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2026-07-16 每日论文

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VideoRAE：通过表示自编码器驯服视频基础模型以进行生成建模 Zhihao Xie 2026-07-15 PDF 视频生成模型通常依赖于3D变分自编码器（3D-VAE）学习的潜在空间。然而，传统3D-VAE主要针对像素级重建进行优化，这限制了其潜在表示所捕获的语义和时空结构。与此同时，V-JEPA 2和VideoMAEv2等视频基础模型（VFM）展现出强大的视频理解能力，但它们的冻结表示能否转化为紧凑、可重建且适合生成的视频潜在表示，仍是一个待探索的问题。我们通过VideoRAE回答了这个问题——这是一种表示自编码器，它利用冻结的视频基础编码器的多尺度层次特征，并通过轻量级1D自注意力投影器进行压缩。VideoRAE既支持扩散Transformer的连续潜在表示，也通过多码本高维量化为自回归模型提供离散标记。在解码阶段，与冻结VFM教师模型的局部-全局表示对齐目标提升了语义保留能力，并实现了无需KL正则化的训练。实验表明，VideoRAE在连续和离散模式下均实现了强重建性能。在UCF-101上，使用AR和DiT生成器分别获得了40和93的类到视频gFVD最优结果，同时收敛速度比竞争的自编码器基线快约5倍。在受控的2B规模文本到视频研究中，用VideoRAE替换LTX-VAE在可比设置下实现了更快的收敛。这些结果验证了冻结VFM表示可作为通用且适合生成的视频潜在表示。模型和代码将在https://zhxie0117.github.io/VideoRAE发布。
利用未标记数据实现可泛化的神经群体解码 Ximeng Mao 2026-07-15 PDF 鲁棒且精准的神经解码器是脑机接口和闭环实验等神经技术的核心组成部分。近期研究表明，在尖峰层级对神经数据进行标记化处理，能够促进多会话预训练并实现最先进的解码性能。然而，当前基于尖峰的模型仅限于监督学习，训练过程依赖带有行为标签的数据集。为解决这一局限，我们提出MOJO（基于掩码自编码器的联合训练框架），这是一种针对尖峰标记化模型的训练框架，通过掩码自编码实现自监督学习与监督学习目标的联合利用。我们在三个尖峰数据集上评估MOJO，涵盖猴子运动皮层在伸手任务中的记录以及小鼠多脑区在视觉与决策任务中的记录，结果显示其性能优于纯监督学习模型。这种提升在有限标签数据训练时尤为显著，特别是在仅需少量新会话标签数据的少样本微调场景中。引入自监督学习还能产生更具可解释性的神经元表征，在无需显式优化的情况下提升脑区分类和尖峰统计预测的性能。我们进一步证明MOJO可泛化至人类言语期间的皮层脑电图数据，其性能持续超越纯监督学习模型，并与专为连续信号设计的神经基础模型表现相当。总体而言，为尖峰标记化模型增强自监督学习可提升标签匮乏场景下的性能，支持跨任务和物种利用无标签数据，同时泛化至其他神经模态。这些结果揭示了训练神经基础模型时实现更灵活、可扩展数据使用的路径。
在Lean中构建Shor算法：针对RSA-2048和P-256的量子攻击的代理形式化 Lei Zhang 2026-07-15 PDF 大型语言模型正越来越多地协助完成高要求的正式定理证明任务，尤其是在基于机器检查库（如Lean）的场景中。智能体系统通过搜索、复用和扩展现有形式化成果来发现新知识，进一步强化了这一过程。在量子计算领域，Shor算法及其变体为Lean形式化提出了一个高难度挑战。在本工作中，我们通过智能体形式化方法在Lean中实现了该算法族的形式化：软件智能体分析文献、编写Lean代码并修复证明，科学主张由人类审核，最终的形式化证明由机器检查。我们的形式化工作为分析两种密码学场景中的量子攻击奠定了数学基础：RSA-2048中的2048位模数，以及256位素数域上的标准化椭圆曲线（P-256）。为支撑这些分析，形式化内容涵盖从量子阶查找算法到模运算和椭圆曲线算术的可逆量子电路。基于[Quantum 5, 433]和[ASIACRYPT 2017, 241–270]，我们分别形式化了RSA-2048和P-256的逻辑资源估算，并提供了经典操作的额外估算。我们预期这些成果将为更广泛的机器检查量子密码分析铺平道路，并标志着向AI辅助量子算法设计与验证迈出一步。
基于最优传输的线性独立成分分析 Ashutosh Jha 2026-07-15 PDF 线性独立成分分析（ICA）从线性混合信号中恢复联合独立的源信号。为实现这一目标，经典ICA算法试图最大化非高斯性，通过信息论与独立性关联的负熵来度量。由于精确的负熵优化难以实现，这些算法依赖代理对比函数（如四阶累积量）和参数化对数似然。我们提出改用平方Wasserstein距离$W_2^2$到标准高斯分布来度量非高斯性。我们证明，当投影恢复独立成分时，标准正态分布与数据线性投影之间的Wasserstein距离达到最大。基于这一发现，我们提出OT-ICA算法，通过梯度优化寻找该投影。模拟数据实验表明，对于不同分布的潜变量，OT-ICA优于基于代理的方法。在脑电图伪影去除和计量经济学价格发现中的应用证实，OT-ICA无需分布假设即可用于实际ICA任务。
从像素到状态：将交互式世界模型重新构想为游戏引擎 Zhen Li 2026-07-15 PDF 构建能够根据玩家行为做出连贯响应的交互式世界，长期以来一直是计算机图形学、游戏和人工智能领域的共同目标。近期视频生成模型提供了一条数据驱动的实现路径——通过预测基于用户行为的未来观测结果，这些模型正逐渐被视为潜在的下一代游戏引擎。然而，实现真正交互式的游戏世界，需要交互结果遵循随游戏状态演变的规则、产生能长期持续的后果，并实现实时运行的生成循环。传统游戏引擎通过循环的动作-状态-观测机制实现这些特性：玩家行为根据预设规则更新显式游戏状态，观测结果则从更新后的状态渲染生成。本文以该循环为组织框架，从四个维度考察交互式游戏世界建模：玩家行为控制、游戏状态动态、状态-观测持续性以及实时交互生成。针对每个维度，我们首先明确交互式游戏世界所需的能力，将现有方法归类为代表性技术族，并讨论各族的优势与权衡。为补充分析，我们为《黑神话：悟空》构建了可扩展数据引擎，采集超过90小时的游戏过程，包含帧对齐的玩家动作、真实游戏状态、视觉观测数据，以及结构化与语义化标注，作为状态感知游戏世界建模的资源。希望本文能清晰呈现该领域的发展现状，推动交互式游戏世界的进步。
VisualRepair：面向视觉软件问题修复的动态工具调用与区域聚焦 Jingyu Xiao 2026-07-15 PDF 随着大语言模型（LLM）的出现，自动程序修复（APR）取得了显著进展。然而，随着现代软件系统日益呈现丰富的图形用户界面，有效利用错误截图中的视觉信息已成为在多模态场景中理解错误并生成精准修复的关键。真实世界的问题报告常包含异构视觉附件，包括UI截图、IDE快照、GIF动图和以文本为主的图像，每种类型都具有独特的视觉模式和领域特定语义，对多模态大语言模型（MLLM）提出了巨大的感知需求。此外，错误截图往往包含大片无信息且与错误无关的区域，这会分散模型注意力并限制补丁多样性。为解决这些问题，我们提出VisualRepair——一个基于MLLM的视觉软件问题修复框架，包含两个核心模块：图像类型感知工具调用（ITTC），该模块对输入图像进行分类并动态调用定制化工具链以实现稳健的视觉理解；以及动态测试时区域聚焦（DTRF），该模块定位多个与错误相关的候选区域，并通过自适应缩放策略进行优化，以改进故障定位并促进多样化补丁生成。在SWE-bench Multimodal基准上的大量实验表明，VisualRepair始终优于现有最先进方法。VisualRepair在测试集和开发集上分别解决了196个和25个实例，比最佳基线分别多出10个和11个实例。这些结果凸显了类型感知视觉理解和区域聚焦定位在自动化视觉软件问题修复中的有效性。
MetaPerch：从元数据中学习构建生物声学基础模型 Mustafa Chasmai 2026-07-15 PDF 生物声学基础模型依赖Xeno-Canto等大规模公民科学平台获取地理和生态多样性数据。近期研究表明，仅通过监督学习即可在大规模数据上训练出最先进的物种检测模型——然而，这些社区驱动数据平台中现成的录音元数据仍存在未被充分利用的潜力。本研究探索将位置、时间等元数据作为辅助监督信号，使模型能够在其学习表征中利用物种-元数据相关性。辅助元数据损失函数提供的额外信息超越了单纯的声音特征，可促进更丰富、更鲁棒的表征生成，从而更好地泛化至物种分布变化和声学域偏移——这些正是真实场景被动声学监测部署中的关键挑战。我们提出MetaPerch新基础模型，在多个具有挑战性的领域实现了强大的物种识别性能，并针对9种不同元数据源对17个生物声学数据集的影响开展了广泛的实证研究。
使用Evo 2探针对宏基因组数据中的生物安全特征进行筛选 Jeremy Guntoro 2026-07-15 PDF 诸如Evo 2等基因组基础模型能够学习丰富的序列表征，但其在生物安全筛查中的价值尚未得到充分探索。我们通过在不微调底层模型的情况下，在冻结的Evo 2第26层激活上训练最小线性探测器和注意力探测器，探究这些表征中可线性获取的生物安全相关信号量。在保留的宏基因组测试集上，探测器对抗微生物耐药性（AMR）表现出强判别能力：线性探测器（均值池化）的区域级ROC-AUC达到0.888，而单头注意力探测器提升至0.977。探测器能解析更细粒度的AMR药物类别亚型，并将其与无关功能基因区分开，进一步证明所学信号并非仅由通用功能基因状态解释。细菌毒力也可解码，但效果较弱（区域级ROC-AUC为0.833）。AMR探测器无需重新训练即可在模拟短读段上保持相当的排序性能，从而在组装计算成本高昂或不可靠的场景中实现组装前的评估。其读段级ROC-AUC达到0.898（均值池化），与全区域均值池化结果相当。在SynGenome中，Evo 1.5生成序列中仅能弱恢复AMR相关提示标签；这些提示衍生标签无法确定生成响应序列的功能。互补的稀疏自编码器分析可恢复可解释的抗性相关特征，但一致性不如监督式探测器。综合而言，这些结果将轻量级嵌入探测器定位为宏基因组生物监测中快速、低成本的首轮检测层，并映射了该方法的优势与当前局限。本研究是BlueDot Impact、Apart Research和Cambridge Biosecurity Hub主办的AIxBio Hackathon 2026的一部分。
基于最小最大理论的似然深度学习散斑回归 Soham Jana 2026-07-15 PDF 散斑噪声是一种乘性噪声，常见于合成孔径雷达、光学相干断层扫描和数字全息等相干成像模态中。尽管深度学习方法在实际应用中已取得最先进的散斑去噪性能，但其基本统计极限仍鲜有探索。与加性噪声模型不同，乘性散斑噪声使得回归函数无法通过条件均值识别，导致传统基于最小二乘的深度学习方法失效。我们研究在同时包含乘性散斑噪声和加性高斯噪声的模型下，使用基于似然的深度神经网络（DNN）估计器对光滑非参数回归函数进行极小极大估计。我们的框架同时适用于低维和稀疏高维特征。我们建立了所提出的DNN估计器估计误差的有限样本上界，并推导了该模型下非参数函数恢复的极小极大下界，证明两者在样本量的对数因子范围内匹配。此外，这些极小极大速率（在对数因子范围内）与仅存在加性高斯噪声的非参数回归速率一致，表明尽管乘性散斑噪声带来挑战，估计的内在难度基本保持不变。数值实验进一步支持了我们基于DNN的去斑方法的一致性，并展示了其有效性。
回溯：重放预测市场以评估大语言模型预测者 Xiao Ye 2026-07-15 PDF 预测模型通过回溯测试进行评估，即回放已解决的事件，并评估系统在结果揭晓前本应给出的概率。对于大语言模型而言，存在两条信息泄露渠道会影响测试结果。具备检索能力的模型能调取事件发生后的报告，将预测任务简化为查表操作；而每个新模型训练数据的时间节点更接近事件发生时间，因此去年模型尚属未来的问题，今年已出现在训练数据中。无论哪种情况，测试名义上评估预测能力，实则衡量记忆能力。我们提出Hindcast方法，通过模拟模型处于选定历史日期$t_0$（此时两个渠道均未产生结果）的状态，同时封堵两条泄露渠道。该方法将已解决的Polymarket预测市场事件与Reddit公共数据的冻结快照进行回放，仅允许模型读取$t_0$之前的帖子，并依据实际结果及$t_0$时刻市场自身价格（即基于相同历史信息的人类预测）对每个预测进行评分。由于每个市场的截止日期独立设定且快照永不更新，评估可随模型改进持续应用于新市场而不会过时。封堵泄露后，检索功能仍对多数模型有助益，但仅限于Reddit在事件发生前已有讨论的领域；若存档仅包含推测性内容，检索反而会降低模型表现。

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WAC缺失通过阶段相关的胆碱能失调改变秀丽隐杆线虫的食物相关行为和生理稳态 Kim, D.-W. 2026-07-16 PDF WAC是一种参与转录调控的染色质相关调节蛋白，在人类遗传学研究中被鉴定为自闭症相关基因。然而，其在调控行为和突触过程中的功能作用仍不完全清楚。我们利用秀丽隐杆线虫研究了wac缺失对食物相关社会行为、生长相关表型和胆碱能通路功能的影响。wac缺陷线虫的食物离开行为显著减少，表明其对食物相关环境线索的行为反应受损，而聚集行为未发生显著改变。PHX2587 wac缺失突变体线虫还表现出体长缩短、咽部泵吸频率降低和寿命缩短，表明存在更广泛的生长和生理损伤。胆碱能通路基因的阶段分析显示阶段特异性转录变化，多个突触前和突触后胆碱能组分（ace-1、cha-1、cho-1、lev-1、lev-10、unc-17、unc-29、unc-38和unc-50）在年轻成虫阶段出现最显著的协同上调。功能RNAi分析进一步发现，编码高亲和力突触前胆碱转运蛋白的cho-1是PHX2587线虫中胆碱能敏感性的基因型特异性修饰因子。重要的是，cho-1 RNAi不仅降低了醛固酮超敏反应，还部分抑制了PHX2587线虫的体长缩短表型并改善了食物离开行为，而在野生型N2中效果有限。这些发现共同支持wac缺失与cho-1相关胆碱能调节之间的功能关系，表明突触前胆碱转运参与了wac缺失引起的特定行为和生理后果。
p70S6激酶对AP2 μ2亚基的磷酸化促进了网格蛋白介导的内吞作用。 Tempes, A. 2026-07-16 PDF 网格蛋白介导的内吞作用（CME）通过质膜上网格蛋白包被的凹陷结构内化细胞表面受体。衔接蛋白复合物AP2将网格蛋白和内吞货物共同招募至这些位点。AP2在闭合的胞质构象与开放的膜结合状态之间循环，高效的CME需要这两种构象及其动态互变。调控这些构象变化的机制（包括AP2的翻译后修饰）尚未完全阐明。本研究发现p70S6激酶可磷酸化AP2的μ2亚基，且丝氨酸45位点（S45）的磷酸化依赖于p70S6K活性。S45-μ2磷酸化缺失会导致转铁蛋白和PDGF受体等经典CME货物的内化效率降低。在秀丽隐杆线虫中，S45-μ2磷酸化缺失产生的表型与AP2功能缺失相比方向相似但强度显著减弱。活细胞成像与计算机动态建模表明，S45-μ2磷酸化影响AP2复合物的构象变化。这些发现揭示了p70S6K依赖性机制对AP2功能的调控作用，进一步证实翻译后修饰在控制CME中的重要性。
JanusX：一个用于可扩展全基因组关联研究和基因组选择的集成高性能平台 Fu, J. 2026-07-16 PDF 随着基因组数据集在样本量和标记密度上的不断扩展，全基因组关联研究（GWAS）和基因组选择（GS）需要工作流程在从基因型矩阵到决策相关输出的整个分析路径中保持统计严谨性、计算高效性和可重复性。本文提出JanusX，一个集成的高性能框架，通过统一数据处理、模型执行和可视化，为GWAS和GS提供简化且用户导向的工作流程。在模拟和真实数据集中，JanusX与既定基准保持高度一致性，同时显著减少运行时间和内存使用。在GWAS中，JanusX在线性混合模型（LMM）推断上比GEMMA实现高达19倍加速，并基于稀疏基因组关系矩阵结合GRAMMAR-Gamma校准实现了额外的LMM推断，缓解了大规模队列中的计算和内存瓶颈。JanusX还在其GWAS模块中提供FarmCPU实现，相比rMVP实现中位数11.4倍运行时间改进，并将峰值内存使用降低84.9%。在GS中，JanusX集成了优化的最佳线性无偏预测（BLUP）后端，自适应选择样本和SNP空间求解器，并纳入预处理共轭梯度（PCG）求解器。该实现高效完成50万个体×50万单核苷酸多态性（SNP）的五折交叉验证，仅需35.1分钟和14.3吉字节（GiB）峰值内存。除BLUP外，JanusX在统一接口下集成贝叶斯和机器学习预测器，并通过紧凑自动调优确保跨模型稳健性能。因此，JanusX能够在一致的分析假设下实现高效位点发现和基因组预测，即使在大规模队列中也是如此。
植物特异性ESCRT-III蛋白分选机制的VPS2.2/HYADE定位于分泌区室，并在拟南芥中细胞分裂平面决定中起必要作用。 Ibl, V. 2026-07-16 PDF 分裂面的定位是细胞发育过程中的关键步骤。动物细胞在中期确定分裂面，而植物细胞则在有丝分裂前做出这一决定，并形成称为早前期带（PPB）的细胞骨架结构。尽管非必需，PPB仍是细胞分裂面最早的标志，并与胞质分裂期间细胞板与母体质膜融合的位置一致。近期研究表明，内吞和外吞作用参与皮层分裂区的重塑。本文发现，在拟南芥Atvps2.2/hyade（hya）突变体中，PPB、成膜体、细胞板和细胞壁均出现错位，该基因是运输所需内体分选复合物（ESCRT）-III的植物特异性组分。我们证实hya-3等位基因的Q71P氨基酸替换消除了与其他ESCRT-III组分的同源和异源聚合。功能型HYA-GFP融合蛋白不定位在ESCRT-III复合物在多囊泡体（MVB）的经典位置，且不存在于拟南芥中布雷菲德菌素A（BFA）和渥曼青霉素（WM）敏感区室。HYA-GFP既不定位早期也不定位晚期内体，而是与分泌区室标记物（如Qc-SNARE蛋白SYP61）及反式高尔基体网络（TGN）来源的分泌型Rab-A3囊泡共定位。此外，HYA-GFP定位于细胞外空间，表明VPS2.2/HYA参与分泌过程。这些结果揭示了ESCRT-III通过分泌途径建立和维持皮层分裂区的新型非经典功能。
社区青少年样本中冷酷无情特质的神经解剖学亚型 Murtha, K. 2026-07-16 PDF 重要性。冷酷无情特质与显著的临床和神经生理异质性相关，可能影响治疗效果。目的。通过弱监督机器学习揭示冷酷无情特质的神经解剖亚型，并评估不同亚型在相关临床、气质和环境因素上的差异。设计、设置与参与者。影像数据来自纵向青少年大脑认知发展研究。参与者基线年龄为9-10岁（平均年龄9.925岁，69.9%为男性），包括222名具有冷酷无情特质的儿童和234名在年龄、性别和收入上匹配的典型发育对照组。主要结果与测量。基于84个感兴趣区域的灰质体积训练弱监督异质性判别分析模型，并通过交叉验证和置换检验测试可重复性。对衍生亚型进行横断面和前瞻性比较，评估相关临床、气质和环境指标以及2年随访时的灰质体积变化。结果。HYDRA模型在冷酷无情特质儿童中揭示了最优的2亚型分类。两个亚型的攻击性水平相当，且均显著高于典型发育对照组。同时，亚型1具有更大的灰质体积、更少的内化症状和更低的逆境暴露水平，而亚型2则以更小的灰质体积、更多的内化症状和更高的逆境暴露为特征。结论与相关性。本研究提供了冷酷无情特质存在神经解剖学上不同亚型的证据，这些亚型具有不同的临床和病因学特征，对诊断和治疗具有启示意义。
一次性体验：迷幻洞见具有独特的强烈、深刻且难以言喻的特性。 Pogliani, A. 2026-07-16 PDF 洞察力通常通过实验室范式进行研究，表现为理解上的突然转变，并伴随典型的"啊哈！"体验。然而，这类范式可能无法完全捕捉到洞察力在自然情境中出现的全部现象学特征。本研究通过一项针对有致幻剂使用经历的成年人（N=73）的受试者内在线实验，比较了四种情境下洞察力的现象学特征：致幻剂体验、日常生活中的洞察、复合远程联想问题以及模糊图像。参与者对每次洞察的强度、惊讶程度、自信度、愉悦感、驱动力、意义感、不可言说性以及感知到的信念变化进行了评分。序数混合效应模型显示，致幻剂引发的洞察在大多数维度上评分高于日常洞察，尤其在强度、意义感、不可言说性和感知到的信念变化方面，而实验室情境下的洞察评分则显著低于两种自然情境。自然情境与实验室情境之间的差异在意义感和感知到的信念变化上最大，而在核心的"啊哈！"特征（如自信度和愉悦感）上差异较小。在自然情境中，意义感是感知到的信念变化的最强预测因子，强度和不可言说性也有额外贡献；在纳入这些现象学维度后，情境本身不再预测感知到的信念变化。这些发现表明，实验室范式能够捕捉洞察力的核心特征，但低估了与个人意义和信念更新相关的维度。此外，研究进一步指出，与洞察相关的信念变化更多取决于洞察的体验方式，而非情境本身。
基于结构的哺乳动物DNA转座体重塑为专性异源二聚体 Mandal, R. 2026-07-16 PDF 真核DNA转座体以含有多个相同转座酶原聚体的核蛋白复合体形式组装。我们解析了超活性小棕蝠piggyBat转座体的结构，发现其采用新月形不对称四聚体结构来连接反向末端重复序列。研究发现，相同的氨基酸序列基序通过不同模式发挥两种DNA结合功能：一种执行链转移，另一种虽无催化活性但能促进突触形成，同时保护转座子免受活性位点引发的自毁性内部切割。基于该组装体的模块化特性，我们通过鉴定抑制同源二聚体形成的突变，并配合阻止非靶向整合的特异性点突变，设计出专性异源二聚体系统。通过向异源二聚体添加两种靶向人类基因组安全港序列的TALE结构域，我们在质粒检测中实现了>98%的靶序列定向整合，验证了异源二聚体转座酶在基因组应用中的可行性。
ALMS1 对中心粒近端结构和稳定性有贡献 De Freitas, S. 2026-07-16 PDF 中心粒是高度有序的微管支架结构，在连续细胞周期中逐步生长和成熟。其分子组织已被广泛表征，但多种组分对中心粒组装、成熟或稳定性的贡献尚未完全阐明。本研究通过超微结构膨胀显微镜和透射电子显微镜发现，Alstrom综合征相关突变蛋白ALMS1对维持中心粒正常结构至关重要。在ALMS1缺失的RPE1细胞中，中心粒长度缩短，微管壁出现缺陷，包括三联体断裂或缺失、B/C微管开放等结构异常。这些结构缺陷在原中心粒组装后出现。研究表明，ALMS1缺失选择性减少近端区域蛋白CCDC77和CEP44，而中央及远端蛋白保持完整。ALMS1还参与招募近端CEP135帽结构，并清除原中心粒基部的δ-微管蛋白/GCP2池。本研究揭示ALMS1是中心粒近端区域的关键组织者，在细胞周期进程中参与中心粒近端重塑与稳定。
澳大利亚新西兰细胞外囊泡学会（ANZSEV）社区调查 Hourigan, L. 2026-07-16 PDF 澳大利亚新西兰细胞外囊泡学会（ANZSEV）于2021年正式成立，是面向细胞外囊泡研究人员的区域性学会。该学会每年举办展示世界级研究的年会，提供本地及国际交流合作机会，积极支持早期职业研究者网络，举办小型研讨会，并为会员提供多种指导机会和奖项。作为近期梳理学会历史项目的配套工作，我们对ANZSEV会员及其更广泛网络开展了一项调查。40人参与了此次调查，结果揭示了ANZSEV群体的构成、兴趣及信念。
类器官揭示生态位特异性机械转导引导的人类皮层模式形成与细胞命运获取 Kingston, A. J. 2026-07-16 PDF 发育中的大脑皮层高度动态的机械环境具有编码神经元分化关键信息的潜力。局部生物物理特性的变化已被证实与神经祖细胞维持到长程轴突导向等过程相关。然而，皮层力学特性是否影响神经发生过程中的细胞组织与特化仍鲜有探索。本研究利用人类皮层发育的三维嵌合类器官模型，选择性破坏核机械传感的关键组件LINC复合体，使细胞与其机械环境解耦。我们发现LINC解耦会以区域特异性方式改变核形态，导致细胞优先从生发区排出并伴随提前分化。被排出的细胞在皮层板中呈现偏向性空间分布，同时伴随中间祖细胞和上层神经元群体的丢失，改变了命运分配。结合单细胞转录组分析，我们揭示了LINC解耦细胞中ERK激活与密度感知受损的特征。进一步研究表明，密度感知异常会导致核膜蛋白emerin的错误定位，并在分化过程中破坏组蛋白标记沉积。综上，我们的发现揭示了复杂组织的动态机械环境如何调控发育过程中的细胞命运与模式形成。

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2020-2025年加纳蛇咬伤中毒的时空模式：一项全国性监测分析 Nyarko, E. 2026-07-16 PDF 蛇咬伤中毒是一种被忽视的热带疾病，对撒哈拉以南非洲农村人口的影响尤为严重。在加纳，关于蛇咬伤风险时空分布的证据仍然有限，这制约了针对性预防措施和资源分配。本研究量化了加纳各地区蛇咬伤风险，识别了持续存在的热点区域及环境驱动因素，并评估了蛇咬伤负担与治疗地理可及性之间的关系。研究分析了加纳地区健康信息管理系统（2020年至2025年）中所有261个地区的月度蛇咬伤病例数据，采用贝叶斯时空模型（包含空间效应、时间随机效应及时空交互作用），并通过集成嵌套拉普拉斯近似法进行拟合。环境协变量（包括降雨量、温度、湿度及归一化植被指数）用于量化与风险的相关性。通过相对风险、超越概率、局部空间关联指标及地理可及性分析，确定了优先干预地区。蛇咬伤风险呈现显著的空间聚集性和时间变异性。持续高风险地区集中在西北省（达菲亚马布西伊萨、东瓦、西瓦、东西萨拉）、萨凡纳省（博莱、贡贾）、东北省（马普鲁古莫阿古杜里）、西北省（东比亚）、博诺省（班达）、奥蒂省（克拉奇恩楚穆鲁）、西部省（东瓦萨）及东部省（恩萨瓦姆阿多阿吉里、北范特阿夸），但风险格局随时间演变。2025年，北范特阿夸成为全国风险最高的地区。湿度与温度与风险增加相关，而降雨量和归一化植被指数无显著影响。高风险地区往往治疗可及性较差，揭示了不平等现象。这项全国首个贝叶斯时空评估为监测、抗蛇毒血清分配及干预措施提供了证据基础，以支持世界卫生组织2030年蛇咬伤减少目标。
单细胞基因程序定义肾细胞癌的亚型特征和转移轨迹。 Madrigal, A. 2026-07-16 PDF 尽管肾细胞癌（RCC）中广泛的细胞异质性与多样化的临床结局相关，但我们对这种多样性的理解仍局限于由克隆模式或经典通路活性驱动的部分。本研究整合了来自原发性和转移性肿瘤以及患者衍生模型的超过85,000个单细胞基因表达谱，涵盖四种RCC亚型（包括常被误诊的罕见透明细胞乳头状肾细胞肿瘤，我们鉴定出CASP14是其高灵敏度、高特异性生物标志物）。我们采用生成式建模框架解析肿瘤内部及跨肿瘤的恶性细胞变异，该框架可校正克隆和拷贝数驱动的表达偏移，定义了59个基因表达程序，将经典通路解构为具有不同活性模式、独特调控因子及差异化临床结局关联的功能亚模块。尽管传统观点认为VHL缺陷型透明细胞RCC处于组成性假性缺氧状态，但我们发现与不良预后相关的缺氧诱导因子2（HIF2）驱动程序存在显著的瘤内变异性。我们还发现早期空间组织化的完全上皮-间充质转化（EMT）程序激活、上皮特性丧失及蛋白质翻译程序上调是转移进展的关键特征。最后，捕捉细胞去分化和翻译活性的转移特征可识别与不良临床结局相关的原发性肿瘤。该资源体系建立了恶性细胞异质性解析框架，完善了RCC亚型分类，并定义了驱动转移进展的转录程序。
第8周已知信息：预测六个月的GLP-1结果 Erly, B. 2026-07-16 PDF 背景。使用GLP-1药物的患者体重减轻幅度差异很大，而大多数已发表的预测模型仅纳入完成六个月治疗的患者。这种设计排除了所有提前退出治疗的患者，而这部分人群占队列的大多数。我们构建了一个工具，纳入了提前退出的患者，并在第8周就诊时提供有用的预测，而临床决策正是在此时做出的。方法。从参与美国远程医疗GLP-1项目的237,800名成年人开始，我们要求患者有记录的第8周体重、经续药确认的剂量以及报告的种族信息，最终得到22,538人的分析队列。我们回答了三个问题：患者可能的六个月体重减轻幅度及置信度；六个月前退出治疗的概率；以及体重减轻何时进入平台期。针对第一个问题，我们基于第8周体重减轻百分比的三次项及16个协变量进行拟合，使用第10和第90百分位的分位数回归区间作为预测区间，并检验了分数逻辑回归和等渗再校准作为替代方法。针对第二个问题，我们拟合了逻辑回归模型，并与梯度提升进行了比较。针对第三个问题，我们在至少有四次体重观测值的患者中拟合了每个患者的指数轨迹。我们以2024年7月1日之前的入组数据训练模型，以之后的数据进行测试，将完成治疗者的结果与已发表的随机对照试验进行比较，并检验了第8周锚点与第2、4、6、8、10、12、16和20周测量值的对比。结果。完成治疗者的六个月平均体重减轻在司美格鲁肽组为11.7%，在替尔泊肽组为14.1%，与STEP-1和SURMOUNT-1试验结果一致。六个月退出治疗率为66%。预测模型的测试R²为0.65，平均绝对误差为2.76个百分点。校准效果良好：整体校准偏差为-0.52个百分点，校准斜率为0.96。80%分位数回归区间覆盖了76%的测试患者；95%区间覆盖了93%。退出治疗模型的测试AUC为0.79，而梯度提升模型为0.74。坚持治疗患者的中位平台期时间为387天，在较低BMI三分位组中更长。第8周锚点的R²为0.65，而更早周数的R²为0.48至0.61，更晚周数的R²为0.67至0.91。我们选择第8周是因为80%的缓慢应答者在该次就诊或之前达到滴定后决策点。20个亚组中有两个的预测准确性降低；另外两个因数据稀疏无法验证。结论。观察到的第8周体重减轻是六个月结果的最强预测因子。该模型的准确性（R²=0.65，MAE 2.76个百分点）适用于校准预期和识别需要做出滴定后决策的患者，但尚不足以单独驱动该决策。退出治疗在第8周可预测，AUC为0.79。坚持治疗的患者中位平台期时间为387天。第8周是滴定基本完成、准确性达到有用范围且滴定后决策仍可执行的最早就诊时间点；更晚的锚点预测效果更好，但此时大多数患者的决策已经做出。该模型经过了时间（内部）验证，但尚未进行外部验证，且由于基于单一平台开发，应被视为再校准目标而非可直接部署到其他环境的工具。该工具已作为公共网络计算器发布，以支持共同决策，但其准确性尚不足以单独驱动不可逆的临床决策。该工具是预后性的，而非治疗性的；治疗效果估计在配套研究中讨论。
MedSafe-Dx (v0)：面向临床诊断决策支持中评估大语言模型的安全聚焦基准 Van Oyen, C. 2026-07-16 PDF MedSafe-Dx (v0) 引入了一个以安全为核心的基准测试，用于评估大型语言模型在临床诊断决策支持中的表现，该测试基于DDx Plus数据集的一个筛选子集（N=250）。MedSafe-Dx评估三个维度：升级敏感性、避免虚假安慰以及不确定性校准。模型需提供排序后的鉴别诊断（ICD-10）、升级决策（紧急 vs. 常规）以及置信度标记。我们采用分诊成功率（TSR）作为主要排序指标，定义为安全病例数减去不必要的升级数，再除以总病例数（N）。安全通过率（SPR）作为次要指标保留，用于隔离三种严重失败模式：遗漏升级、过度自信的错误诊断以及不安全的安慰。对十二个前沿大型语言模型进行了评估。GPT-5 Chat取得了最高的TSR（72.4%），其次是Llama 4 Maverick和Grok 4.20（均为71.2%，并列）。Llama 4 Maverick是顶级梯队中唯一的开放权重模型，其SPR达到队列第二高（96.8%）。推理增强架构（o3-pro、DeepSeek R1）未带来系统性的TSR优势。SPR最高的模型通过系统性过度升级来实现这一指标，以牺牲分诊效用为代价提升安全分数。SPR与TSR的反比关系表明安全性与准确性之间存在明显权衡。在临床环境中，这意味着需优先考虑安全性而非效率，因此仍需进一步研究才能将大型语言模型成功整合到临床工作流程中。
原发性醛固酮增多症的醛固酮抑制试验与亚型预测 Payanundana, M. 2026-07-16 PDF 目的：评估以下方法预测原发性醛固酮增多症（PA）亚型的准确性：1）2025年内分泌学会PA指南推荐的将侧化概率分为“高”、“中”、“低”三级的分类法；2）坐位盐水抑制试验（SST）结果。设计：多中心回顾性队列研究。方法：本研究纳入泰国曼谷两家大型三级医疗中心的319例PA患者，所有患者均接受亚型评估（无论概率分级如何），评估指南推荐的概率框架对PA亚型的区分能力。PA亚型通过肾上腺静脉采血（AVS）和/或肾上腺切除术后结局（依据PASO标准）确定。结果：多数PA患者被归类为“中等”侧化概率（75%），但无论基于指南的概率分类如何，最终61%-78%的患者被证实为单侧PA。无论概率分层或最终亚型如何，绝大多数SST结果呈阳性：单侧PA患者中89.3%和双侧PA患者中80.6%的SST阳性。在指南特别强调SST价值的“中等”侧化概率患者中，SST检测单侧PA的敏感性为89.4%，特异性为22.0%，假阳性率为78.0%，假阴性率为10.6%。此外，单侧与双侧PA患者的SST后醛固酮浓度几乎完全重叠。结论：指南推荐的概率框架及SST应用缺乏预测PA亚型的区分能力。
全球癌症更新计划（CUP Global）中，将软饮料消费与特定部位癌症风险关联起来的生物学过程 Fontvieille, E. 2026-07-16 PDF 本综述在全球癌症更新计划（CUP Global）框架下，评估了软饮料消费与多种癌症风险之间的生物学通路。软饮料消费已被证实与多种癌症风险增加相关，而葡萄糖或胰岛素失调被认为是潜在的作用机制。我们采用三阶段研究框架：第一阶段，结合专家知识与网络文本挖掘工具，确定胰岛素敏感性是连接软饮料（含糖或人工甜味剂）消费与癌症风险的关键生物学过程，并将葡萄糖相关及胰岛素相关生物标志物作为潜在中间表型；第二阶段，通过定向PubMed检索，识别研究软饮料消费与这些中间表型（IPs）之间关联，以及这些IPs与成人多种癌症风险之间关联的研究；第三阶段，由癌症机制专家委员会（MEC）评估证据强度。MEC认为，支持葡萄糖或胰岛素相关过程作为含糖或人工甜味剂饮料消费与所评估多种癌症风险之间潜在机制通路的证据较弱。
孤独感轨迹与社区稳定性对HIV感染女性抑郁、酒精与物质使用及生活质量的影响关联 Barr, P. B. 2026-07-16 PDF 社会关系是健康的重要社会决定因素。孤独感，即个体实际关系与期望关系之间的感知差距，已成为社会关系影响健康的重要机制。与其他与健康相关的个体内层面因素类似，孤独感受到更广泛的社会和结构性因素影响，包括个体所在社区社会环境特征。尽管已有研究识别出社区层面影响孤独感和心理健康的保护因素与风险因素，但以往研究往往仅关注自我报告的社区环境感知。此外，很少有研究在独立于社区社会经济条件的情况下，考察社区社会环境的其他方面，例如社区稳定性（即社区中长期或短期居民构成的稳定性）。在本分析中，我们探讨了2014-2019年期间纳入MACS/WIHS联合队列研究（MWCCS）的HIV感染女性（WWH）中孤独感与社区稳定性的纵向模式（2019年样本量=1,394），以检验孤独感和社区稳定性的变化轨迹是否与抑郁症状、非处方药物使用、过去一年大麻使用、每周饮酒量以及多个生活质量领域相关。基线孤独感（Beta值=0.24-0.54）和孤独感随时间的变化（Beta值=0.11-0.26）与每个结局均相关，但孤独感随时间变化与每周饮酒量之间的关联（Beta=0.13，p=4.14x10-2）在多重比较校正后未持续存在。基线社区稳定性与过去一年大麻使用（Beta=0.26，p=1.00x10-2）、抑郁症状（Beta=-0.12，p=1.54x10-3）和总体自评健康（Beta=-0.08，p=2.05x10-2）相关。社区稳定性随时间的变化与任何结局均无关联。社区稳定性调节了孤独感变化与总体健康感知之间的关联。我们的结果表明，总体孤独感和孤独感随时间的变化对WWH当前心理健康具有影响，而社区稳定性的变化则未显示此类影响。
在呼吸系统队列研究中应用自动提取的常规临床数据的可行性：SPHN-SPAC示范项目。 Romero, F. 2026-07-16 PDF 目的 评估通过瑞士个性化健康网络（SPHN）自动提取临床数据，以补充或替代瑞士儿科气道队列（SPAC）中手动提取临床数据的可行性。材料与方法 我们研究了2017-2023年间在两家瑞士儿童医院入组的1,075名SPAC参与者。通过SPHN以资源描述框架格式从电子健康记录中提取临床数据，转换为以就诊为中心的数据集，并与手动提取的SPAC临床数据以及家长通过随访问卷报告的急诊就诊和住院情况进行比较。通过识别数据获取中的挑战评估可行性，并评估数据量、完整性和数据集间的一致性。结果 经过24个月，我们从两家医院获得了可供分析的SPHN衍生数据集。SPHN衍生数据捕获的肺科门诊就诊量多于手动提取（A医院：1,963次 vs 1,049次；B医院：2,343次 vs 1,010次），并识别出未完成随访问卷儿童的临床事件。各变量在不同医院和就诊中的完整性存在差异，反映了本地临床记录实践的差异。SPHN衍生数据与手动提取数据在结构化临床变量（包括肺功能测量）上显示出高度一致性（一致性相关系数>0.99）。自我报告的急诊就诊和住院情况与SPHN衍生数据在绝对一致性上较高，但中等一致性。讨论与结论 与手动提取相比，常规临床数据的自动提取增加了纵向信息的完整性，表明SPHN衍生数据可补充队列研究中的手动数据收集。然而，临床记录实践的异质性以及将提取数据协调转换为可供分析的研究数据集所需的大量工作，仍限制了其更广泛的应用。
氟喹诺酮类药物预防自发性细菌性腹膜炎的真实世界实践：来自印度北部一家三级医疗中心的纵向研究 Malviya, A. 2026-07-16 PDF 背景与目标 自发性细菌性腹膜炎（SBP）是肝硬化腹水患者的致命并发症，一年和两年死亡率分别超过70%和80%。氟喹诺酮类药物预防是SBP预防的基石。印度三级医疗中心关于处方实践和临床结局的真实世界纵向数据较为匮乏。本研究旨在评估印度北部某三级学术中心SBP患者的氟喹诺酮处方模式、指南依从性及六个月临床结局。方法 本研究为AIIMS Rishikesh一项15个月分析性纵向研究的预设亚分析。连续纳入因SBP入院并启动氟喹诺酮预防治疗的成人患者（年龄≥18岁），随访六个月。处方实践与EASL和AASLD推荐标准进行比较。主要结局为指南导向处方率。次要结局包括出院时临床治愈率、六个月治愈率、复发率、方案调整率、药物不良反应率及治疗依从性。分类变量采用Fisher精确检验或卡方检验（SPSS）进行比较。结果 共纳入48例SBP患者（平均年龄44.75±11.94岁；男性占85.4%）。所有患者（100%）均接受指南导向的氟喹诺酮预防治疗。诺氟沙星400mg每日一次为主流方案（85.4%），其次为左氧氟沙星（10.4%）和莫西沙星（4.2%）。出院时治愈率为85.4%。六个月时，64.6%患者维持持续治愈，22.9%出现复发。方案调整率为22.9%，最常见为抗菌药物替换。恶心为唯一药物不良反应（4.8%）。治疗依从性为73.8%。无患者接受治疗药物监测。结论 AIIMS Rishikesh的SBP预防性氟喹诺酮处方完全符合标准指南。尽管完全依从，22.9%的复发率和频繁的方案调整凸显了长期氟喹诺酮预防的局限性，可能反映新出现的喹诺酮耐药性。加强抗菌药物管理对维持印度三级医疗环境中预防效果至关重要。
相同结果，不同价格：复方替尔泊肽与品牌替尔泊肽 Erly, B. 2026-07-16 PDF 背景。复方替尔泊肽被大规模处方作为品牌药Mounjaro和Zepbound的廉价替代品，但成本论证几乎总是通过将一种复方价格与一种品牌标价进行对比来构建。这种框架忽略了真正决定答案的问题：比患者能获得的哪种品牌价格更便宜。品牌替尔泊肽目前以显著不同的层级销售，即保险共付额（通常每月25-150美元）、LillyDirect自付计划（每月299-449美元）和零售现金价（每月1000-1200美元）。复方是否省钱完全取决于患者面对的是哪种价格。第二个未解决的问题是两种制剂是否能产生相当的效果，因为观察到的差异可能反映的是保险选择、基线特征和依从性而非药物本身。方法。我们对Mochi Health远程医疗项目中替尔泊肽使用者进行回顾性队列研究，根据其补充处方的制剂分类为仅品牌药（Mounjaro/Zepbound；6238人）、仅复方药（71683人）或转换者（4996人）；转换者被排除在制剂对比之外。在具有记录六周体重观察数据的单制剂患者中，分析队列为7271人（869人品牌药，6402人复方药）。主要结局是六周体重下降百分比；次要结局是>=10%应答率。我们使用1:1最近邻倾向评分匹配（0.25 SD卡尺），仅基于基线协变量——年龄、性别、基线BMI、基线体重、合并糖尿病、高血压、血脂异常、既往减重手术史和自报保险覆盖——故意排除治疗后变量如依从性和项目时长，这些是制剂效应的中介变量。我们预设平均减重的等效界值为+/-2个百分点，并使用双单侧检验（TOST）检验等效性。有向无环图（DAG）使识别假设明确；二甲双胍使用无法可靠确定，被视为未测量的混杂因素。成本比较报告了在五种品牌价格情景下复方相对于品牌的节省或溢价：零售标价、LillyDirect自付计划（两个剂量层级）和保险共付额（典型和低端）。这是成本比较（在证明效果相似下的成本最小化），而非正式成本效果分析：我们未计算ICER、QALY或贴现。结果。品牌药和复方药患者在调整前结局相似（平均减重11.7% vs 11.5%；>=10%应答率60.9% vs 58.8%）。两组间最大基线差异是保险覆盖（品牌药患者更可能拥有保险；标准化均值差0.67），匹配后平衡至0.01。1:1匹配后（718对，所有|SMD| < 0.04），平均减重为11.4% vs 11.4%（差异+0.08个百分点，95% CI -0.70至+0.80），>=10%应答率为59.3% vs 57.2%（差异+2.1个百分点，95% CI -3.1至+7.1）。两种制剂在预设+/-2个百分点界值内统计等效（TOST p < 0.001）。成本取决于品牌情景：复方相对于零售标价六周节省6000美元，相对于LillyDirect维持剂量（5-15 mg）自付计划节省1494美元，相对于低剂量（2.5 mg）LillyDirect处方节省594美元，而在典型保险共付额（每月150美元）下比品牌药贵300美元，在更低共付额下更贵（节省在每月200美元以下转为负值）。结论。品牌药和复方替尔泊肽在六周效果上在预设+/-2个百分点界值内统计等效，因此两者之间的选择本质上是成本决策——且成本优势真实存在，但取决于患者能获得的品牌价格。相对于零售标价优势显著，相对于LillyDirect自付计划或低保险共付额则缩小至零或逆转。因此，复方是否为个体患者的低成本选择，取决于该患者面临的价格层级。