛并达到阶最优。数值实验验证了我们的理论。 | |
| 行动前先重述：刻画并缓解视觉-语言-行动模型中的语言敏感性 | Mikey Watts | 2026-10-07 | 视觉-语言-动作模型（VLAs）对指令措辞极为敏感，并且不继承其构建所基于的视觉-语言模型的语言鲁棒性。一个词的修改就能使成功率变化数十个百分点：$π_{0.5}$ 对“switch on the stove”在 LIBERO 炉灶任务上 100% 成功，而对“switch on the hot plate”仅 2% 成功，一个用改述增强微调的 $π_0$ 检查点仍显示出高达 61 个百分点的波动。我们通过统计检验的单次编辑波动和 oracle 短语搜索来刻画这种敏感性，结果表明仅措辞一项就几乎弥合了分布内与分布外任务之间 21 个百分点的差距。随后我们在不修改策略的情况下降低这种敏感性。由于这种敏感性是系统性的，它可以被表达为显式规则：我们对少量训练任务的许多措辞进行评分，让一个大语言模型将证据提炼为十到二十条改述规则，并在部署时依据这些规则对每条传入指令重写一次。这些规则在十二个留出任务上，针对对抗性、VLM 生成和人类生成的措辞，将冻结的 $π_0$ 相对提升 16% 到 27%，增益集中在分布外任务上。该流程在 $π_{0.5}$ 和 LIBERO 上可复现，将微调内成功率从 93.6% 提升到 97.8%。该方法无需重新训练，也无需逐步验证，并可零样本应用于未见过的任务和指令。项目网站：https://sttawm.github.io/rephrase-before-you-act | |
| GRACE：面向高效视频生成的生成感知潜在压缩 | Jiyoung Kim | 2026-10-07 | 高度压缩的视频自编码器为加速视频扩散模型提供了一种有效途径，因为扩散Transformer（DiT）在远更少的token上运行。然而，此类自编码器的训练颇具挑战，因为更高的压缩比会降低重建质量，而恢复质量需要更多通道，这已知会拖慢DiT的收敛。压缩后的潜变量也与DiT训练时所使用的潜变量不同，因此预训练的DiT必须以相当大的代价从头重新训练或进行适配。压缩DiT训练时所使用的自编码器似乎能保持兼容性，但仅针对重建进行优化仍会使潜变量偏离DiT已学到的分布。为解决这一问题，我们提出了面向高效视频生成的生成感知潜变量压缩（GRACE），这是一个两阶段框架，在压缩预训练视频自编码器的同时保持其与预训练DiT的兼容性。具体而言，我们保留来自预训练编码器的冻结基础潜变量，并学习一个残差潜变量以承载更强压缩下丢失的信息，同时在冻结DiT的特征空间中将压缩潜变量与预训练潜变量对齐，从而使自编码器针对生成进行优化。随后，我们通过轻量级微调与非对称去噪对DiT进行适配，其中基础潜变量先于残差潜变量被去噪。GRACE在480x832x81下将Wan2.1-I2V-14B的token数量减少8倍，延迟降低11.1倍，同时在VBench上达到与压缩前预训练流程相当的生成质量。 | |
| 蒸馏图几何：从GNN到MLP的知识差距 | Zhewei Chen | 2026-10-07 | GNN到MLP蒸馏旨在保留消息传递教师的预测精度，同时在推理时部署无图MLP。现有方法主要迁移节点级预测或使用基于置信度的重加权，但它们没有指明学生应在何处保留教师由图诱导的几何结构。我们表明，这一遗漏会导致学生表示空间中出现两种谱失效模式。在稀疏图上，学生会遭受谱欠拟合，缺失集中在边界区域附近的高能教师方向。在稠密图上，学生会遭受谱过拟合，保留教师通过聚合已坍缩的虚假方向。受能量加权师生对齐目标启发，我们提出图几何感知MLP（G^2MLP），一种由Ollivier-Ricci曲率引导的训练时蒸馏框架。曲率识别两种谱误差集中之处，并用于在预测级对齐与表示级对齐之间分配监督。部署后的模型仍是标准MLP，并且推理时无需访问图。在节点分类基准上，G^2MLP持续优于无图蒸馏基线，在两种情形下缩小师生秩差，并可无需架构改动迁移到图Transformer教师和链接预测。 |
bioRxiv
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| 将transformer电路机制与关系推理中的神经表征对齐 | Hearne, L. J. | 2026-10-07 | 关系推理，即理解元素之间如何相互关联的能力，是人类智能的一个决定性特征，但其计算基础仍不清楚。在这里，我们将人类神经影像学（7T fMRI）与人工神经网络建模相结合，以识别人类推理计算的回路层面类似物。使用拉丁方任务，我们发现人类和Transformer能够可靠地泛化该任务，而认知神经科学中使用的标准架构则不能。分析Transformer组件揭示了不同的计算角色：位置编码捕捉了任务的空间结构，并与视觉皮层中的表征相一致，而注意力则编码了关系结构，并映射到额顶网络和默认模式网络。注意力权重追踪了任务的关系复杂性，为推理需求提供了计算类似物。这些结果推进了关于支持复杂推理的核心算法计算的知识，并强调基于注意力的架构是研究高级认知的神经和计算基础的有力模型。 | |
| 开发可诱导遗传系统以精细调控靶向InhA的抗结核药物疗效 | Sepulveda Ramos, E. | 2026-10-07 | 结核病（TB）由结核分枝杆菌（Mtb）引起，仍然是全球主要的健康威胁，尤其是由于耐多药菌株的出现。一线药物异烟肼（INH）以及二线药物乙硫异烟胺（ETH）和丙硫异烟胺（PTH）是前药，其靶点是必需的烯酰-ACP还原酶InhA，这是参与分枝菌酸生物合成的关键酶。对这些药物的耐药性主要源于基因突变，这些突变使其各自的生物活化酶失去酶功能。尽管近年来化学增强剂的开发在恢复这些突变体药物敏感性方面显示出良好前景，但能够动态调控这些通路并精细调节耐药性的遗传工具对于开发下一代抗InhA药物可能极具价值。在此背景下，我们利用CRISPR干扰（CRISPRi）开发了可诱导且可逆的遗传系统，以精细调节耻垢分枝杆菌（Msmeg）和Mtb中的抗生素敏感性。通过使用基于CRISPRi的方法，我们首先构建了一个可诱导的inhA亚效等位基因，这是分枝菌酸产生和细菌生长所必需的靶点，从而证实我们的方法完全有效。随后，我们开发了遗传工具，选择性靶向katG、ethA以及转录抑制因子ethR，以生成具有改变抗生素敏感性特征的条件性亚效等位基因。抗生素敏感性实验证实，这些条件性亚效等位基因在CRISPRi诱导后对INH或ETH选择性表现出高水平耐药性或超敏感性。总之，这项工作确立了CRISPRi作为一个强大的遗传平台，可用于选择性精细调节分枝杆菌药物敏感性，并在开发下一代抗结核疗法方面具有潜在应用。 | |
| 景观恢复策略在预测物种持续生存方面的益处各不相同 | Bauknecht, R. | 2026-10-07 | 全球生物多样性恢复需要在景观尺度上进行修复，其中生态结果不仅取决于栖息地数量，还取决于空间配置。不同的景观恢复策略可以以根本不同的方式增加栖息地数量、改善质量并改变配置，因此其效率可能各不相同。在此，我们概念化了五种景观恢复策略，并使用空间显式的集合种群框架，比较它们在由扩散能力和特化程度定义的异质景观和性状空间中提高预测物种续存能力的效果。我们发现，恢复结果强烈依赖于性状，其中修复现有退化栖息地带来的收益最高——尤其是对特化种而言。改善景观基质以创建低质量栖息地主要有利于泛化种，而创建新栖息地斑块或扩大斑块的策略则提供更为一致但适度的收益。这些结果揭示了恢复策略之间的基本权衡，并凸显了性状显式方法在指导其实施和评估方面的效用。 | |
| 高致病性禽流感疫情防范建模挑战：目标、设计与合成数据生成 | Hayes, B. H. | 2026-10-07 | 高致病性禽流感（HPAI）是全球家禽业面临的最重大疾病威胁之一。建模挑战赛——即由独立团队针对同一流行病学情景开展研究——能够支持应对能力的建设，并加强建模人员与风险管理方之间的沟通。尽管此类演练具有公认的益处，但在动物卫生领域仍不常见，且此前尚无任何演练针对禽流感。本文开发了Jolly Island——一个包含9160个家禽养殖场、涵盖五种生产类型的人工景观，并在此中播撒了随机HPAI疫情，疫情在三至四个月内自然发展至结束。从2026年1月至4月，来自五大洲的45个注册团队对选定的合成疫情进行了研究，产出概率性预测、推断传播驱动因素并评估反事实控制策略。本文完整描述了HPAI建模挑战赛的目标、设计选择和数据生成过程，涵盖传播过程、监测系统运行和控制策略实施，以及选定的疫情轨迹、在各阶段向团队提供的叙述性情景报告，以及向团队发布的完整分阶段数据集。作为本期特刊的开篇论文，本文提供了所有后续贡献所依托的基础，后续论文中各团队将记录其方法和分析。 | |
| 人类FACT复合体在染色质上协调黏连蛋白与转录 | Garcia-Luis, J. | 2026-10-07 | 真核生物基因组的三维空间组织对于协调转录和复制等依赖DNA的过程至关重要。黏连蛋白通过挤出染色质环参与这一组织过程；然而，黏连蛋白如何在体内沿核小体密集的染色质实现持续易位仍知之甚少。在此，我们鉴定出组蛋白伴侣FACT是人类细胞中黏连蛋白动态的调控因子。我们发现FACT亚基SUPT16H在染色质上与黏连蛋白共定位并相互作用。FACT的缺失损害了黏连蛋白从其装载位点的易位，导致Hi-C揭示的染色质环化减少以及拓扑关联结构域（TADs）边界强度降低。此外，FACT缺失导致黏连蛋白在未参与环形成的基因体内积累，这与转录减少相关。重要的是，在FACT缺失的细胞中降解黏连蛋白可恢复转录输出，表明黏连蛋白的错误定位是这一效应的根本原因。总之，这些发现表明FACT促进黏连蛋白沿染色质易位，促进高效的环挤出，同时防止其在转录区域内的异常积累。这项工作为染色质结构如何调控黏连蛋白功能从而协调哺乳动物细胞中基因组组织与转录提供了机制性见解。 | |
| 利用工程化动力学校对实现无分离蛋白质检测中的近单分子灵敏度 | Xuan, F. | 2026-10-07 | 与核酸不同，蛋白质无法直接扩增。因此，超灵敏检测必须将高效的分析物到信号转换与对靶标非依赖性背景的强效抑制结合起来。在多种蛋白质靶标上，以像PCR一样可扩展且易于获取的形式，一致地检测约100个分子（低于此水平，仅泊松采样噪声就会导致CV超过10%）仍未得到解决。基于分离的超灵敏免疫分析需要足够稳定的靶标结合才能经受严格洗涤，因此受到洗涤诱导信号丢失的限制，更根本地，还受到极高亲和力结合物相对稀缺的制约。性能因此因靶标而异；低于1,000个分子的检测限仍然罕见。传统的免分离邻近分析避免了洗涤，但因随机探针碰撞而产生背景，已报道的检测限常常超过100,000个分子。在此，我们介绍连续邻近延伸扩增反应（SPEAR），这是一种免分离架构，其中自主工程化DNA纳米器件模拟生物动力学校对。两个连续的不可逆邻近延伸步骤复合了对分析物依赖性反应与背景反应之间的区分，在抑制虚假信号的同时保持高效的分析物到信号转换。这种设计减少了对高亲和力结合物的依赖，并通过简单的3步混合后接标准qPCR读数，实现了从1 µL样本中进行亚fM检测。在测试的11种生物标志物中，SPEAR一致实现了低于100个分子的检测限。在进行比较的情况下，它在分析和临床上均优于基于分离的超灵敏平台，包括对于低丰度阿尔茨海默病生物标志物。SPEAR还从指尖采血干燥血斑中精确定量了SARS-CoV-2中和抗体滴度，与静脉血上的细胞参考测定一致。它检测到了Tau的一种独特混合磷酸化状态，而靶向该状态解决了先前观察到的毛细血管-静脉不一致，并改善了淀粉样蛋白状态判别。这些结果确立了工程化自主连续分子判别作为一种近乎单分子蛋白质检测的实用策略，将基于PCR检测的灵敏度、可扩展性和可及性扩展到不可扩增的分析物。 | |
| 不透明组织中单细胞的纵向成像与细胞啁啾超声 | Nayak, R. | 2026-10-07 | 少量细胞可以决定整个生物体的命运。例如，转移性癌细胞在远处器官中播散，耐药克隆重新填充肿瘤，T细胞在具有匹配抗原的组织中浸润并扩增。要在活生物体内可视化这些细胞的活动，需要在光学不透明组织中进行高度灵敏、特异且可重复的成像。在此，我们介绍细胞啁啾，一种用于在光无法到达的活器官中实时成像单细胞的超声成像方法。细胞啁啾利用基因编码的气体囊泡对频率编码超声的谐波响应，在散射背景中灵敏且特异地可视化单细胞。我们首先在模拟组织的体模中开发了这种方法，证明了定量检测单细胞的能力，并通过光学细胞计数得到验证。随后，我们确立了细胞啁啾在百万细胞背景组织中成像数千个基因标记细胞、追踪报告基因表达数天，以及将背景信号抑制超过两个数量级的能力。最后，我们使用细胞啁啾在为期数周的T细胞衔接器治疗期间追踪抗原阳性或抗原阴性肿瘤细胞少数群体的命运。细胞啁啾揭示了不透明组织中稀疏分布、基因定义的细胞的动态变化。 | |
| 机器学习辅助的定向进化在新型AAV工程任务中取得了显著改进 | Luchner, M. R. | 2026-10-07 | 定向进化通过迭代选择轮次能够发现适应度提高的蛋白质突变体，并已广泛应用于腺相关病毒（AAV）衣壳工程。机器学习（ML）可以通过优先选择突变体进行实验验证来增强这一过程，但其收益是否超过构建ML设计文库的额外成本仍不清楚。在此，我们通过考虑外泌体封装背景下AAV衣壳制造效率的提升来回答这一问题，外泌体封装是一种改善AAV免疫原性的技术。我们生成了一个定向进化数据集，包含三轮选择中的53,974个突变体，以及一个独立评估数据集，包含472个经过详细表征的ML设计突变体。仅定向进化使制造效率提高了3倍，而ML辅助的定向进化使制造效率提高了41倍，表明ML辅助的定向进化优于仅定向进化。我们表明，数据质量——具体而言是选择轮次的数量和突变体计数的统计功效——对模型性能的影响大于模型架构。最后，我们提供了关于实验设计和ML调优策略实施的实用指导，这些策略可以在蛋白质工程应用中增强模型性能。 | |
| 化学结构多样的拮抗剂通过配体特异性相互作用网络抑制人源TRPV1 | Lopez, K. E. | 2026-10-07 | 瞬时受体电位香草酸亚型1（TRPV1）介导温度感觉和疼痛，是非成瘾性镇痛药的靶点；然而，临床候选药物因体温调节和温度感觉方面的副作用而失败。与临床相关拮抗剂结合的人源TRPV1（hTRPV1）结构数据有限，制约了机制层面的认识。利用化学信息学指导的冷冻电镜和BRET实验，我们鉴定出不同化学型之间拮抗剂靶点结合程度的差异，包括失败的临床化合物。与6-碘-二氢辣椒素结合的hTRPV1结构显示，单个原子取代即可将激动剂转化为拮抗剂。与Asivatrep、Mavatrep和JNJ-17203212结合的额外结构揭示了香草酸口袋的可塑性以及不同的相互作用网络，包括脂质共结合。对配体相互作用残基的突变分析进一步表明它们对抗拮抗剂结合具有不同贡献。尽管存在这种多样性，拮抗剂仍汇聚于一种保守的抑制状态，表明高效力可在多种柔性结合模式中得以维持。这些发现深化了我们对hTRPV1拮抗作用的理解，并为开发安全性更优的下一代镇痛药提供了策略依据。 | |
| 核糖体假尿苷驱动致癌翻译程序 | Faucher-Giguere, L. | 2026-10-07 | 动态的核糖体异质性已成为翻译调控的一个潜在层面，但rRNA修饰化学计量比的变化是否能够选择性控制具有共同编码特征的mRNA的翻译，仍不清楚。在此，我们展示SNORA81引导的U4636位点假尿苷化控制卵巢癌细胞中的选择性翻译程序。U4636被部分假尿苷化，位于28S rRNA中靠近eL31和肽出口通道的位置。敲低SNORA81会降低U4636位点的假尿苷化，而不会广泛扰动rRNA加工或整体翻译。相反，它重塑了密码子特异性和新生肽相关的暂停，以及SNORA81依赖性翻译改变mRNA的多聚核糖体结合。这些mRNA表现出特征性的GC含量和氨基酸组成，富集于癌症相关功能，并显示出相应的蛋白质水平变化。我们的发现支持这样一个模型：单个snoRNA丰度的变化从rRNA修饰化学计量比出发，通过核糖体动力学和选择性mRNA翻译，传播至蛋白质输出和癌细胞增殖。我们将这一多层次放大级联称为“sno-balling”效应。 |
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| 动脉粥样硬化连续过程中血浆代谢组学测量的多队列评估 | Sayols-Baixeras, S. | 2026-10-07 | 目的：动脉粥样硬化历经多年发展，其潜在机制仍未完全阐明。研究疾病不同阶段的血浆代谢物可能有助于识别阐明其发生发展机制的生物标志物，并改善早期风险评估。方法：我们在基于人群的SCAPIS队列中，对8，146名无心血管疾病的参与者，采用超高效液相色谱-质谱联用技术进行了非靶向血浆代谢组学分析。我们研究了1，171种循环代谢物与亚临床冠状动脉粥样硬化的关联。动脉粥样硬化负荷通过冠状动脉计算机断层扫描血管造影测量，并使用节段受累评分进行量化，关联分析采用多变量模型。随后，在代表动脉粥样硬化疾病连续谱后期阶段的独立队列中评估了相关代谢物：六个月内发生心肌梗死（MIMI，n=2，018），以及心肌梗死幸存者的冠状动脉斑块负荷和易损性（PROSPECT II，n=898）。结果：在调整传统危险因素和其他临床变量后，包括磷酸盐、苹果酸、鞘磷脂和氨基酸在内的12种代谢物与亚临床冠状动脉粥样硬化稳健相关。值得注意的是，苹果酸、N-乙酰异腐胺和一种核苷衍生物与亚临床冠状动脉粥样硬化及心肌梗死呈正相关。鞘磷脂与亚临床动脉粥样硬化、心肌梗死及易损斑块的存在呈负相关。结论：这些发现揭示了贯穿动脉粥样硬化连续谱的代谢组学特征，突出了可能增进对疾病机制理解并有助于风险分层的候选生物标志物。 | |
| FORGE：功能引导的OCT表征用于青光眼内表型分型 | Moradi, M. | 2026-10-07 | 青光眼的內表型分析受到疾病異質性和單一模式結構成像的限制。我們提出FORGE（Functionally guided OCT Representation for Glaucoma Endophenotyping），一個跨模態對比框架，在訓練期間使用視野（VF）信號作為特權監督，透過學習到的空嵌入實現僅OCT推論。在Mass Eye and Ear的5,372對配對檢查中，FORGE解析出15種黃斑RNFL內表型，模糊c均值（FCM）聚類將其劃分為9個臨床上不同的表型簇，相較於僅OCT基線，聚類品質提升了22%。在未重新擬合的情況下遷移至74,077張UK Biobank（UKB）和3,119張Mass General Brigham Biobank影像，它們重現了其定義性的RNFL厚度特徵（Lin一致性0.74）。將15種連續內表型中的每一種視為數量性狀，在39,381名UKB歐洲參與者中進行的全基因組關聯分析識別出53個LD獨立位點，其中23個未曾報導與青光眼或眼內壓相關，並在711名外部參與者中重現（符號一致性75%）。與相同訓練的消融相比，以VF引導學習的內表型具有更高的遺傳發現能力（中位遺傳力Z 6.15對4.76），並解析出視網膜神經節細胞富集。 | |
| 1996-2019年非洲不合格和伪造抗疟疾药物的时空分布 | Adipo, L. B. | 2026-10-07 | 引言：2024年，全球估计发生2.82亿例疟疾病例和61万例死亡，其中许多可归因于无法充分获得质量保证且有效的抗疟药。非洲承担着最重的疟疾负担，但劣质和伪造抗疟药在整个非洲大陆的时空分布仍知之甚少。方法：我们从传染病数据观测站（IDDO）药品质量科学文献调查数据库提取了关于劣质和伪造抗疟药流行率的数据。我们应用时空建模来估计各国和各年份抗疟药中劣质和伪造的比例。我们构建了三种不同模型，它们具有相同的空间结构和协变量，但时间趋势的设定不同。我们使用Besag-York-Mollie模型（BYM）对空间效应进行建模。我们使用集成嵌套拉普拉斯近似（INLA）拟合模型，并使用广泛适用信息准则（WAIC）比较模型的预测能力。结果：我们提取了1996年至2019年间开展的76项随机和便利调查的数据，共包括8，213份抗疟药样本。预测性能最佳的模型包含空间与时间之间的交互作用（WAIC=499.430），表明最高的劣质和伪造流行率出现在1996年至2003年间，且西非和中非的预测值更高。大多数国家没有明显的时间模式，但估计肯尼亚、乌干达、坦桑尼亚和马达加斯加自2003年前后开始出现显著下降。结论：本研究提供了国家层面、随时间变化的劣质和伪造抗疟药流行率估计，增进了对非洲时空异质性的理解。尽管这些发现可为有针对性的干预措施提供信息，但相当大的不确定性反映了监测数据稀疏，因此需要谨慎解读。关键词：劣质；伪造；抗疟药；时空分析；非洲 | |
| 单层对比增强MRI上脑转移瘤评估的开源视觉语言模型基准测试 | Kim, J. | 2026-10-07 | 目的 开源视觉语言模型（VLM）可在无外部互联网接入的情况下本地部署。本研究旨在评估多种通用型和医学型开源VLM在对比增强（CE）MRI上对脑转移瘤的层面级病灶检测性能，并评估其在病灶阳性图像上表征详细影像学特征的准确性。材料与方法 使用八个可评估的VLM分析了来自100例患者的100幅病灶阳性轴位CE T1加权图像和100幅匹配的病灶阴性图像：五个通用型VLM——InternVL3-8B、Qwen2.5-VL-7B-Instruct、MiniCPM-V-4.5、DeepSeek-VL2-tiny和Phi-3.5-vision-instruct——以及三个医学型VLM——MedGemma-4B-it、LLaVA-Med v1.5和HuatuoGPT-Vision-7B。使用灵敏度、特异度和平衡准确度评估病灶检测性能。在病灶阳性图像上，评估病灶数量、侧别、解剖位置、强化模式、坏死和占位效应的准确性。平衡准确度以患者级聚类自助法95%置信区间（CI）报告。使用Friedman检验和配对患者级置换检验及Benjamini-Hochberg校正比较模型。次要结局使用精确McNemar检验与多数类基线进行比较。事后测试了修订提示词。结果 研究患者的中位年龄为65岁（IQR，59.0-70.0），58例患者为男性（58.0%）。MiniCPM-V-4.5显示出显著高于所有其他模型的平衡准确度（80.5%；95% CI，75.0-85.5）（FDR校正P < 0.001）。八个模型中有七个的预测阳性率为81-100%，并且对无解剖内容的合成对照图像的响应中有70.8%（17/24）被分类为病灶阳性。使用修订提示词后，HuatuoGPT-Vision-7B的平衡准确度从59.5%提高至77.0%，InternVL3-8B从51.5%提高至68.5%。没有模型在强化模式或占位效应方面显著优于多数类基线。结论 这一层面级技术基准测试表明，开源VLM在仅图像设置下对脑转移瘤的病灶检测性能存在差异，大多数模型表现出强烈的阳性响应倾向。 | |
| 分娩相关创伤后应激障碍的6项诊断筛查工具 | Bartal, A. | 2026-10-07 | 创伤性分娩后发生的创伤后应激障碍（PTSD）是一种严重的孕产妇疾病，影响约20%经历医学复杂性分娩的女性。然而，它在围产期保健中常常未被发现，部分原因是缺乏适合繁忙产科环境的简短筛查工具。我们开发并评估了一种源自DSM-5的20项PTSD检查表（PCL-5）的简短筛查工具，用于检测与分娩相关的PTSD。有创伤性分娩经历的女性完成了PCL-5和作为金标准的DSM-5临床医生 administered PTSD量表（CAPS-5）；抑郁症状使用爱丁堡产后抑郁量表（EPDS）评估。采用LASSO回归的自举重采样识别出与PTSD关联最强的PCL-5条目，并使用Firth逻辑回归估计诊断准确性。统计推导出的6条目版PCL-5（PCL-5-R6）在区分临床医生诊断方面表现出色（AUC = 0.95；95% CI，0.89-1.00）。截断分数为7时，灵敏度高（0.96），特异度良好（0.83），总体诊断效率为0.86。PCL-5-R6与EPDS评分仅呈中度相关（{rho} = 0.53），表明仅靠抑郁筛查不能可靠地检测PTSD。这一简短工具可为常规产后PTSD筛查提供一种有效且实用的方法。 | |
| GALC变异影响葡萄糖脑苷脂酶与半乳糖脑苷脂酶活性比值 | Rajabi Vajargah, A. | 2026-10-07 | 目的：溶酶体鞘糖脂通路中的基因，包括GBA1和GALC，是帕金森病（PD）的重要遗传风险因素。我们假设PD风险不仅与单个酶的效应相关，还与葡萄糖脑苷脂酶（GCase）和半乳糖脑苷脂酶（GalCase）活性之间的协调有关，并研究了遗传变异如何影响其活性比值。方法：我们研究了来自帕金森精准医学计划和哥伦比亚大学队列的1,290名个体，这些个体具有遗传和干血斑酶学数据。在合并队列中、按性别以及按队列分别进行了葡萄糖脑苷脂酶/半乳糖脑苷脂酶活性比值的全基因组关联分析，随后进行荟萃分析。对于先导变异，比较了不同基因型间酶活性之间的Pearson相关性，并检验了基因型与GCase的交互作用。结果：在合并队列中，GALC位点与葡萄糖脑苷脂酶/半乳糖脑苷脂酶活性比值相关（rs365448；beta=-1.90；P=5.91e-115），在各队列和荟萃分析中均得到重复验证（beta = -1.66，P=6.33e-191），并与PD GWAS索引变异rs979812存在连锁不平衡。该关联在两种性别中均保持显著。葡萄糖脑苷脂酶与半乳糖脑苷脂酶活性之间的相关性因rs979812基因型而异（TT r=0.33 对比 GG r=0.13；P=0.01），并存在显著的基因型与GCase交互作用（P=3.05e-5）。在检查的134个PD位点中，有10个显示与比值GWAS存在名义关联，包括GBA1，其中风险变异携带者表现出相似模式，但无统计学显著性。解读：GALC变异影响葡萄糖脑苷脂酶与半乳糖脑苷脂酶活性之间的平衡，而这种关系可能因PD相关变异的基因型而异。这些发现表明，溶酶体鞘糖脂基因相关的PD风险可能部分反映的是通路酶之间协调的改变，而非孤立的单酶效应，值得进行功能验证。 | |
| 巴基斯坦初级卫生保健机构的综合糖尿病护理服务：一项实用性随机对照试验的经济学评价 | Khan, N. | 2026-10-07 | 摘要 背景：2014年，巴基斯坦约有700万人患有糖尿病。为应对糖尿病的负担，开展了一项随机对照试验，以评估标准化护理包在改善巴基斯坦旁遮普省卫生保健机构中糖尿病结局的有效性。在该随机对照试验中嵌入了一项成本核算研究，以估计标准化糖尿病护理包在改善糖尿病结局方面的成本效果。 方法：从巴基斯坦萨戈达县的14个公共卫生集群中招募了166名患者参与成本核算研究。分析采用社会视角、更广泛的社会视角和敏感性分析来探讨分析中的不确定性。对参与成本核算研究的166名参与者和参与整群随机对照试验的495名参与者均进行了数据分析，使用了多重插补法。 结果：采用社会视角，发现标准化糖尿病护理包相较于标准化护理具有成本效果，并且具有成本节约性，因为干预组的成本低于对照组，同时干预组显示出更大的效果。按照更广泛的社会视角和仅卫生保健视角，标准化护理包未被证明具有成本效果。 关键词：糖尿病管理，卫生服务成本，自付费用，成本效果。 | |
| 急诊科停留时间、就业状况与后续住院风险：英格兰关联行政记录的生存分析 | Aston, H. | 2026-10-07 | 目的 探讨在NHS 1型急诊科（ED，由顾问领导的24小时服务，配备完整复苏设施）停留时间与就诊后存活离院后两年内离开就业和住院风险之间的关联。方法 我们使用NHS急诊护理数据集、医院事件统计、2021年人口普查和死亡记录中的关联行政数据，进行了一项回顾性队列研究。急诊科停留时间从不足2小时到12小时或以上进行分类。拟合Cox比例风险模型，以估计急诊科停留时间与随后两年随访期内离开就业或住院之间的关联，并调整人口学、社会经济和临床特征。结果 我们的研究人群包括3,347,008名年龄在25至64岁之间、于2021年4月至2023年3月期间在英格兰1型急诊科就诊的个体。对于离开就业，与停留不足2小时相比，调整后风险比（aHRs）从停留2至<4小时的1.04（95% CI 1.03至1.06）上升至12小时或以上的1.21（1.17至1.24）。对于出院后住院，观察到类似但更明显的梯度，aHRs从2至<4小时的1.06（1.04至1.07）上升至停留12小时或以上的1.95（1.91至1.99）。结论 在急诊科停留时间延长与工作年龄雇员较差的结局相关，包括劳动力市场参与减少和医院使用增加。这些发现表明，长时间急诊停留可能具有超出即时临床结局的更广泛和更长期的影响，包括可能对国家劳动力市场和经济产生影响。 | |
| mRNA-1010流感疫苗对美国65岁及以上老年人的潜在公共卫生效益 | Fust, K. | 2026-10-07 | 背景/目标老年人面临流感相关重症和并发症的高风险。HD-IIV目前推荐用于65岁及以上成人，为鸡胚培养疫苗，可能受到鸡胚适应性突变的影响。一种基于mRNA的流感疫苗mRNA-1010已获得美国食品药品监督管理局批准。鉴于mRNA-1010临床试验中观察到的临床获益以及避免鸡胚适应性突变的潜力，本分析探讨了在美国65岁及以上人群中，mRNA-1010相较于HD-IIV的临床影响。方法本研究使用流感感染及下游结局的决策分析模型，预测在一年时间内接种每种疫苗的流感负担。疫苗覆盖率、HD-IIV疫苗有效性（VE）和流感流行病学数据基于美国疾病控制与预防中心的数据进行估计。mRNA-1010相较于HD-IIV的相对疫苗有效性（rVE）基于临床试验数据及已发表的关于鸡胚适应性突变影响的文献进行建模。结果基础案例分析表明，与HD-IIV相比，mRNA-1010可能额外预防232,200例有症状流感感染、130,000例门诊病例、21,100例流感相关住院和2,200例流感相关死亡。预防一例住院所需的接种人数（NNV）为：mRNA-1010相较于未接种为514，HD-IIV相较于未接种为404，增量NNV为110。情景分析和确定性敏感性分析结果表明，mRNA-1010所预防的临床结局对流感发病率和疫苗有效性最为敏感。结论mRNA-1010可能改善美国65岁及以上成人对流感的保护，从而有意义地降低老年人中流感相关临床疾病负担。 | |
| 两阶段自动化筛选流程用于医学系统综述的验证：一项与三名独立人类评审员进行的分层一致性研究，使用PABAK和Gwet's AC1 | Pirani, E. | 2026-10-07 | 背景。大语言模型（LLMs）正越来越多地用于自动化系统综述中的标题-摘要筛选，但验证研究通常报告敏感度、特异度或Cohen's kappa：这些指标在大多数综述所特有的低且不平衡的患病率下并不稳定。此前没有研究同时结合以下要素：医学主题；混合两阶段流程（规则+LLM）；带有单独抽样的不确定类的三分类；带有三名独立人工审阅者的分层抽样；以及患病率稳健系数（PABAK和Gwet's AC1）的双重报告。目的。在一项关于高治疗中血小板反应性（HTPR）、阿司匹林抵抗和颈动脉斑块的医学系统综述中，针对三名独立人工审阅者验证一个两阶段自动化筛选流程（一个基于规则的Python脚本，随后对不确定记录进行可复现的LLM裁定）。主要验证目标是第1阶段的自动排除决策（670/904条记录），这是该流程旨在从人工审阅者手中移除的工作量。方法。从904条已筛选记录中（第1阶段：131条INCLUDE，670条EXCLUDE，94条UNCERTAIN；第2阶段通过API使用LLM，temperature = 0：11条INCLUDE，83条EXCLUDE），对185条记录的分层样本（每个第1阶段层50条+第2阶段35条；seed = 42）由三名医生在盲于自动化标签的情况下独立判定：E.P.（流程设计者）、D.C.和P.P.B.（两人均在该论文项目之外）。一致性通过敏感度、特异度、PABAK（全程q = 3）、Gwet's AC1、抽样节省工作量（WSS）和需阅读数量（NNR）进行量化，包括AI与每位审阅者之间以及审阅者彼此之间，总体及按层。多数标签（3人中2人）作为补充面板报告；它们不取代成对表格作为敏感度的主要参考。结果。在主要目标上，Stage1-EXCLUDE与E.P.的一致性为PABAK = AC1 = 1.000（48/48），与D.C.为（50/50），与Berti为PABAK = 0.940 / AC1 = 0.959（48/50 EXCLUDE，2 UNCERTAIN）。该层占670/904条记录（74.1%）。成对人工一致性在两名外部读者之间最高（Costazza vs Berti：PABAK = 0.854，AC1 = 0.881），当E.P.为其中一方时较低（与Costazza为0.703 / 0.774；与Berti为0.621 / 0.702）。AI与每个人工审阅者之间仍然较差（PABAK 0.225 / 0.205 / 0.222）。185条记录上的多数标签为146条EXCLUDE / 27条UNCERTAIN / 4条INCLUDE / 8条NO_MAJORITY。机器在4条多数-INCLUDE记录中标记了0条INCLUDE（74、75、76、80）。总体敏感度与E.P.为0.800（8/10；假阴性623、712），与D.C.为0.500（1/2；假阴性76），与Berti为0.833（5/6；假阴性76）。与多数标签相比，假阴性计数为1（记录76）；记录623和712为多数EXCLUDE。Stage1-INCLUDE敏感度为1.000是同义反复。WSS = 74.1%仅描述排除层。结论。本研究现在以三名独立医生验证的是第1阶段的自动排除。INCLUDE记录的精细分类未得到验证：人工审阅者对哪些剩余记录为INCLUDE并不一致（三重INCLUDE交集仅为记录74），第2阶段漏掉了其收到的人工INCLUDE标签中的大多数，且机器未找回四条多数-INCLUDE记录中的任何一条。领域熟悉度作为INCLUDE分歧的一种解释仍是一个假设，而非一个已测量的变量。 |